More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_18980 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1919  monooxygenase FAD-binding protein  62.64 
 
 
547 aa  641    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.136855  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18980  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  100 
 
 
554 aa  1110    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.099299  normal  0.679289 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1867  monooxygenase FAD-binding protein  59.04 
 
 
594 aa  590  1e-167  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167984  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0653  monooxygenase, FAD-binding  53.63 
 
 
484 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3777  monooxygenase FAD-binding protein  50.09 
 
 
504 aa  459  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.598965  hitchhiker  0.00382559 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0814  monooxygenase FAD-binding  47.96 
 
 
525 aa  412  1e-114  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1323  FAD-dependent oxidoreductase  40.04 
 
 
545 aa  332  8e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1304  FAD-dependent oxidoreductase  39.36 
 
 
535 aa  330  4e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26478  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0924  FAD-dependent oxidoreductase  37.59 
 
 
541 aa  325  1e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0291  FAD-dependent oxidoreductase  39.93 
 
 
545 aa  318  1e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339644  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4661  FAD-dependent oxidoreductase  39.22 
 
 
559 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.135002 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4529  FAD-dependent oxidoreductase  39.22 
 
 
559 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.609398  normal  0.38599 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0339  FAD-dependent oxidoreductase  39.12 
 
 
584 aa  310  4e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0903  FAD-dependent oxidoreductase  37.74 
 
 
540 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3231  FAD-dependent oxidoreductase  39.03 
 
 
553 aa  306  9.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3216  FAD-dependent oxidoreductase  39.03 
 
 
553 aa  306  9.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3177  FAD-dependent oxidoreductase  38.99 
 
 
553 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1196  FAD-dependent oxidoreductase  39.71 
 
 
554 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1395  FAD-dependent oxidoreductase  38.43 
 
 
553 aa  303  8.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4218  FAD-dependent oxidoreductase  37.45 
 
 
579 aa  302  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01747  FAD-dependent oxidoreductase  39.78 
 
 
563 aa  301  3e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.178537  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0715  FAD-dependent oxidoreductase  37.94 
 
 
558 aa  301  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.520934  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3910  FAD-dependent oxidoreductase  42.39 
 
 
550 aa  300  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2059  FAD-dependent oxidoreductase  38.66 
 
 
553 aa  300  6e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1924  FAD-dependent oxidoreductase  38.66 
 
 
553 aa  300  6e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.421754  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2685  FAD-dependent oxidoreductase  38.66 
 
 
553 aa  300  6e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0853  FAD-dependent oxidoreductase  38.66 
 
 
553 aa  300  6e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0579  FAD-dependent oxidoreductase  38.94 
 
 
558 aa  298  2e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4050  FAD-dependent oxidoreductase  36.3 
 
 
570 aa  298  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000538899  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0334  FAD-dependent oxidoreductase  37.94 
 
 
553 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0698  FAD-dependent oxidoreductase  38.12 
 
 
555 aa  298  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0817  FAD-dependent oxidoreductase  37.94 
 
 
553 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4300  FAD-dependent oxidoreductase  38.73 
 
 
578 aa  296  4e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2566  FAD-dependent oxidoreductase  37.85 
 
 
555 aa  294  3e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0428  FAD-dependent oxidoreductase  36.79 
 
 
569 aa  294  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00420765  normal  0.845447 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0786  FAD-dependent oxidoreductase  42.14 
 
 
553 aa  294  4e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4535  FAD-dependent oxidoreductase  38.1 
 
 
563 aa  293  4e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000237964  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7215  FAD-dependent oxidoreductase  36.55 
 
 
569 aa  292  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1015  FAD-dependent oxidoreductase  37.11 
 
 
540 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.18031  normal  0.166528 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0850  FAD-dependent oxidoreductase  39.69 
 
 
555 aa  281  3e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0192309  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5156  FAD-dependent oxidoreductase  36.45 
 
 
535 aa  277  3e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328253  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0776  FAD-dependent oxidoreductase  36.91 
 
 
524 aa  276  7e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.790337  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0563  FAD-dependent oxidoreductase  36.25 
 
 
544 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1432  FAD-dependent oxidoreductase  38.26 
 
 
546 aa  274  3e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.886265  normal  0.829223 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0888  FAD-dependent oxidoreductase  37.28 
 
 
535 aa  272  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0885397  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2624  FAD-dependent oxidoreductase  35.25 
 
 
535 aa  268  2e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.596702 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2727  FAD-dependent oxidoreductase  35.6 
 
 
570 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00614764  normal  0.0524365 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3815  FAD-dependent oxidoreductase  35.69 
 
 
541 aa  265  1e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.433248  normal  0.294357 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4192  FAD-dependent oxidoreductase  35.47 
 
 
564 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4123  FAD-dependent oxidoreductase  35.14 
 
 
577 aa  258  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000743874  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3000  FAD-dependent oxidoreductase  34.12 
 
 
551 aa  249  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.296257 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0875  FAD-dependent oxidoreductase  34.3 
 
 
581 aa  247  4e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.474503  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5105  monooxygenase FAD-binding  35.91 
 
 
550 aa  246  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3718  monooxygenase, FAD-binding  37.99 
 
 
585 aa  239  6.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5380  FAD-dependent oxidoreductase  36.81 
 
 
583 aa  239  8e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189642  normal  0.0809664 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5321  FAD-dependent oxidoreductase  34.02 
 
 
561 aa  239  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124532  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3526  monooxygenase, FAD-binding  37.07 
 
 
586 aa  237  4e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.120911 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3422  monooxygenase, FAD-binding  37.85 
 
 
550 aa  236  6e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.448007  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4008  monooxygenase FAD-binding  36.12 
 
 
578 aa  236  7e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.245549  normal  0.525361 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1226  FAD-dependent oxidoreductase  32.25 
 
 
588 aa  236  8e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4781  monooxygenase FAD-binding  35.67 
 
 
572 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4632  monooxygenase, FAD-binding  32.96 
 
 
557 aa  203  6e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5808  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  33.62 
 
 
552 aa  164  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  33.82 
 
 
537 aa  161  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  32.48 
 
 
546 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  33.25 
 
 
414 aa  158  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6034  monooxygenase FAD-binding protein  34.39 
 
 
489 aa  152  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.829011  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5698  monooxygenase FAD-binding  33.42 
 
 
531 aa  152  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0767168 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3183  monooxygenase FAD-binding  33.01 
 
 
511 aa  150  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0131  2,4-dichlorophenol 6-monooxygenase  30.64 
 
 
556 aa  150  6e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0320392  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4404  monooxygenase FAD-binding  33.97 
 
 
565 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984317  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2311  monooxygenase FAD-binding protein  32.87 
 
 
408 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4799  monooxygenase FAD-binding  31.5 
 
 
477 aa  148  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5009  monooxygenase, FAD-binding  31.65 
 
 
506 aa  147  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2290  monooxygenase FAD-binding protein  32.69 
 
 
407 aa  146  9e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5086  monooxygenase, FAD-binding  34.05 
 
 
570 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5774  monooxygenase, FAD-binding  34.05 
 
 
570 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.750601 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  32.19 
 
 
511 aa  143  8e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3038  monooxygenase, FAD-binding  32.27 
 
 
409 aa  143  9e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10582  FAD binding monooxygenase, putative (JCVI)  32.39 
 
 
566 aa  142  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.832072  normal  0.150999 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1624  hypothetical protein  30.81 
 
 
502 aa  143  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.459087  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  31.69 
 
 
388 aa  142  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  32.66 
 
 
493 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1658  hypothetical protein  30.81 
 
 
502 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0725  monooxygenase FAD-binding  29.19 
 
 
571 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490959  normal  0.227588 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5796  putative monooxygenase  30.77 
 
 
494 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79596  normal  0.121142 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0724  monooxygenase, FAD-binding  29.7 
 
 
461 aa  141  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0988  monooxygenase FAD-binding  28.68 
 
 
548 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622027  normal  0.120457 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1717  hypothetical protein  30.81 
 
 
502 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.587948  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1650  hypothetical protein  30.81 
 
 
502 aa  140  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2512  monooxygenase FAD-binding  29.94 
 
 
544 aa  140  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  29.96 
 
 
506 aa  140  8.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0779  monooxygenase, FAD-binding  29.37 
 
 
500 aa  139  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.813515  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0550  monooxygenase, FAD-binding  28.49 
 
 
548 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732263  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1029  monooxygenase, FAD-binding  28.49 
 
 
548 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2368  monooxygenase FAD-binding  28.89 
 
 
549 aa  137  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128155  normal  0.778169 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2401  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.17 
 
 
569 aa  137  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  32.06 
 
 
486 aa  137  7.000000000000001e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4747  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.32 
 
 
574 aa  136  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649883  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0750  monooxygenase FAD-binding protein  32.49 
 
 
485 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>