More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0776 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0776  FAD-dependent oxidoreductase  100 
 
 		 524 aa  1056    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.790337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0579  FAD-dependent oxidoreductase  54.39 
 
 		 558 aa  544  1e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1304  FAD-dependent oxidoreductase  53.24 
 
 		 535 aa  522  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4218  FAD-dependent oxidoreductase  52.25 
 
 		 579 aa  524  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4050  FAD-dependent oxidoreductase  51.49 
 
 		 570 aa  518  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000538899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0339  FAD-dependent oxidoreductase  51.2 
 
 		 584 aa  519  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4661  FAD-dependent oxidoreductase  52.45 
 
 		 559 aa  509  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.135002 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7215  FAD-dependent oxidoreductase  50.65 
 
 		 569 aa  508  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4529  FAD-dependent oxidoreductase  52.45 
 
 		 559 aa  509  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.609398  normal  0.38599 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0428  FAD-dependent oxidoreductase  50.83 
 
 		 569 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00420765  normal  0.845447 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0850  FAD-dependent oxidoreductase  51.36 
 
 		 555 aa  506  9.999999999999999e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0192309  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1323  FAD-dependent oxidoreductase  49.91 
 
 		 545 aa  502  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1196  FAD-dependent oxidoreductase  52.24 
 
 		 554 aa  500  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0903  FAD-dependent oxidoreductase  53.22 
 
 		 540 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2624  FAD-dependent oxidoreductase  54.78 
 
 		 535 aa  496  1e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.596702 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0291  FAD-dependent oxidoreductase  51.72 
 
 		 545 aa  491  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339644  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3910  FAD-dependent oxidoreductase  50.75 
 
 		 550 aa  489  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01747  FAD-dependent oxidoreductase  51.66 
 
 		 563 aa  488  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.178537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4535  FAD-dependent oxidoreductase  51.18 
 
 		 563 aa  483  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000237964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0924  FAD-dependent oxidoreductase  50.86 
 
 		 541 aa  483  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3815  FAD-dependent oxidoreductase  53.15 
 
 		 541 aa  482  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.433248  normal  0.294357 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0698  FAD-dependent oxidoreductase  51.42 
 
 		 555 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0715  FAD-dependent oxidoreductase  51.61 
 
 		 558 aa  485  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.520934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1395  FAD-dependent oxidoreductase  50.09 
 
 		 553 aa  479  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2566  FAD-dependent oxidoreductase  51.33 
 
 		 555 aa  480  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3177  FAD-dependent oxidoreductase  49.91 
 
 		 553 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2059  FAD-dependent oxidoreductase  49.53 
 
 		 553 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3216  FAD-dependent oxidoreductase  49.53 
 
 		 553 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3231  FAD-dependent oxidoreductase  49.53 
 
 		 553 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1924  FAD-dependent oxidoreductase  49.53 
 
 		 553 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.421754  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2685  FAD-dependent oxidoreductase  49.53 
 
 		 553 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0853  FAD-dependent oxidoreductase  49.53 
 
 		 553 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0334  FAD-dependent oxidoreductase  51.14 
 
 		 553 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0786  FAD-dependent oxidoreductase  50.76 
 
 		 553 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0817  FAD-dependent oxidoreductase  51.14 
 
 		 553 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0563  FAD-dependent oxidoreductase  52.56 
 
 		 544 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4300  FAD-dependent oxidoreductase  49.71 
 
 		 578 aa  464  1e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1015  FAD-dependent oxidoreductase  50.41 
 
 		 540 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.18031  normal  0.166528 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0888  FAD-dependent oxidoreductase  51.22 
 
 		 535 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0885397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5156  FAD-dependent oxidoreductase  50.61 
 
 		 535 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328253  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1432  FAD-dependent oxidoreductase  49.6 
 
 		 546 aa  446  1.0000000000000001e-124  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.886265  normal  0.829223 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2727  FAD-dependent oxidoreductase  38.46 
 
 		 570 aa  348  1e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00614764  normal  0.0524365 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4123  FAD-dependent oxidoreductase  38.5 
 
 		 577 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000743874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4192  FAD-dependent oxidoreductase  36.45 
 
 		 564 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0875  FAD-dependent oxidoreductase  37.68 
 
 		 581 aa  336  5e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.474503  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3526  monooxygenase, FAD-binding  41.38 
 
 		 586 aa  331  2e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.120911 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4781  monooxygenase FAD-binding  39.88 
 
 		 572 aa  331  2e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4008  monooxygenase FAD-binding  38.26 
 
 		 578 aa  327  4.0000000000000003e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.245549  normal  0.525361 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3000  FAD-dependent oxidoreductase  36.31 
 
 		 551 aa  319  7e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.296257 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5321  FAD-dependent oxidoreductase  39.05 
 
 		 561 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124532  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1226  FAD-dependent oxidoreductase  37.32 
 
 		 588 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5105  monooxygenase FAD-binding  38.4 
 
 		 550 aa  314  2.9999999999999996e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3422  monooxygenase, FAD-binding  42.6 
 
 		 550 aa  311  1e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.448007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5380  FAD-dependent oxidoreductase  36.48 
 
 		 583 aa  311  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189642  normal  0.0809664 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3718  monooxygenase, FAD-binding  34.48 
 
 		 585 aa  281  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18980  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  37.22 
 
 		 554 aa  279  8e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.099299  normal  0.679289 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4632  monooxygenase, FAD-binding  35.7 
 
 		 557 aa  278  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1919  monooxygenase FAD-binding protein  37.85 
 
 		 547 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.136855  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1867  monooxygenase FAD-binding protein  39.62 
 
 		 594 aa  258  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0653  monooxygenase, FAD-binding  35.02 
 
 		 484 aa  236  9e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0814  monooxygenase FAD-binding  37.41 
 
 		 525 aa  232  1e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3777  monooxygenase FAD-binding protein  33.72 
 
 		 504 aa  214  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.598965  hitchhiker  0.00382559 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5796  putative monooxygenase  32.96 
 
 		 494 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79596  normal  0.121142 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2368  monooxygenase FAD-binding  30.67 
 
 		 549 aa  160  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128155  normal  0.778169 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4799  monooxygenase FAD-binding  33.13 
 
 		 477 aa  159  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0893  monooxygenase, FAD-binding  32.46 
 
 		 550 aa  159  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207082  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0905  monooxygenase FAD-binding  32.24 
 
 		 550 aa  156  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.147157 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4142  monooxygenase, FAD-binding  30.44 
 
 		 546 aa  155  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  30.96 
 
 		 511 aa  155  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0550  monooxygenase, FAD-binding  30.15 
 
 		 548 aa  154  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732263  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1029  monooxygenase, FAD-binding  30.15 
 
 		 548 aa  154  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0988  monooxygenase FAD-binding  30.78 
 
 		 548 aa  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622027  normal  0.120457 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3440  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.13 
 
 		 605 aa  149  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.845304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0616  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.17 
 
 		 580 aa  149  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  28.99 
 
 		 501 aa  147  6e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3278  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.26 
 
 		 554 aa  146  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0146118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0411  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.26 
 
 		 554 aa  146  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0836277  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0371  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.26 
 
 		 554 aa  146  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3079  monooxygenase FAD-binding protein  31.03 
 
 		 503 aa  144  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.0830218 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3513  monooxygenase FAD-binding  27.48 
 
 		 587 aa  145  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00301  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.53 
 
 		 554 aa  145  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00155662  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3259  monooxygenase FAD-binding protein  30.53 
 
 		 554 aa  145  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.257115  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00305  hypothetical protein  30.53 
 
 		 554 aa  145  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00161031  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0378  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.26 
 
 		 554 aa  144  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0214512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0422  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.53 
 
 		 554 aa  144  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2598  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  29.32 
 
 		 548 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0969  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  29.32 
 
 		 548 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3055  monooxygenase FAD-binding  30.65 
 
 		 408 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2905  FAD-dependent oxidoreductase  29.14 
 
 		 548 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  28.57 
 
 		 414 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2966  FAD-dependent oxidoreductase  29.14 
 
 		 548 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3014  oxygenase  29.14 
 
 		 611 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1620  pentachlorophenol 4-monooxygenase; PcpB  27.92 
 
 		 548 aa  140  6e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168334  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0962  putative monooxygenase, FAD-binding  29 
 
 		 574 aa  139  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0576419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0178  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  28.81 
 
 		 538 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.74497  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0452  pentachlorophenol 4-monooxygenase, putative  28.81 
 
 		 538 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5698  monooxygenase FAD-binding  30.19 
 
 		 531 aa  137  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0767168 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1649  hypothetical protein  29.23 
 
 		 497 aa  137  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  29.26 
 
 		 493 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5443  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase; 3-(3-hydroxy-phenyl)propionate hydroxylase FAD/NAD(P)-binding  29.98 
 
 		 547 aa  136  8e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.728003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>