More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2814 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2814  monooxygenase FAD-binding protein  100 
 
 
537 aa  1071    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0957884  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0725  monooxygenase FAD-binding protein  56.13 
 
 
509 aa  525  1e-148  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.812372  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4906  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  53.68 
 
 
511 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4947  monooxygenase FAD-binding protein  46.19 
 
 
481 aa  339  7e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0928  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.45 
 
 
509 aa  253  5.000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7425  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  33.88 
 
 
503 aa  251  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0990  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  34.77 
 
 
507 aa  239  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1541  monooxygenase FAD-binding  35.57 
 
 
497 aa  231  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5585  putative FAD-binding monooxygenase  34.31 
 
 
514 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.187805 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5524  monooxygenase FAD-binding  32.19 
 
 
518 aa  210  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000879135 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1569  monooxygenase, FAD-binding  32.15 
 
 
525 aa  207  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5805  monooxygenase FAD-binding  36.94 
 
 
547 aa  206  8e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000018754  hitchhiker  0.00132409 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3413  monooxygenase, FAD-binding  32.68 
 
 
503 aa  206  9e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0619698  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5808  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.29 
 
 
552 aa  205  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5086  monooxygenase, FAD-binding  37.18 
 
 
570 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4304  monooxygenase, FAD-binding  32.25 
 
 
520 aa  204  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5774  monooxygenase, FAD-binding  37.18 
 
 
570 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.750601 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4203  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  34.17 
 
 
555 aa  203  7e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5443  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase; 3-(3-hydroxy-phenyl)propionate hydroxylase FAD/NAD(P)-binding  36.36 
 
 
547 aa  201  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.728003  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0161  monooxygenase, FAD-binding  32.11 
 
 
530 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4404  monooxygenase FAD-binding  36.62 
 
 
565 aa  200  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984317  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0593  monooxygenase, FAD-binding  31.19 
 
 
520 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6487  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.45 
 
 
542 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1268  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  39.07 
 
 
530 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6722  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.45 
 
 
542 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.792631  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4483  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.34 
 
 
555 aa  193  6e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3259  monooxygenase FAD-binding protein  30.73 
 
 
554 aa  189  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.257115  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00301  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.73 
 
 
554 aa  188  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00155662  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00305  hypothetical protein  30.73 
 
 
554 aa  188  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00161031  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0422  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.73 
 
 
554 aa  187  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0371  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.24 
 
 
554 aa  187  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0411  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.24 
 
 
554 aa  187  3e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0836277  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3278  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.24 
 
 
554 aa  187  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0146118  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0616  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  35.83 
 
 
580 aa  187  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0378  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.24 
 
 
554 aa  187  5e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0214512  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4535  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  32.92 
 
 
615 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1344  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  33.92 
 
 
561 aa  182  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.430096  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1979  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.23 
 
 
555 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623617  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2401  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  33.58 
 
 
569 aa  179  8e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2329  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  32.14 
 
 
622 aa  179  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3440  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.38 
 
 
605 aa  177  4e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.845304  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4834  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  34.57 
 
 
597 aa  175  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447643  decreased coverage  0.00803206 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2893  monooxygenase FAD-binding  33.57 
 
 
564 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0270  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.54 
 
 
618 aa  172  9e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.385681  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3513  monooxygenase FAD-binding  32.14 
 
 
587 aa  172  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3786  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  34.01 
 
 
573 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3859  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  34.01 
 
 
573 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3790  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  34.74 
 
 
568 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6461  monooxygenase FAD-binding  35.58 
 
 
537 aa  166  8e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0929587  normal  0.112964 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4747  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  32.35 
 
 
574 aa  166  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649883  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4245  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  32.14 
 
 
569 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.525028  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3290  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  40.37 
 
 
523 aa  154  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1544  monooxygenase, FAD-binding protein  32.32 
 
 
478 aa  141  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.585572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1567  monooxygenase, FAD-binding  32.32 
 
 
478 aa  141  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1515  monooxygenase, FAD-binding  32.12 
 
 
478 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497595  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2661  monooxygenase, FAD-binding protein  28.96 
 
 
473 aa  133  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2691  monooxygenase, FAD-binding  28.96 
 
 
473 aa  133  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2706  monooxygenase, FAD-binding  28.96 
 
 
473 aa  133  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3750  monooxygenase, FAD-binding  30.69 
 
 
511 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0581872  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2991  hypothetical protein  41.54 
 
 
228 aa  130  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.748678  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1323  FAD-dependent oxidoreductase  28 
 
 
545 aa  130  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4192  FAD-dependent oxidoreductase  26.29 
 
 
564 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10582  FAD binding monooxygenase, putative (JCVI)  28.28 
 
 
566 aa  128  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.832072  normal  0.150999 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  29.3 
 
 
501 aa  129  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3079  monooxygenase FAD-binding protein  29.07 
 
 
503 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.0830218 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4123  FAD-dependent oxidoreductase  26.73 
 
 
577 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000743874  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1304  FAD-dependent oxidoreductase  27.27 
 
 
535 aa  128  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26478  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  31.25 
 
 
511 aa  126  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2727  FAD-dependent oxidoreductase  29.24 
 
 
570 aa  125  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00614764  normal  0.0524365 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0875  FAD-dependent oxidoreductase  26.85 
 
 
581 aa  124  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.474503  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3894  monooxygenase FAD-binding  29.37 
 
 
540 aa  124  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0436183  normal  0.0134982 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0550  monooxygenase, FAD-binding  30.83 
 
 
548 aa  123  9e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732263  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1029  monooxygenase, FAD-binding  30.83 
 
 
548 aa  123  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2748  monooxygenase FAD-binding protein  28.84 
 
 
489 aa  123  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1919  monooxygenase FAD-binding protein  30.38 
 
 
547 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.136855  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0724  monooxygenase, FAD-binding  29.34 
 
 
461 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0924  FAD-dependent oxidoreductase  27.62 
 
 
541 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5043  monooxygenase, FAD-binding  26.78 
 
 
505 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483306  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4781  monooxygenase FAD-binding  28.95 
 
 
572 aa  119  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6800  monooxygenase FAD-binding  31.27 
 
 
518 aa  118  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220979  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1196  FAD-dependent oxidoreductase  29.77 
 
 
554 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2460  monooxygenase FAD-binding  30.08 
 
 
595 aa  117  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0428  FAD-dependent oxidoreductase  28.32 
 
 
569 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00420765  normal  0.845447 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2227  monooxygenase FAD-binding  31.06 
 
 
552 aa  117  7.999999999999999e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465072  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0988  monooxygenase FAD-binding  30.4 
 
 
548 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622027  normal  0.120457 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1395  FAD-dependent oxidoreductase  29.02 
 
 
553 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4133  pentachlorophenol monooxygenase  28.93 
 
 
479 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2512  monooxygenase FAD-binding  25.97 
 
 
544 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7215  FAD-dependent oxidoreductase  26.39 
 
 
569 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3231  FAD-dependent oxidoreductase  29.46 
 
 
553 aa  115  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0404  monooxygenase FAD-binding protein  30.89 
 
 
496 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3216  FAD-dependent oxidoreductase  29.46 
 
 
553 aa  115  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  32.12 
 
 
493 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1463  monooxygenase FAD-binding  27.56 
 
 
598 aa  114  5e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3177  FAD-dependent oxidoreductase  29.46 
 
 
553 aa  114  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4142  monooxygenase, FAD-binding  30.56 
 
 
546 aa  114  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372966  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1620  pentachlorophenol 4-monooxygenase; PcpB  30.85 
 
 
548 aa  114  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168334  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  26.27 
 
 
475 aa  113  9e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  28.05 
 
 
537 aa  113  9e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4050  FAD-dependent oxidoreductase  28.53 
 
 
570 aa  113  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000538899  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>