More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0814 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0814  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 
525 aa  1033    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1919  monooxygenase FAD-binding protein  49.03 
 
 
547 aa  421  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.136855  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18980  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  47.99 
 
 
554 aa  414  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.099299  normal  0.679289 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1867  monooxygenase FAD-binding protein  51.64 
 
 
594 aa  384  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167984  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3777  monooxygenase FAD-binding protein  45.45 
 
 
504 aa  367  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.598965  hitchhiker  0.00382559 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0653  monooxygenase, FAD-binding  46.64 
 
 
484 aa  367  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1323  FAD-dependent oxidoreductase  37.87 
 
 
545 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0579  FAD-dependent oxidoreductase  38.9 
 
 
558 aa  265  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0903  FAD-dependent oxidoreductase  37.55 
 
 
540 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5156  FAD-dependent oxidoreductase  37.4 
 
 
535 aa  257  4e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328253  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0924  FAD-dependent oxidoreductase  35.26 
 
 
541 aa  256  5e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1196  FAD-dependent oxidoreductase  38.11 
 
 
554 aa  250  5e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0291  FAD-dependent oxidoreductase  36.67 
 
 
545 aa  250  5e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339644  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1395  FAD-dependent oxidoreductase  37.38 
 
 
553 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0888  FAD-dependent oxidoreductase  35.8 
 
 
535 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0885397  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0850  FAD-dependent oxidoreductase  38.25 
 
 
555 aa  243  5e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0192309  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1015  FAD-dependent oxidoreductase  36.36 
 
 
540 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.18031  normal  0.166528 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3216  FAD-dependent oxidoreductase  37.31 
 
 
553 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3177  FAD-dependent oxidoreductase  37.5 
 
 
553 aa  242  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3231  FAD-dependent oxidoreductase  37.31 
 
 
553 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0428  FAD-dependent oxidoreductase  38.42 
 
 
569 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00420765  normal  0.845447 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1304  FAD-dependent oxidoreductase  36 
 
 
535 aa  239  6.999999999999999e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26478  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2566  FAD-dependent oxidoreductase  38.85 
 
 
555 aa  238  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4218  FAD-dependent oxidoreductase  35.18 
 
 
579 aa  238  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3910  FAD-dependent oxidoreductase  38.46 
 
 
550 aa  236  6e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2685  FAD-dependent oxidoreductase  36.94 
 
 
553 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2059  FAD-dependent oxidoreductase  36.94 
 
 
553 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0853  FAD-dependent oxidoreductase  36.94 
 
 
553 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4535  FAD-dependent oxidoreductase  34.43 
 
 
563 aa  235  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000237964  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1924  FAD-dependent oxidoreductase  36.94 
 
 
553 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.421754  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7215  FAD-dependent oxidoreductase  37.68 
 
 
569 aa  233  6e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0776  FAD-dependent oxidoreductase  37.41 
 
 
524 aa  232  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.790337  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4050  FAD-dependent oxidoreductase  33.89 
 
 
570 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000538899  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0715  FAD-dependent oxidoreductase  39.15 
 
 
558 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.520934  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4529  FAD-dependent oxidoreductase  34.87 
 
 
559 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.609398  normal  0.38599 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4661  FAD-dependent oxidoreductase  34.87 
 
 
559 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.135002 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0698  FAD-dependent oxidoreductase  39.15 
 
 
555 aa  230  4e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0339  FAD-dependent oxidoreductase  38.69 
 
 
584 aa  229  8e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01747  FAD-dependent oxidoreductase  37.98 
 
 
563 aa  228  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.178537  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0563  FAD-dependent oxidoreductase  33.66 
 
 
544 aa  228  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0334  FAD-dependent oxidoreductase  36.15 
 
 
553 aa  227  4e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0817  FAD-dependent oxidoreductase  36.15 
 
 
553 aa  227  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0786  FAD-dependent oxidoreductase  38.5 
 
 
553 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4123  FAD-dependent oxidoreductase  34.53 
 
 
577 aa  226  8e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000743874  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2624  FAD-dependent oxidoreductase  36.17 
 
 
535 aa  222  9.999999999999999e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.596702 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2727  FAD-dependent oxidoreductase  36.68 
 
 
570 aa  220  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00614764  normal  0.0524365 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3815  FAD-dependent oxidoreductase  35.11 
 
 
541 aa  220  6e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.433248  normal  0.294357 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4300  FAD-dependent oxidoreductase  34.72 
 
 
578 aa  219  1e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1226  FAD-dependent oxidoreductase  37.82 
 
 
588 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0875  FAD-dependent oxidoreductase  33.52 
 
 
581 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.474503  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3000  FAD-dependent oxidoreductase  36.25 
 
 
551 aa  216  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.296257 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4781  monooxygenase FAD-binding  38.13 
 
 
572 aa  214  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5105  monooxygenase FAD-binding  37.44 
 
 
550 aa  214  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1432  FAD-dependent oxidoreductase  38.56 
 
 
546 aa  213  4.9999999999999996e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.886265  normal  0.829223 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3526  monooxygenase, FAD-binding  34.67 
 
 
586 aa  213  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.120911 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5380  FAD-dependent oxidoreductase  37.06 
 
 
583 aa  211  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189642  normal  0.0809664 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4008  monooxygenase FAD-binding  36.63 
 
 
578 aa  209  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.245549  normal  0.525361 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3422  monooxygenase, FAD-binding  37.02 
 
 
550 aa  209  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.448007  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4192  FAD-dependent oxidoreductase  35.58 
 
 
564 aa  207  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3718  monooxygenase, FAD-binding  35.73 
 
 
585 aa  206  9e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5321  FAD-dependent oxidoreductase  35.25 
 
 
561 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124532  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4632  monooxygenase, FAD-binding  31.79 
 
 
557 aa  189  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  32.85 
 
 
511 aa  145  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5009  monooxygenase, FAD-binding  30.74 
 
 
506 aa  143  7e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  29.69 
 
 
537 aa  135  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0779  monooxygenase, FAD-binding  30.35 
 
 
500 aa  134  5e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.813515  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  30.69 
 
 
414 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0724  monooxygenase, FAD-binding  32.87 
 
 
461 aa  130  8.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6034  monooxygenase FAD-binding protein  32.8 
 
 
489 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.829011  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5808  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.63 
 
 
552 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2324  monooxygenase FAD-binding  31.08 
 
 
547 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.261518  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6800  monooxygenase FAD-binding  31.32 
 
 
518 aa  128  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220979  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4799  monooxygenase FAD-binding  30.61 
 
 
477 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3790  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.05 
 
 
568 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829218 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2329  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.91 
 
 
622 aa  124  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  32.52 
 
 
506 aa  124  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  33.99 
 
 
529 aa  124  6e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3440  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.52 
 
 
605 aa  123  9e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.845304  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0616  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.32 
 
 
580 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3750  monooxygenase, FAD-binding  31.48 
 
 
511 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0581872  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  33.43 
 
 
546 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6487  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.79 
 
 
542 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2311  monooxygenase FAD-binding protein  29.71 
 
 
408 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  29.9 
 
 
501 aa  122  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6722  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.79 
 
 
542 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.792631  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3038  monooxygenase, FAD-binding  29.84 
 
 
409 aa  121  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3786  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.78 
 
 
573 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3859  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.78 
 
 
573 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  28.98 
 
 
388 aa  120  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2290  monooxygenase FAD-binding protein  29.52 
 
 
407 aa  120  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  31.38 
 
 
535 aa  120  7.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1569  monooxygenase, FAD-binding  27.71 
 
 
525 aa  120  9e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5698  monooxygenase FAD-binding  29.61 
 
 
531 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0767168 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0143  monooxygenase FAD-binding protein  30.77 
 
 
968 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0131  2,4-dichlorophenol 6-monooxygenase  30.92 
 
 
556 aa  118  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0320392  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10582  FAD binding monooxygenase, putative (JCVI)  29.09 
 
 
566 aa  118  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.832072  normal  0.150999 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0422  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.83 
 
 
554 aa  118  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00301  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.83 
 
 
554 aa  118  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00155662  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3183  monooxygenase FAD-binding  31.44 
 
 
511 aa  118  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00305  hypothetical protein  29.83 
 
 
554 aa  118  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00161031  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>