More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3259 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_0422  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  99.28 
 
 		 554 aa  1138    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00301  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  99.64 
 
 		 554 aa  1142    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00155662  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3259  monooxygenase FAD-binding protein  100 
 
 		 554 aa  1145    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.257115  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3278  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  98.74 
 
 		 554 aa  1135    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0146118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1979  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  68.54 
 
 		 555 aa  798    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623617  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0371  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  98.92 
 
 		 554 aa  1137    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00305  hypothetical protein  99.64 
 
 		 554 aa  1142    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00161031  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0378  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  99.1 
 
 		 554 aa  1138    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0214512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0411  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  98.92 
 
 		 554 aa  1137    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0836277  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2329  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  53.68 
 
 		 622 aa  625  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4535  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  52.9 
 
 		 615 aa  621  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0270  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  53.18 
 
 		 618 aa  621  1e-176  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.385681  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2401  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  47.54 
 
 		 569 aa  513  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3786  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  47.55 
 
 		 573 aa  508  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3859  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  47.55 
 
 		 573 aa  508  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3790  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  47.55 
 
 		 568 aa  508  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829218 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4245  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  47.42 
 
 		 569 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.525028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1344  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  47.13 
 
 		 561 aa  504  1e-141  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.430096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4747  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  46.95 
 
 		 574 aa  496  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6487  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  43.69 
 
 		 542 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6722  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  43.69 
 
 		 542 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.792631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2893  monooxygenase FAD-binding  40.84 
 
 		 564 aa  414  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5808  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.52 
 
 		 552 aa  344  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3440  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.55 
 
 		 605 aa  339  7e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.845304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0616  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  38.51 
 
 		 580 aa  334  2e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5443  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase; 3-(3-hydroxy-phenyl)propionate hydroxylase FAD/NAD(P)-binding  37.38 
 
 		 547 aa  328  1.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.728003  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3513  monooxygenase FAD-binding  34.67 
 
 		 587 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0593  monooxygenase, FAD-binding  32.95 
 
 		 520 aa  269  8e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5805  monooxygenase FAD-binding  31.57 
 
 		 547 aa  248  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000018754  hitchhiker  0.00132409 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5086  monooxygenase, FAD-binding  33.18 
 
 		 570 aa  247  4e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5774  monooxygenase, FAD-binding  33.18 
 
 		 570 aa  247  4e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.750601 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4404  monooxygenase FAD-binding  33.41 
 
 		 565 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6461  monooxygenase FAD-binding  32.78 
 
 		 537 aa  233  8.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0929587  normal  0.112964 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7425  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  32.4 
 
 		 503 aa  230  6e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4304  monooxygenase, FAD-binding  30.55 
 
 		 520 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1268  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.5 
 
 		 530 aa  226  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1569  monooxygenase, FAD-binding  29.96 
 
 		 525 aa  224  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0928  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  34.08 
 
 		 509 aa  222  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0161  monooxygenase, FAD-binding  30.73 
 
 		 530 aa  217  5e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5585  putative FAD-binding monooxygenase  30.96 
 
 		 514 aa  212  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.187805 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4947  monooxygenase FAD-binding protein  31.33 
 
 		 481 aa  209  9e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0990  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.06 
 
 		 507 aa  207  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0725  monooxygenase FAD-binding protein  29.25 
 
 		 509 aa  204  4e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.812372  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1541  monooxygenase FAD-binding  32.52 
 
 		 497 aa  201  3.9999999999999996e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4483  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.13 
 
 		 555 aa  200  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4834  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.89 
 
 		 597 aa  193  6e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447643  decreased coverage  0.00803206 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5524  monooxygenase FAD-binding  28.49 
 
 		 518 aa  189  9e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000879135 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2814  monooxygenase FAD-binding protein  30.73 
 
 		 537 aa  189  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0957884  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3290  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.86 
 
 		 523 aa  186  8e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4203  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.98 
 
 		 555 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4906  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  26.2 
 
 		 511 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3413  monooxygenase, FAD-binding  31.1 
 
 		 503 aa  171  4e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0619698  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2727  FAD-dependent oxidoreductase  27.66 
 
 		 570 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00614764  normal  0.0524365 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4123  FAD-dependent oxidoreductase  30.47 
 
 		 577 aa  161  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000743874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0924  FAD-dependent oxidoreductase  27.39 
 
 		 541 aa  154  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5380  FAD-dependent oxidoreductase  26.67 
 
 		 583 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189642  normal  0.0809664 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9228  hypothetical protein  30.46 
 
 		 504 aa  152  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.187294  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0875  FAD-dependent oxidoreductase  29.69 
 
 		 581 aa  152  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.474503  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1226  FAD-dependent oxidoreductase  29.79 
 
 		 588 aa  150  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4192  FAD-dependent oxidoreductase  27.66 
 
 		 564 aa  150  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  31.96 
 
 		 537 aa  150  7e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4781  monooxygenase FAD-binding  27.78 
 
 		 572 aa  149  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  29.47 
 
 		 535 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2324  monooxygenase FAD-binding  28.61 
 
 		 547 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.261518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  34.68 
 
 		 506 aa  149  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  31.96 
 
 		 506 aa  148  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0903  FAD-dependent oxidoreductase  29.63 
 
 		 540 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0776  FAD-dependent oxidoreductase  30.53 
 
 		 524 aa  144  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.790337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4133  pentachlorophenol monooxygenase  34.4 
 
 		 479 aa  143  7e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5321  FAD-dependent oxidoreductase  31.54 
 
 		 561 aa  143  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124532  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1860  hypothetical protein  28.46 
 
 		 498 aa  143  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.600833 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4661  FAD-dependent oxidoreductase  30.55 
 
 		 559 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.135002 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4529  FAD-dependent oxidoreductase  30.55 
 
 		 559 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.609398  normal  0.38599 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2512  monooxygenase FAD-binding  29.55 
 
 		 544 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  27.7 
 
 		 546 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0850  FAD-dependent oxidoreductase  27.79 
 
 		 555 aa  138  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0192309  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  31.01 
 
 		 475 aa  139  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0291  FAD-dependent oxidoreductase  29.54 
 
 		 545 aa  139  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339644  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4050  FAD-dependent oxidoreductase  27.24 
 
 		 570 aa  137  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000538899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4008  monooxygenase FAD-binding  25.99 
 
 		 578 aa  137  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.245549  normal  0.525361 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  33.24 
 
 		 529 aa  137  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1656  hypothetical protein  33.42 
 
 		 508 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.652016  normal  0.325297 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0623  monooxygenase FAD-binding  31.75 
 
 		 533 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1323  FAD-dependent oxidoreductase  24.21 
 
 		 545 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  31.62 
 
 		 481 aa  134  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  30.08 
 
 		 537 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  30.08 
 
 		 537 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2377  hypothetical protein  27.27 
 
 		 553 aa  134  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.879652  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1015  FAD-dependent oxidoreductase  28.53 
 
 		 540 aa  134  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.18031  normal  0.166528 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1940  monooxygenase, FAD-binding  30.75 
 
 		 489 aa  134  6e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1850  hypothetical protein  30.92 
 
 		 497 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  30.89 
 
 		 537 aa  133  9e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3183  monooxygenase FAD-binding  31.99 
 
 		 511 aa  133  9e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5156  FAD-dependent oxidoreductase  26.03 
 
 		 535 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328253  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1658  hypothetical protein  28.86 
 
 		 502 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2111  monooxygenase, FAD-binding  29.86 
 
 		 511 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.0054618  normal  0.499354 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3910  FAD-dependent oxidoreductase  29.43 
 
 		 550 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4320  monooxygenase FAD-binding  29.04 
 
 		 522 aa  131  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3000  FAD-dependent oxidoreductase  27.08 
 
 		 551 aa  131  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.296257 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0962  putative monooxygenase, FAD-binding  30.36 
 
 		 574 aa  131  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0576419  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>