More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3440 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_0616  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  67.78 
 
 
580 aa  717    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3440  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  100 
 
 
605 aa  1218    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.845304  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5808  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  43.83 
 
 
552 aa  411  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5443  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase; 3-(3-hydroxy-phenyl)propionate hydroxylase FAD/NAD(P)-binding  45.28 
 
 
547 aa  403  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.728003  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0371  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.74 
 
 
554 aa  341  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3278  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.74 
 
 
554 aa  341  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0146118  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0378  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.74 
 
 
554 aa  341  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0214512  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0411  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.74 
 
 
554 aa  341  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0836277  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0422  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.55 
 
 
554 aa  340  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3259  monooxygenase FAD-binding protein  37.55 
 
 
554 aa  339  8e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.257115  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00305  hypothetical protein  37.55 
 
 
554 aa  339  9.999999999999999e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00161031  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00301  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.55 
 
 
554 aa  339  9.999999999999999e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00155662  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1979  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.88 
 
 
555 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623617  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3790  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  36.67 
 
 
568 aa  327  5e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829218 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3786  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  36.75 
 
 
573 aa  326  8.000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3859  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  36.75 
 
 
573 aa  326  8.000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4245  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  36.64 
 
 
569 aa  323  6e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.525028  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2401  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  36.23 
 
 
569 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6487  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.69 
 
 
542 aa  321  3e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6722  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.69 
 
 
542 aa  321  3e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.792631  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4535  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  34.32 
 
 
615 aa  312  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6461  monooxygenase FAD-binding  40.15 
 
 
537 aa  312  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0929587  normal  0.112964 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1344  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  36.89 
 
 
561 aa  306  6e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.430096  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4747  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.62 
 
 
574 aa  305  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649883  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2329  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  34 
 
 
622 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4404  monooxygenase FAD-binding  39.17 
 
 
565 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984317  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0270  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  34.12 
 
 
618 aa  286  5e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.385681  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5086  monooxygenase, FAD-binding  38.94 
 
 
570 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5774  monooxygenase, FAD-binding  38.94 
 
 
570 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.750601 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2893  monooxygenase FAD-binding  34.44 
 
 
564 aa  283  9e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3513  monooxygenase FAD-binding  33.76 
 
 
587 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0593  monooxygenase, FAD-binding  32.94 
 
 
520 aa  273  9e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5805  monooxygenase FAD-binding  38.57 
 
 
547 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000018754  hitchhiker  0.00132409 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0990  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  35.98 
 
 
507 aa  253  7e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0928  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.62 
 
 
509 aa  250  6e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4304  monooxygenase, FAD-binding  33.95 
 
 
520 aa  243  6e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0161  monooxygenase, FAD-binding  33.21 
 
 
530 aa  233  9e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5585  putative FAD-binding monooxygenase  33.59 
 
 
514 aa  231  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.187805 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1541  monooxygenase FAD-binding  34.34 
 
 
497 aa  229  1e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1569  monooxygenase, FAD-binding  32.1 
 
 
525 aa  221  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7425  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  32.47 
 
 
503 aa  221  3e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1268  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  33.33 
 
 
530 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3413  monooxygenase, FAD-binding  37.7 
 
 
503 aa  217  5.9999999999999996e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0619698  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4834  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  34.15 
 
 
597 aa  207  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447643  decreased coverage  0.00803206 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4906  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  33.49 
 
 
511 aa  190  7e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4483  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.4 
 
 
555 aa  190  7e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0725  monooxygenase FAD-binding protein  33.33 
 
 
509 aa  188  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.812372  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5524  monooxygenase FAD-binding  30.55 
 
 
518 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000879135 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4947  monooxygenase FAD-binding protein  32.94 
 
 
481 aa  182  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2814  monooxygenase FAD-binding protein  30.38 
 
 
537 aa  177  4e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0957884  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4203  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.88 
 
 
555 aa  176  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3290  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  34.58 
 
 
523 aa  174  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5380  FAD-dependent oxidoreductase  30.2 
 
 
583 aa  172  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189642  normal  0.0809664 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3000  FAD-dependent oxidoreductase  30.46 
 
 
551 aa  172  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.296257 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5321  FAD-dependent oxidoreductase  28.84 
 
 
561 aa  168  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124532  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2727  FAD-dependent oxidoreductase  30.95 
 
 
570 aa  167  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00614764  normal  0.0524365 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1226  FAD-dependent oxidoreductase  29.08 
 
 
588 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4781  monooxygenase FAD-binding  31.79 
 
 
572 aa  165  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0875  FAD-dependent oxidoreductase  28.57 
 
 
581 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.474503  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4123  FAD-dependent oxidoreductase  27.59 
 
 
577 aa  162  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000743874  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4192  FAD-dependent oxidoreductase  28.3 
 
 
564 aa  155  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4661  FAD-dependent oxidoreductase  30.59 
 
 
559 aa  151  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.135002 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4529  FAD-dependent oxidoreductase  30.59 
 
 
559 aa  151  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.609398  normal  0.38599 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4008  monooxygenase FAD-binding  30.07 
 
 
578 aa  150  7e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.245549  normal  0.525361 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0850  FAD-dependent oxidoreductase  30.33 
 
 
555 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0192309  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1304  FAD-dependent oxidoreductase  28.6 
 
 
535 aa  149  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26478  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  33.71 
 
 
414 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7215  FAD-dependent oxidoreductase  29.83 
 
 
569 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3815  FAD-dependent oxidoreductase  27.24 
 
 
541 aa  147  5e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.433248  normal  0.294357 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  33.33 
 
 
537 aa  147  6e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0428  FAD-dependent oxidoreductase  29.66 
 
 
569 aa  146  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00420765  normal  0.845447 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0579  FAD-dependent oxidoreductase  30.68 
 
 
558 aa  146  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1196  FAD-dependent oxidoreductase  28.49 
 
 
554 aa  145  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0776  FAD-dependent oxidoreductase  31.17 
 
 
524 aa  143  7e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.790337  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3183  monooxygenase FAD-binding  34.3 
 
 
511 aa  144  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  33.71 
 
 
511 aa  143  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4218  FAD-dependent oxidoreductase  28.04 
 
 
579 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0623  monooxygenase FAD-binding  27.95 
 
 
533 aa  140  7.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0334  FAD-dependent oxidoreductase  28.76 
 
 
553 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0817  FAD-dependent oxidoreductase  28.76 
 
 
553 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0291  FAD-dependent oxidoreductase  29.67 
 
 
545 aa  140  8.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339644  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0924  FAD-dependent oxidoreductase  27.51 
 
 
541 aa  139  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0786  FAD-dependent oxidoreductase  28.94 
 
 
553 aa  139  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0715  FAD-dependent oxidoreductase  28.65 
 
 
558 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.520934  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5698  monooxygenase FAD-binding  31.81 
 
 
531 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0767168 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4588  monooxygenase FAD-binding  30.94 
 
 
555 aa  137  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0698  FAD-dependent oxidoreductase  28.65 
 
 
555 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3910  FAD-dependent oxidoreductase  29.46 
 
 
550 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0339  FAD-dependent oxidoreductase  29.1 
 
 
584 aa  136  9e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  33.89 
 
 
501 aa  135  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4050  FAD-dependent oxidoreductase  29.61 
 
 
570 aa  134  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000538899  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  29.2 
 
 
388 aa  134  6e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  29.83 
 
 
546 aa  134  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4632  monooxygenase, FAD-binding  29.98 
 
 
557 aa  134  6e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3718  monooxygenase, FAD-binding  26.29 
 
 
585 aa  133  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3217  monooxygenase FAD-binding protein  32.24 
 
 
488 aa  132  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0996184  hitchhiker  0.0000000987139 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18980  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  29.56 
 
 
554 aa  132  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.099299  normal  0.679289 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2454  regulatory proteins, IclR  26.12 
 
 
575 aa  132  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.283629  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2566  FAD-dependent oxidoreductase  28.98 
 
 
555 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  32.02 
 
 
529 aa  130  6e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>