More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4947 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4947  monooxygenase FAD-binding protein  100 
 
 
481 aa  906    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0725  monooxygenase FAD-binding protein  51.42 
 
 
509 aa  398  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.812372  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2814  monooxygenase FAD-binding protein  46.67 
 
 
537 aa  364  2e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0957884  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4906  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  45.99 
 
 
511 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0928  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  40.53 
 
 
509 aa  259  1e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7425  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  36.07 
 
 
503 aa  251  3e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5585  putative FAD-binding monooxygenase  35.5 
 
 
514 aa  238  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.187805 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0990  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  36.36 
 
 
507 aa  238  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1541  monooxygenase FAD-binding  37.55 
 
 
497 aa  236  7e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1268  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  36.82 
 
 
530 aa  232  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0422  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.89 
 
 
554 aa  228  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00305  hypothetical protein  32.09 
 
 
554 aa  227  3e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00161031  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00301  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  32.09 
 
 
554 aa  227  3e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00155662  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5808  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.24 
 
 
552 aa  227  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0378  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.69 
 
 
554 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0214512  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3259  monooxygenase FAD-binding protein  31.89 
 
 
554 aa  226  6e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.257115  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5805  monooxygenase FAD-binding  40.37 
 
 
547 aa  226  7e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000018754  hitchhiker  0.00132409 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2401  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  33.86 
 
 
569 aa  224  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0371  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.3 
 
 
554 aa  223  6e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0411  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.3 
 
 
554 aa  223  6e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0836277  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3278  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.3 
 
 
554 aa  223  6e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0146118  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1569  monooxygenase, FAD-binding  35.98 
 
 
525 aa  223  6e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3790  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  33.91 
 
 
568 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829218 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3413  monooxygenase, FAD-binding  36.03 
 
 
503 aa  222  9.999999999999999e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0619698  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3513  monooxygenase FAD-binding  32.96 
 
 
587 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3786  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  33.91 
 
 
573 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3859  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  33.91 
 
 
573 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4747  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  34.71 
 
 
574 aa  220  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649883  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6487  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  34.05 
 
 
542 aa  220  6e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6722  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  34.05 
 
 
542 aa  220  6e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.792631  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6461  monooxygenase FAD-binding  38.16 
 
 
537 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0929587  normal  0.112964 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4203  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.77 
 
 
555 aa  214  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0593  monooxygenase, FAD-binding  34.46 
 
 
520 aa  213  7e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2329  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  35.75 
 
 
622 aa  213  9e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4834  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.04 
 
 
597 aa  212  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447643  decreased coverage  0.00803206 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5524  monooxygenase FAD-binding  33.6 
 
 
518 aa  211  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000879135 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4483  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  33.27 
 
 
555 aa  207  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4245  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  32.48 
 
 
569 aa  207  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.525028  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5086  monooxygenase, FAD-binding  37.71 
 
 
570 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5774  monooxygenase, FAD-binding  37.71 
 
 
570 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.750601 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1979  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.36 
 
 
555 aa  206  8e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623617  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5443  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase; 3-(3-hydroxy-phenyl)propionate hydroxylase FAD/NAD(P)-binding  35.54 
 
 
547 aa  204  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.728003  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4404  monooxygenase FAD-binding  39.01 
 
 
565 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984317  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3440  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  33.98 
 
 
605 aa  204  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.845304  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0616  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  32.83 
 
 
580 aa  202  8e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0161  monooxygenase, FAD-binding  35.73 
 
 
530 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0270  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  34.72 
 
 
618 aa  199  7.999999999999999e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.385681  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4535  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  33.41 
 
 
615 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3290  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  36.91 
 
 
523 aa  197  5.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1344  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  32.02 
 
 
561 aa  186  5e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.430096  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4304  monooxygenase, FAD-binding  32.69 
 
 
520 aa  186  7e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2893  monooxygenase FAD-binding  30.63 
 
 
564 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1323  FAD-dependent oxidoreductase  30.78 
 
 
545 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4529  FAD-dependent oxidoreductase  29.82 
 
 
559 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.609398  normal  0.38599 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4661  FAD-dependent oxidoreductase  29.82 
 
 
559 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.135002 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1304  FAD-dependent oxidoreductase  29.49 
 
 
535 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26478  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0428  FAD-dependent oxidoreductase  30.61 
 
 
569 aa  138  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00420765  normal  0.845447 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0724  monooxygenase, FAD-binding  32.11 
 
 
461 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  36.49 
 
 
481 aa  134  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2566  FAD-dependent oxidoreductase  30.9 
 
 
555 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0924  FAD-dependent oxidoreductase  27.74 
 
 
541 aa  131  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2013  monooxygenase FAD-binding  36.21 
 
 
475 aa  130  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0339  FAD-dependent oxidoreductase  30.73 
 
 
584 aa  130  6e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7215  FAD-dependent oxidoreductase  29.67 
 
 
569 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1498  monooxygenase, FAD-binding  32.61 
 
 
477 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.106253  normal  0.474209 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04210  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  32.33 
 
 
510 aa  128  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0905  monooxygenase FAD-binding  32.67 
 
 
550 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.147157 
 
 
-
 
NC_003296  RS01747  FAD-dependent oxidoreductase  30.34 
 
 
563 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.178537  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4431  monooxygenase FAD-binding protein  32.88 
 
 
474 aa  127  7e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.412484 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0893  monooxygenase, FAD-binding  32.67 
 
 
550 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207082  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  32.8 
 
 
535 aa  125  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18980  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  32.51 
 
 
554 aa  125  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.099299  normal  0.679289 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2727  FAD-dependent oxidoreductase  29.19 
 
 
570 aa  125  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00614764  normal  0.0524365 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0291  FAD-dependent oxidoreductase  31.39 
 
 
545 aa  125  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339644  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1515  monooxygenase, FAD-binding  32.55 
 
 
478 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497595  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2748  monooxygenase FAD-binding protein  32.94 
 
 
489 aa  124  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1395  FAD-dependent oxidoreductase  31.12 
 
 
553 aa  124  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  34.94 
 
 
501 aa  124  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2691  monooxygenase, FAD-binding  33.59 
 
 
473 aa  124  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2661  monooxygenase, FAD-binding protein  33.59 
 
 
473 aa  124  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2706  monooxygenase, FAD-binding  33.59 
 
 
473 aa  124  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3216  FAD-dependent oxidoreductase  31.12 
 
 
553 aa  123  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3231  FAD-dependent oxidoreductase  31.12 
 
 
553 aa  123  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29830  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  28.9 
 
 
543 aa  123  9e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.832343 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3910  FAD-dependent oxidoreductase  29.3 
 
 
550 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  32.25 
 
 
511 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3177  FAD-dependent oxidoreductase  31.12 
 
 
553 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4133  pentachlorophenol monooxygenase  34.99 
 
 
479 aa  122  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0715  FAD-dependent oxidoreductase  31.56 
 
 
558 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.520934  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2368  monooxygenase FAD-binding  30.54 
 
 
549 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128155  normal  0.778169 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0334  FAD-dependent oxidoreductase  31.12 
 
 
553 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0817  FAD-dependent oxidoreductase  31.12 
 
 
553 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0786  FAD-dependent oxidoreductase  31.12 
 
 
553 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1919  monooxygenase FAD-binding protein  30.07 
 
 
547 aa  121  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.136855  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4218  FAD-dependent oxidoreductase  30.36 
 
 
579 aa  121  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4669  hypothetical protein  31.61 
 
 
515 aa  121  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679977  normal  0.120633 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1226  FAD-dependent oxidoreductase  29.32 
 
 
588 aa  121  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0698  FAD-dependent oxidoreductase  31.56 
 
 
555 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4123  FAD-dependent oxidoreductase  29.63 
 
 
577 aa  120  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000743874  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0988  monooxygenase FAD-binding  30.96 
 
 
548 aa  120  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622027  normal  0.120457 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>