More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4535 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_3177  FAD-dependent oxidoreductase  64.4 
 
 
553 aa  695    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4661  FAD-dependent oxidoreductase  64.17 
 
 
559 aa  671    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.135002 
 
 
-
 
NC_003296  RS01747  FAD-dependent oxidoreductase  65.54 
 
 
563 aa  649    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.178537  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0786  FAD-dependent oxidoreductase  65.65 
 
 
553 aa  691    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2059  FAD-dependent oxidoreductase  64.22 
 
 
553 aa  691    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0853  FAD-dependent oxidoreductase  64.22 
 
 
553 aa  691    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4218  FAD-dependent oxidoreductase  67.02 
 
 
579 aa  740    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3231  FAD-dependent oxidoreductase  64.4 
 
 
553 aa  695    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4050  FAD-dependent oxidoreductase  61.97 
 
 
570 aa  707    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000538899  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3910  FAD-dependent oxidoreductase  65.52 
 
 
550 aa  689    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1395  FAD-dependent oxidoreductase  64.65 
 
 
553 aa  699    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0579  FAD-dependent oxidoreductase  68.78 
 
 
558 aa  749    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3216  FAD-dependent oxidoreductase  64.4 
 
 
553 aa  695    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4535  FAD-dependent oxidoreductase  100 
 
 
563 aa  1156    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000237964  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0428  FAD-dependent oxidoreductase  61.8 
 
 
569 aa  708    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00420765  normal  0.845447 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0339  FAD-dependent oxidoreductase  61.97 
 
 
584 aa  692    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0334  FAD-dependent oxidoreductase  65.65 
 
 
553 aa  694    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7215  FAD-dependent oxidoreductase  61.75 
 
 
569 aa  692    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0291  FAD-dependent oxidoreductase  73.91 
 
 
545 aa  830    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339644  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1924  FAD-dependent oxidoreductase  64.22 
 
 
553 aa  691    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.421754  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0698  FAD-dependent oxidoreductase  64.14 
 
 
555 aa  671    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0817  FAD-dependent oxidoreductase  65.65 
 
 
553 aa  694    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4529  FAD-dependent oxidoreductase  64.17 
 
 
559 aa  671    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.609398  normal  0.38599 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2566  FAD-dependent oxidoreductase  65.23 
 
 
555 aa  689    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0715  FAD-dependent oxidoreductase  64.21 
 
 
558 aa  675    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.520934  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4300  FAD-dependent oxidoreductase  72.46 
 
 
578 aa  766    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2685  FAD-dependent oxidoreductase  64.22 
 
 
553 aa  691    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1304  FAD-dependent oxidoreductase  57.06 
 
 
535 aa  618  1e-176  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26478  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0850  FAD-dependent oxidoreductase  55.39 
 
 
555 aa  593  1e-168  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0192309  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1323  FAD-dependent oxidoreductase  54.31 
 
 
545 aa  591  1e-168  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0924  FAD-dependent oxidoreductase  54.81 
 
 
541 aa  576  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0903  FAD-dependent oxidoreductase  53.85 
 
 
540 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2624  FAD-dependent oxidoreductase  55.15 
 
 
535 aa  552  1e-156  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.596702 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5156  FAD-dependent oxidoreductase  55.16 
 
 
535 aa  544  1e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328253  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0563  FAD-dependent oxidoreductase  54.16 
 
 
544 aa  544  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1015  FAD-dependent oxidoreductase  54.61 
 
 
540 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.18031  normal  0.166528 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1196  FAD-dependent oxidoreductase  53.63 
 
 
554 aa  525  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0888  FAD-dependent oxidoreductase  53.2 
 
 
535 aa  522  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0885397  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3815  FAD-dependent oxidoreductase  52.45 
 
 
541 aa  511  1e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.433248  normal  0.294357 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0776  FAD-dependent oxidoreductase  51.25 
 
 
524 aa  493  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.790337  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1432  FAD-dependent oxidoreductase  50.82 
 
 
546 aa  486  1e-136  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.886265  normal  0.829223 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4123  FAD-dependent oxidoreductase  40.35 
 
 
577 aa  395  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000743874  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2727  FAD-dependent oxidoreductase  41.56 
 
 
570 aa  398  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00614764  normal  0.0524365 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4192  FAD-dependent oxidoreductase  40.74 
 
 
564 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0875  FAD-dependent oxidoreductase  39.09 
 
 
581 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.474503  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5380  FAD-dependent oxidoreductase  39.32 
 
 
583 aa  371  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189642  normal  0.0809664 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3718  monooxygenase, FAD-binding  40.8 
 
 
585 aa  368  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1226  FAD-dependent oxidoreductase  38.97 
 
 
588 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5105  monooxygenase FAD-binding  46.55 
 
 
550 aa  362  8e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4008  monooxygenase FAD-binding  38.62 
 
 
578 aa  362  1e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.245549  normal  0.525361 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5321  FAD-dependent oxidoreductase  39.85 
 
 
561 aa  354  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124532  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3422  monooxygenase, FAD-binding  37.95 
 
 
550 aa  355  2e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.448007  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3000  FAD-dependent oxidoreductase  37.8 
 
 
551 aa  352  1e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.296257 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3526  monooxygenase, FAD-binding  42.1 
 
 
586 aa  348  2e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.120911 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4781  monooxygenase FAD-binding  36.61 
 
 
572 aa  330  6e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18980  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  38.61 
 
 
554 aa  311  1e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.099299  normal  0.679289 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4632  monooxygenase, FAD-binding  36.36 
 
 
557 aa  306  7e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1919  monooxygenase FAD-binding protein  36.68 
 
 
547 aa  279  9e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.136855  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1867  monooxygenase FAD-binding protein  36.65 
 
 
594 aa  278  1e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167984  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0814  monooxygenase FAD-binding  35.48 
 
 
525 aa  252  1e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0653  monooxygenase, FAD-binding  37.77 
 
 
484 aa  249  1e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3777  monooxygenase FAD-binding protein  32.57 
 
 
504 aa  229  8e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.598965  hitchhiker  0.00382559 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0550  monooxygenase, FAD-binding  29.6 
 
 
548 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732263  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1029  monooxygenase, FAD-binding  29.6 
 
 
548 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0988  monooxygenase FAD-binding  29.68 
 
 
548 aa  169  9e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622027  normal  0.120457 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6034  monooxygenase FAD-binding protein  33.69 
 
 
489 aa  168  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.829011  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2368  monooxygenase FAD-binding  29.85 
 
 
549 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128155  normal  0.778169 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0905  monooxygenase FAD-binding  30.57 
 
 
550 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.147157 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4142  monooxygenase, FAD-binding  29.17 
 
 
546 aa  161  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372966  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0893  monooxygenase, FAD-binding  30.25 
 
 
550 aa  161  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207082  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0962  putative monooxygenase, FAD-binding  29.17 
 
 
574 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0576419  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3025  monooxygenase FAD-binding  28.34 
 
 
574 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.114894  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5009  monooxygenase, FAD-binding  31.18 
 
 
506 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4799  monooxygenase FAD-binding  30.51 
 
 
477 aa  154  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  28.99 
 
 
546 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3786  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.95 
 
 
573 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3055  monooxygenase FAD-binding  31.73 
 
 
408 aa  151  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1515  monooxygenase, FAD-binding  33.42 
 
 
478 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497595  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3859  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.95 
 
 
573 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1649  hypothetical protein  32.19 
 
 
497 aa  151  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3790  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.77 
 
 
568 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5796  putative monooxygenase  32.01 
 
 
494 aa  150  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79596  normal  0.121142 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  31.33 
 
 
486 aa  150  8e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2512  monooxygenase FAD-binding  28.98 
 
 
544 aa  149  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0779  monooxygenase, FAD-binding  30.27 
 
 
500 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.813515  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3014  oxygenase  30.06 
 
 
611 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  31.45 
 
 
537 aa  148  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2905  FAD-dependent oxidoreductase  30.06 
 
 
548 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3793  monooxygenase, FAD-binding  34.07 
 
 
524 aa  149  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.791839  normal  0.0125936 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2966  FAD-dependent oxidoreductase  30.06 
 
 
548 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3183  monooxygenase FAD-binding  29.52 
 
 
511 aa  149  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1544  monooxygenase, FAD-binding protein  32.38 
 
 
478 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.585572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1567  monooxygenase, FAD-binding  32.38 
 
 
478 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2324  monooxygenase FAD-binding  29.92 
 
 
547 aa  147  5e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.261518  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2598  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  29.87 
 
 
548 aa  147  6e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0969  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  29.87 
 
 
548 aa  147  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5043  monooxygenase, FAD-binding  28.38 
 
 
505 aa  147  7.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483306  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  30.55 
 
 
493 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0623  monooxygenase FAD-binding  27.89 
 
 
533 aa  146  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  30.54 
 
 
414 aa  145  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>