More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4781 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4781  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 		 572 aa  1155    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4632  monooxygenase, FAD-binding  57.17 
 
 		 557 aa  579  1e-164  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4192  FAD-dependent oxidoreductase  54.53 
 
 		 564 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0875  FAD-dependent oxidoreductase  54.31 
 
 		 581 aa  569  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.474503  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4123  FAD-dependent oxidoreductase  53.29 
 
 		 577 aa  568  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000743874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2727  FAD-dependent oxidoreductase  52.67 
 
 		 570 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00614764  normal  0.0524365 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1226  FAD-dependent oxidoreductase  50.8 
 
 		 588 aa  519  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5380  FAD-dependent oxidoreductase  50.89 
 
 		 583 aa  520  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189642  normal  0.0809664 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3000  FAD-dependent oxidoreductase  48.79 
 
 		 551 aa  467  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.296257 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5321  FAD-dependent oxidoreductase  47.89 
 
 		 561 aa  464  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124532  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4008  monooxygenase FAD-binding  45.01 
 
 		 578 aa  420  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.245549  normal  0.525361 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3526  monooxygenase, FAD-binding  47.66 
 
 		 586 aa  410  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.120911 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0579  FAD-dependent oxidoreductase  40.88 
 
 		 558 aa  373  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0903  FAD-dependent oxidoreductase  38.59 
 
 		 540 aa  352  8e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0291  FAD-dependent oxidoreductase  38.17 
 
 		 545 aa  351  3e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339644  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1304  FAD-dependent oxidoreductase  37.59 
 
 		 535 aa  348  1e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0924  FAD-dependent oxidoreductase  37.83 
 
 		 541 aa  343  5e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0334  FAD-dependent oxidoreductase  39.78 
 
 		 553 aa  340  5e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0817  FAD-dependent oxidoreductase  39.78 
 
 		 553 aa  340  5e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0339  FAD-dependent oxidoreductase  37.23 
 
 		 584 aa  339  8e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0715  FAD-dependent oxidoreductase  40.22 
 
 		 558 aa  339  9e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.520934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0698  FAD-dependent oxidoreductase  40.41 
 
 		 555 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0786  FAD-dependent oxidoreductase  38.97 
 
 		 553 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1323  FAD-dependent oxidoreductase  37.22 
 
 		 545 aa  334  3e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0428  FAD-dependent oxidoreductase  36.62 
 
 		 569 aa  332  8e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00420765  normal  0.845447 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4218  FAD-dependent oxidoreductase  37.34 
 
 		 579 aa  331  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7215  FAD-dependent oxidoreductase  36.87 
 
 		 569 aa  329  9e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0776  FAD-dependent oxidoreductase  39.85 
 
 		 524 aa  326  7e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.790337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0850  FAD-dependent oxidoreductase  37.61 
 
 		 555 aa  326  9e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0192309  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3231  FAD-dependent oxidoreductase  38.34 
 
 		 553 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4050  FAD-dependent oxidoreductase  37.16 
 
 		 570 aa  325  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000538899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3216  FAD-dependent oxidoreductase  38.34 
 
 		 553 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2685  FAD-dependent oxidoreductase  38.34 
 
 		 553 aa  324  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2059  FAD-dependent oxidoreductase  38.34 
 
 		 553 aa  324  3e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1924  FAD-dependent oxidoreductase  38.34 
 
 		 553 aa  324  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.421754  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3177  FAD-dependent oxidoreductase  38.16 
 
 		 553 aa  324  3e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0853  FAD-dependent oxidoreductase  38.34 
 
 		 553 aa  324  3e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1395  FAD-dependent oxidoreductase  37.81 
 
 		 553 aa  320  6e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2624  FAD-dependent oxidoreductase  37.87 
 
 		 535 aa  319  1e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.596702 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2566  FAD-dependent oxidoreductase  38.01 
 
 		 555 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4535  FAD-dependent oxidoreductase  36.74 
 
 		 563 aa  313  3.9999999999999997e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000237964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4300  FAD-dependent oxidoreductase  36.84 
 
 		 578 aa  312  9e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01747  FAD-dependent oxidoreductase  37.15 
 
 		 563 aa  311  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.178537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3815  FAD-dependent oxidoreductase  37.32 
 
 		 541 aa  311  2e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.433248  normal  0.294357 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3910  FAD-dependent oxidoreductase  41.15 
 
 		 550 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1196  FAD-dependent oxidoreductase  37.39 
 
 		 554 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0888  FAD-dependent oxidoreductase  37.09 
 
 		 535 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0885397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5156  FAD-dependent oxidoreductase  37.31 
 
 		 535 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328253  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1015  FAD-dependent oxidoreductase  36.19 
 
 		 540 aa  307  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.18031  normal  0.166528 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4529  FAD-dependent oxidoreductase  36.76 
 
 		 559 aa  307  4.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.609398  normal  0.38599 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4661  FAD-dependent oxidoreductase  36.76 
 
 		 559 aa  307  4.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.135002 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0563  FAD-dependent oxidoreductase  37.19 
 
 		 544 aa  303  6.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1432  FAD-dependent oxidoreductase  36.13 
 
 		 546 aa  292  1e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.886265  normal  0.829223 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5105  monooxygenase FAD-binding  39.15 
 
 		 550 aa  271  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3718  monooxygenase, FAD-binding  35.17 
 
 		 585 aa  263  6e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1919  monooxygenase FAD-binding protein  36.57 
 
 		 547 aa  259  7e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.136855  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3422  monooxygenase, FAD-binding  37.66 
 
 		 550 aa  258  3e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.448007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18980  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  35.36 
 
 		 554 aa  232  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.099299  normal  0.679289 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1867  monooxygenase FAD-binding protein  36.01 
 
 		 594 aa  229  8e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0814  monooxygenase FAD-binding  38.13 
 
 		 525 aa  215  1.9999999999999998e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0653  monooxygenase, FAD-binding  31.93 
 
 		 484 aa  186  8e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3777  monooxygenase FAD-binding protein  33.15 
 
 		 504 aa  165  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.598965  hitchhiker  0.00382559 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3440  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.86 
 
 		 605 aa  165  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.845304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  32.76 
 
 		 537 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  31.78 
 
 		 501 aa  162  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  31.4 
 
 		 537 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3183  monooxygenase FAD-binding  30.2 
 
 		 511 aa  151  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  31.74 
 
 		 537 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  31.74 
 
 		 537 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00301  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.78 
 
 		 554 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00155662  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3259  monooxygenase FAD-binding protein  27.78 
 
 		 554 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.257115  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00305  hypothetical protein  27.78 
 
 		 554 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00161031  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0422  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.78 
 
 		 554 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0378  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.78 
 
 		 554 aa  148  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0214512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1649  hypothetical protein  32 
 
 		 497 aa  147  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3278  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.56 
 
 		 554 aa  146  8.000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0146118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0371  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.56 
 
 		 554 aa  147  8.000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0411  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.56 
 
 		 554 aa  147  8.000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0836277  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1979  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.35 
 
 		 555 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623617  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6034  monooxygenase FAD-binding protein  31.29 
 
 		 489 aa  142  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.829011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1484  hypothetical protein  33.68 
 
 		 499 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115631  normal  0.323666 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0848  hypothetical protein  26.82 
 
 		 511 aa  141  3e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.970878  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  29.01 
 
 		 546 aa  141  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0623  monooxygenase FAD-binding  31.79 
 
 		 533 aa  140  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0724  monooxygenase, FAD-binding  29.68 
 
 		 461 aa  139  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  28.14 
 
 		 529 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1850  hypothetical protein  33.15 
 
 		 497 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5796  putative monooxygenase  34.5 
 
 		 494 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79596  normal  0.121142 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0905  monooxygenase FAD-binding  29.87 
 
 		 550 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.147157 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  31.14 
 
 		 475 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0893  monooxygenase, FAD-binding  29.43 
 
 		 550 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207082  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2691  monooxygenase, FAD-binding  31.2 
 
 		 473 aa  137  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2661  monooxygenase, FAD-binding protein  31.2 
 
 		 473 aa  137  5e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2706  monooxygenase, FAD-binding  31.2 
 
 		 473 aa  137  5e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  30.42 
 
 		 511 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0725  monooxygenase FAD-binding protein  29.19 
 
 		 509 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.812372  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1498  monooxygenase, FAD-binding  30.57 
 
 		 477 aa  137  6.0000000000000005e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.106253  normal  0.474209 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0616  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.07 
 
 		 580 aa  137  6.0000000000000005e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2227  monooxygenase FAD-binding  32.13 
 
 		 552 aa  136  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465072  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  31.88 
 
 		 481 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>