More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4632 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4632  monooxygenase, FAD-binding  100 
 
 
557 aa  1139    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4781  monooxygenase FAD-binding  58.46 
 
 
572 aa  598  1e-170  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4192  FAD-dependent oxidoreductase  50.18 
 
 
564 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4123  FAD-dependent oxidoreductase  50.62 
 
 
577 aa  509  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000743874  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0875  FAD-dependent oxidoreductase  49.04 
 
 
581 aa  502  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.474503  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2727  FAD-dependent oxidoreductase  49.82 
 
 
570 aa  501  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00614764  normal  0.0524365 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5380  FAD-dependent oxidoreductase  45.52 
 
 
583 aa  456  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189642  normal  0.0809664 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1226  FAD-dependent oxidoreductase  45.67 
 
 
588 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3000  FAD-dependent oxidoreductase  44.78 
 
 
551 aa  438  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.296257 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5321  FAD-dependent oxidoreductase  45.3 
 
 
561 aa  418  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124532  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3526  monooxygenase, FAD-binding  46.49 
 
 
586 aa  399  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.120911 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4008  monooxygenase FAD-binding  40.21 
 
 
578 aa  382  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.245549  normal  0.525361 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0291  FAD-dependent oxidoreductase  38.49 
 
 
545 aa  352  1e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339644  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4218  FAD-dependent oxidoreductase  38.36 
 
 
579 aa  330  6e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0903  FAD-dependent oxidoreductase  35.58 
 
 
540 aa  323  7e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1304  FAD-dependent oxidoreductase  35.86 
 
 
535 aa  315  9.999999999999999e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26478  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0579  FAD-dependent oxidoreductase  35.82 
 
 
558 aa  315  1.9999999999999998e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4050  FAD-dependent oxidoreductase  35.89 
 
 
570 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000538899  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0334  FAD-dependent oxidoreductase  36.03 
 
 
553 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0817  FAD-dependent oxidoreductase  36.03 
 
 
553 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0786  FAD-dependent oxidoreductase  36.2 
 
 
553 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4535  FAD-dependent oxidoreductase  36.36 
 
 
563 aa  310  4e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000237964  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0924  FAD-dependent oxidoreductase  34.16 
 
 
541 aa  310  4e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0428  FAD-dependent oxidoreductase  35.73 
 
 
569 aa  309  8e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00420765  normal  0.845447 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1323  FAD-dependent oxidoreductase  35.2 
 
 
545 aa  309  9e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3815  FAD-dependent oxidoreductase  36.51 
 
 
541 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.433248  normal  0.294357 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0698  FAD-dependent oxidoreductase  36.15 
 
 
555 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4661  FAD-dependent oxidoreductase  36.52 
 
 
559 aa  306  8.000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.135002 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4529  FAD-dependent oxidoreductase  36.52 
 
 
559 aa  306  8.000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.609398  normal  0.38599 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0715  FAD-dependent oxidoreductase  35.78 
 
 
558 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.520934  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7215  FAD-dependent oxidoreductase  36.43 
 
 
569 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0339  FAD-dependent oxidoreductase  36.07 
 
 
584 aa  301  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1432  FAD-dependent oxidoreductase  36.07 
 
 
546 aa  298  1e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.886265  normal  0.829223 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0850  FAD-dependent oxidoreductase  33.88 
 
 
555 aa  299  1e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0192309  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1196  FAD-dependent oxidoreductase  36.92 
 
 
554 aa  298  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3216  FAD-dependent oxidoreductase  35.67 
 
 
553 aa  296  9e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3231  FAD-dependent oxidoreductase  35.67 
 
 
553 aa  296  9e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2624  FAD-dependent oxidoreductase  36.01 
 
 
535 aa  296  9e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.596702 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3177  FAD-dependent oxidoreductase  35.69 
 
 
553 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4300  FAD-dependent oxidoreductase  36.56 
 
 
578 aa  295  2e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2059  FAD-dependent oxidoreductase  35.49 
 
 
553 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3910  FAD-dependent oxidoreductase  36.33 
 
 
550 aa  291  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1924  FAD-dependent oxidoreductase  35.49 
 
 
553 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.421754  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2685  FAD-dependent oxidoreductase  35.49 
 
 
553 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0853  FAD-dependent oxidoreductase  35.49 
 
 
553 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2566  FAD-dependent oxidoreductase  34.66 
 
 
555 aa  291  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1395  FAD-dependent oxidoreductase  35.75 
 
 
553 aa  290  4e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0776  FAD-dependent oxidoreductase  35.86 
 
 
524 aa  289  1e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.790337  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5156  FAD-dependent oxidoreductase  35.13 
 
 
535 aa  287  4e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328253  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01747  FAD-dependent oxidoreductase  34.97 
 
 
563 aa  279  1e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.178537  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1015  FAD-dependent oxidoreductase  35 
 
 
540 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.18031  normal  0.166528 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0888  FAD-dependent oxidoreductase  34.69 
 
 
535 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0885397  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5105  monooxygenase FAD-binding  36.82 
 
 
550 aa  273  7e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0563  FAD-dependent oxidoreductase  34.31 
 
 
544 aa  272  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3422  monooxygenase, FAD-binding  35.39 
 
 
550 aa  269  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.448007  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3718  monooxygenase, FAD-binding  33.27 
 
 
585 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18980  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  33.52 
 
 
554 aa  218  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.099299  normal  0.679289 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1919  monooxygenase FAD-binding protein  32.2 
 
 
547 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.136855  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0814  monooxygenase FAD-binding  34.72 
 
 
525 aa  204  2e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3777  monooxygenase FAD-binding protein  30.71 
 
 
504 aa  190  7e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.598965  hitchhiker  0.00382559 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0653  monooxygenase, FAD-binding  31.7 
 
 
484 aa  182  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1867  monooxygenase FAD-binding protein  32.43 
 
 
594 aa  179  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167984  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  28.71 
 
 
529 aa  157  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  30.65 
 
 
537 aa  154  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3440  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.24 
 
 
605 aa  150  6e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.845304  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6034  monooxygenase FAD-binding protein  31.49 
 
 
489 aa  146  8.000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.829011  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2377  hypothetical protein  29.39 
 
 
553 aa  146  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.879652  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0905  monooxygenase FAD-binding  29.78 
 
 
550 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.147157 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  29.75 
 
 
501 aa  140  6e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3183  monooxygenase FAD-binding  29.03 
 
 
511 aa  139  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0623  monooxygenase FAD-binding  29.46 
 
 
533 aa  137  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  30.48 
 
 
486 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0411  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.27 
 
 
554 aa  137  7.000000000000001e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0836277  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3278  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.27 
 
 
554 aa  137  7.000000000000001e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0146118  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0371  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.27 
 
 
554 aa  137  7.000000000000001e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0893  monooxygenase, FAD-binding  29.35 
 
 
550 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207082  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1569  monooxygenase, FAD-binding  31.41 
 
 
525 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2311  monooxygenase FAD-binding protein  29.27 
 
 
408 aa  135  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5009  monooxygenase, FAD-binding  30.68 
 
 
506 aa  134  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00305  hypothetical protein  28.73 
 
 
554 aa  134  5e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00161031  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00301  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.73 
 
 
554 aa  134  5e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00155662  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3259  monooxygenase FAD-binding protein  28.73 
 
 
554 aa  134  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.257115  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2290  monooxygenase FAD-binding protein  28.39 
 
 
407 aa  134  5e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  30.94 
 
 
546 aa  134  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  31.44 
 
 
493 aa  134  5e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0378  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.73 
 
 
554 aa  133  6.999999999999999e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0214512  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2368  monooxygenase FAD-binding  28.45 
 
 
549 aa  133  9e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128155  normal  0.778169 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0422  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.73 
 
 
554 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3786  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.14 
 
 
573 aa  130  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3859  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.14 
 
 
573 aa  130  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1979  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.46 
 
 
555 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623617  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5808  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.99 
 
 
552 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5585  putative FAD-binding monooxygenase  29.38 
 
 
514 aa  128  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.187805 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4142  monooxygenase, FAD-binding  27.32 
 
 
546 aa  128  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372966  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3790  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.38 
 
 
568 aa  128  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829218 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0887  monooxygenase FAD-binding  43.3 
 
 
294 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.228672  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  30.55 
 
 
481 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2966  FAD-dependent oxidoreductase  27.83 
 
 
548 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2905  FAD-dependent oxidoreductase  27.83 
 
 
548 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3014  oxygenase  27.83 
 
 
611 aa  127  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>