More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0875 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4192  FAD-dependent oxidoreductase  71.35 
 
 		 564 aa  817    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4123  FAD-dependent oxidoreductase  85.89 
 
 		 577 aa  1019    Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000743874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2727  FAD-dependent oxidoreductase  70.35 
 
 		 570 aa  820    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00614764  normal  0.0524365 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1226  FAD-dependent oxidoreductase  61.71 
 
 		 588 aa  684    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0875  FAD-dependent oxidoreductase  100 
 
 		 581 aa  1177    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.474503  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5380  FAD-dependent oxidoreductase  62.52 
 
 		 583 aa  697    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189642  normal  0.0809664 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4781  monooxygenase FAD-binding  54.69 
 
 		 572 aa  563  1.0000000000000001e-159  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3000  FAD-dependent oxidoreductase  52.33 
 
 		 551 aa  543  1e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.296257 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5321  FAD-dependent oxidoreductase  51.78 
 
 		 561 aa  521  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124532  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4632  monooxygenase, FAD-binding  49.04 
 
 		 557 aa  479  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4008  monooxygenase FAD-binding  44.46 
 
 		 578 aa  429  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.245549  normal  0.525361 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3526  monooxygenase, FAD-binding  47.25 
 
 		 586 aa  418  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.120911 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0428  FAD-dependent oxidoreductase  40.6 
 
 		 569 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00420765  normal  0.845447 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0291  FAD-dependent oxidoreductase  41.27 
 
 		 545 aa  402  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339644  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7215  FAD-dependent oxidoreductase  40.32 
 
 		 569 aa  404  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4050  FAD-dependent oxidoreductase  40.65 
 
 		 570 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000538899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1304  FAD-dependent oxidoreductase  37.79 
 
 		 535 aa  387  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4218  FAD-dependent oxidoreductase  40.04 
 
 		 579 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0339  FAD-dependent oxidoreductase  39.89 
 
 		 584 aa  382  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0850  FAD-dependent oxidoreductase  39.53 
 
 		 555 aa  373  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0192309  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0579  FAD-dependent oxidoreductase  39.67 
 
 		 558 aa  375  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4661  FAD-dependent oxidoreductase  39.36 
 
 		 559 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.135002 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4529  FAD-dependent oxidoreductase  39.36 
 
 		 559 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.609398  normal  0.38599 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4300  FAD-dependent oxidoreductase  41.04 
 
 		 578 aa  364  2e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3910  FAD-dependent oxidoreductase  40.65 
 
 		 550 aa  364  3e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0715  FAD-dependent oxidoreductase  40.22 
 
 		 558 aa  364  3e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.520934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0698  FAD-dependent oxidoreductase  40.4 
 
 		 555 aa  363  6e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0924  FAD-dependent oxidoreductase  39.43 
 
 		 541 aa  362  7.0000000000000005e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1323  FAD-dependent oxidoreductase  37.08 
 
 		 545 aa  362  9e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0334  FAD-dependent oxidoreductase  40.92 
 
 		 553 aa  360  5e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0817  FAD-dependent oxidoreductase  40.92 
 
 		 553 aa  360  5e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0786  FAD-dependent oxidoreductase  40.92 
 
 		 553 aa  359  9e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4535  FAD-dependent oxidoreductase  39.09 
 
 		 563 aa  358  1.9999999999999998e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000237964  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01747  FAD-dependent oxidoreductase  40.74 
 
 		 563 aa  355  1e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.178537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0903  FAD-dependent oxidoreductase  37.92 
 
 		 540 aa  353  7e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1395  FAD-dependent oxidoreductase  38.24 
 
 		 553 aa  352  1e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2566  FAD-dependent oxidoreductase  39.11 
 
 		 555 aa  351  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3177  FAD-dependent oxidoreductase  39.15 
 
 		 553 aa  350  5e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3231  FAD-dependent oxidoreductase  38.97 
 
 		 553 aa  349  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3216  FAD-dependent oxidoreductase  38.97 
 
 		 553 aa  349  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1196  FAD-dependent oxidoreductase  39.63 
 
 		 554 aa  347  3e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1924  FAD-dependent oxidoreductase  39.3 
 
 		 553 aa  345  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.421754  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2059  FAD-dependent oxidoreductase  39.3 
 
 		 553 aa  345  2e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0853  FAD-dependent oxidoreductase  39.3 
 
 		 553 aa  345  2e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2685  FAD-dependent oxidoreductase  39.3 
 
 		 553 aa  345  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0563  FAD-dependent oxidoreductase  37.04 
 
 		 544 aa  330  3e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1015  FAD-dependent oxidoreductase  37.94 
 
 		 540 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.18031  normal  0.166528 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0776  FAD-dependent oxidoreductase  41.3 
 
 		 524 aa  327  3e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.790337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0888  FAD-dependent oxidoreductase  38.06 
 
 		 535 aa  324  3e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0885397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1432  FAD-dependent oxidoreductase  38.7 
 
 		 546 aa  323  8e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.886265  normal  0.829223 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5156  FAD-dependent oxidoreductase  36.84 
 
 		 535 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328253  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2624  FAD-dependent oxidoreductase  37.76 
 
 		 535 aa  317  3e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.596702 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3815  FAD-dependent oxidoreductase  35.42 
 
 		 541 aa  301  2e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.433248  normal  0.294357 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3422  monooxygenase, FAD-binding  39.76 
 
 		 550 aa  295  1e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.448007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3718  monooxygenase, FAD-binding  36.61 
 
 		 585 aa  272  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1919  monooxygenase FAD-binding protein  33.94 
 
 		 547 aa  257  3e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.136855  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18980  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  34.3 
 
 		 554 aa  247  4e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.099299  normal  0.679289 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1867  monooxygenase FAD-binding protein  35.88 
 
 		 594 aa  230  6e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0887  monooxygenase FAD-binding  90.24 
 
 		 294 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.228672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0814  monooxygenase FAD-binding  33.52 
 
 		 525 aa  218  2.9999999999999998e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0653  monooxygenase, FAD-binding  34.96 
 
 		 484 aa  201  3.9999999999999996e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3777  monooxygenase FAD-binding protein  32.43 
 
 		 504 aa  197  6e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.598965  hitchhiker  0.00382559 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  30.19 
 
 		 537 aa  182  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3440  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.57 
 
 		 605 aa  163  8.000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.845304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2311  monooxygenase FAD-binding protein  31.2 
 
 		 408 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2290  monooxygenase FAD-binding protein  31.28 
 
 		 407 aa  158  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0623  monooxygenase FAD-binding  31.67 
 
 		 533 aa  157  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4747  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.21 
 
 		 574 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5808  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.81 
 
 		 552 aa  153  8.999999999999999e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00305  hypothetical protein  29.69 
 
 		 554 aa  152  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00161031  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00301  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.69 
 
 		 554 aa  152  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00155662  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3259  monooxygenase FAD-binding protein  29.69 
 
 		 554 aa  152  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.257115  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6034  monooxygenase FAD-binding protein  31.37 
 
 		 489 aa  152  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.829011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0378  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.43 
 
 		 554 aa  150  8e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0214512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0422  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.43 
 
 		 554 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3786  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.04 
 
 		 573 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3859  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.04 
 
 		 573 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3278  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.17 
 
 		 554 aa  148  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0146118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0371  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.17 
 
 		 554 aa  148  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0411  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.17 
 
 		 554 aa  148  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0836277  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3790  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.04 
 
 		 568 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829218 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  30.04 
 
 		 501 aa  147  6e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  31.96 
 
 		 529 aa  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6461  monooxygenase FAD-binding  31.77 
 
 		 537 aa  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0929587  normal  0.112964 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  29.46 
 
 		 546 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2401  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  26.62 
 
 		 569 aa  145  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0616  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  26.43 
 
 		 580 aa  144  4e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2329  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.08 
 
 		 622 aa  143  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5443  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase; 3-(3-hydroxy-phenyl)propionate hydroxylase FAD/NAD(P)-binding  28.42 
 
 		 547 aa  142  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.728003  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1979  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.81 
 
 		 555 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623617  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5043  monooxygenase, FAD-binding  29.91 
 
 		 505 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  30.19 
 
 		 511 aa  139  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2377  hypothetical protein  31.27 
 
 		 553 aa  137  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.879652  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1569  monooxygenase, FAD-binding  27.19 
 
 		 525 aa  137  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3513  monooxygenase FAD-binding  29.91 
 
 		 587 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0297  monooxygenase FAD-binding protein  35.67 
 
 		 406 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000836883 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3038  monooxygenase, FAD-binding  31.69 
 
 		 409 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6487  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  26.1 
 
 		 542 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6722  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  26.1 
 
 		 542 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.792631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4245  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.04 
 
 		 569 aa  133  9e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.525028  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>