More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1015 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0563  FAD-dependent oxidoreductase  72.35 
 
 		 544 aa  736    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0903  FAD-dependent oxidoreductase  88.29 
 
 		 540 aa  977    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0888  FAD-dependent oxidoreductase  81.52 
 
 		 535 aa  839    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0885397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1015  FAD-dependent oxidoreductase  100 
 
 		 540 aa  1100    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.18031  normal  0.166528 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0924  FAD-dependent oxidoreductase  75.57 
 
 		 541 aa  829    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5156  FAD-dependent oxidoreductase  88.58 
 
 		 535 aa  921    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328253  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0579  FAD-dependent oxidoreductase  60.77 
 
 		 558 aa  629  1e-179  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4050  FAD-dependent oxidoreductase  54.45 
 
 		 570 aa  587  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000538899  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4661  FAD-dependent oxidoreductase  55.41 
 
 		 559 aa  579  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.135002 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0291  FAD-dependent oxidoreductase  55.58 
 
 		 545 aa  580  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339644  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4529  FAD-dependent oxidoreductase  55.41 
 
 		 559 aa  579  1e-164  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.609398  normal  0.38599 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1395  FAD-dependent oxidoreductase  54.04 
 
 		 553 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2566  FAD-dependent oxidoreductase  54.87 
 
 		 555 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3216  FAD-dependent oxidoreductase  53.71 
 
 		 553 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3231  FAD-dependent oxidoreductase  53.71 
 
 		 553 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0334  FAD-dependent oxidoreductase  55.52 
 
 		 553 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0817  FAD-dependent oxidoreductase  55.52 
 
 		 553 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3177  FAD-dependent oxidoreductase  53.71 
 
 		 553 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1304  FAD-dependent oxidoreductase  54.66 
 
 		 535 aa  573  1.0000000000000001e-162  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1323  FAD-dependent oxidoreductase  53.6 
 
 		 545 aa  568  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0786  FAD-dependent oxidoreductase  54.97 
 
 		 553 aa  568  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2059  FAD-dependent oxidoreductase  53.35 
 
 		 553 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2685  FAD-dependent oxidoreductase  53.35 
 
 		 553 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4218  FAD-dependent oxidoreductase  53.41 
 
 		 579 aa  565  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1924  FAD-dependent oxidoreductase  53.35 
 
 		 553 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.421754  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0853  FAD-dependent oxidoreductase  53.35 
 
 		 553 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0715  FAD-dependent oxidoreductase  54.97 
 
 		 558 aa  567  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.520934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0698  FAD-dependent oxidoreductase  54.79 
 
 		 555 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3910  FAD-dependent oxidoreductase  53.91 
 
 		 550 aa  561  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0428  FAD-dependent oxidoreductase  51.51 
 
 		 569 aa  557  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00420765  normal  0.845447 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0339  FAD-dependent oxidoreductase  54.26 
 
 		 584 aa  556  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7215  FAD-dependent oxidoreductase  51.5 
 
 		 569 aa  552  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4535  FAD-dependent oxidoreductase  54.58 
 
 		 563 aa  550  1e-155  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000237964  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01747  FAD-dependent oxidoreductase  56.62 
 
 		 563 aa  548  1e-154  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.178537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4300  FAD-dependent oxidoreductase  55.94 
 
 		 578 aa  545  1e-154  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1196  FAD-dependent oxidoreductase  53.79 
 
 		 554 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0850  FAD-dependent oxidoreductase  49.72 
 
 		 555 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0192309  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2624  FAD-dependent oxidoreductase  53.49 
 
 		 535 aa  502  1e-141  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.596702 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0776  FAD-dependent oxidoreductase  51.07 
 
 		 524 aa  486  1e-136  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.790337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3815  FAD-dependent oxidoreductase  51.57 
 
 		 541 aa  485  1e-136  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.433248  normal  0.294357 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1432  FAD-dependent oxidoreductase  50.09 
 
 		 546 aa  477  1e-133  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.886265  normal  0.829223 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4192  FAD-dependent oxidoreductase  40.04 
 
 		 564 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2727  FAD-dependent oxidoreductase  40.04 
 
 		 570 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00614764  normal  0.0524365 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4123  FAD-dependent oxidoreductase  37.91 
 
 		 577 aa  362  1e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000743874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3422  monooxygenase, FAD-binding  38.55 
 
 		 550 aa  356  5e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.448007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0875  FAD-dependent oxidoreductase  38.17 
 
 		 581 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.474503  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5105  monooxygenase FAD-binding  39.85 
 
 		 550 aa  352  1e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3718  monooxygenase, FAD-binding  38.07 
 
 		 585 aa  345  1e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1226  FAD-dependent oxidoreductase  35.69 
 
 		 588 aa  342  8e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5380  FAD-dependent oxidoreductase  36.33 
 
 		 583 aa  341  2e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189642  normal  0.0809664 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3000  FAD-dependent oxidoreductase  40.23 
 
 		 551 aa  340  4e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.296257 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4008  monooxygenase FAD-binding  36.36 
 
 		 578 aa  335  2e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.245549  normal  0.525361 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4781  monooxygenase FAD-binding  36.19 
 
 		 572 aa  330  6e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3526  monooxygenase, FAD-binding  39.66 
 
 		 586 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.120911 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18980  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  37.73 
 
 		 554 aa  313  5.999999999999999e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.099299  normal  0.679289 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5321  FAD-dependent oxidoreductase  37.69 
 
 		 561 aa  312  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124532  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1919  monooxygenase FAD-binding protein  38.11 
 
 		 547 aa  309  6.999999999999999e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.136855  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1867  monooxygenase FAD-binding protein  36.02 
 
 		 594 aa  280  4e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4632  monooxygenase, FAD-binding  34.04 
 
 		 557 aa  279  9e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0814  monooxygenase FAD-binding  37.28 
 
 		 525 aa  259  6e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3777  monooxygenase FAD-binding protein  33.84 
 
 		 504 aa  247  4e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.598965  hitchhiker  0.00382559 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0653  monooxygenase, FAD-binding  34.54 
 
 		 484 aa  246  6.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1620  pentachlorophenol 4-monooxygenase; PcpB  29.7 
 
 		 548 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168334  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6034  monooxygenase FAD-binding protein  33.69 
 
 		 489 aa  164  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.829011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0893  monooxygenase, FAD-binding  29.89 
 
 		 550 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207082  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0905  monooxygenase FAD-binding  29.89 
 
 		 550 aa  162  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.147157 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4799  monooxygenase FAD-binding  31.37 
 
 		 477 aa  160  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2966  FAD-dependent oxidoreductase  29.87 
 
 		 548 aa  159  9e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2905  FAD-dependent oxidoreductase  29.87 
 
 		 548 aa  159  9e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3014  oxygenase  29.87 
 
 		 611 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4142  monooxygenase, FAD-binding  29.59 
 
 		 546 aa  159  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  29.04 
 
 		 506 aa  158  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2368  monooxygenase FAD-binding  29.13 
 
 		 549 aa  157  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128155  normal  0.778169 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0969  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  29.68 
 
 		 548 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0988  monooxygenase FAD-binding  29.1 
 
 		 548 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622027  normal  0.120457 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2598  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  29.68 
 
 		 548 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  29.93 
 
 		 546 aa  154  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0550  monooxygenase, FAD-binding  28.73 
 
 		 548 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732263  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1029  monooxygenase, FAD-binding  28.73 
 
 		 548 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0452  pentachlorophenol 4-monooxygenase, putative  29.37 
 
 		 538 aa  152  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0178  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  29.37 
 
 		 538 aa  152  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.74497  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  30.54 
 
 		 511 aa  151  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2328  monooxygenase FAD-binding  31.21 
 
 		 480 aa  150  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.238819  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  28.28 
 
 		 529 aa  150  8e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0725  monooxygenase FAD-binding  28 
 
 		 571 aa  149  9e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490959  normal  0.227588 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0371  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.74 
 
 		 554 aa  149  9e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0411  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.74 
 
 		 554 aa  149  9e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0836277  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  30.69 
 
 		 388 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3278  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.74 
 
 		 554 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0146118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0623  monooxygenase FAD-binding  26.39 
 
 		 533 aa  149  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00301  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.67 
 
 		 554 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00155662  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3259  monooxygenase FAD-binding protein  29.67 
 
 		 554 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.257115  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3183  monooxygenase FAD-binding  29.11 
 
 		 511 aa  148  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00305  hypothetical protein  29.67 
 
 		 554 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00161031  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0422  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.74 
 
 		 554 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1860  hypothetical protein  28.43 
 
 		 498 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.600833 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  31.87 
 
 		 414 aa  147  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2324  monooxygenase FAD-binding  28.32 
 
 		 547 aa  148  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.261518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0378  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.4 
 
 		 554 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0214512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1624  hypothetical protein  26.45 
 
 		 502 aa  147  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.459087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>