More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1196 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1196  FAD-dependent oxidoreductase  100 
 
 
554 aa  1107    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4218  FAD-dependent oxidoreductase  56.7 
 
 
579 aa  595  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1323  FAD-dependent oxidoreductase  56.26 
 
 
545 aa  595  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01747  FAD-dependent oxidoreductase  60.54 
 
 
563 aa  585  1e-166  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.178537  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0715  FAD-dependent oxidoreductase  59.28 
 
 
558 aa  586  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.520934  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0334  FAD-dependent oxidoreductase  59.28 
 
 
553 aa  586  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0817  FAD-dependent oxidoreductase  59.28 
 
 
553 aa  586  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1395  FAD-dependent oxidoreductase  57.38 
 
 
553 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0428  FAD-dependent oxidoreductase  56.07 
 
 
569 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00420765  normal  0.845447 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0698  FAD-dependent oxidoreductase  59.43 
 
 
555 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3177  FAD-dependent oxidoreductase  57.61 
 
 
553 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7215  FAD-dependent oxidoreductase  55.02 
 
 
569 aa  580  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0786  FAD-dependent oxidoreductase  59.09 
 
 
553 aa  580  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3231  FAD-dependent oxidoreductase  57.25 
 
 
553 aa  580  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3216  FAD-dependent oxidoreductase  57.25 
 
 
553 aa  580  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0853  FAD-dependent oxidoreductase  57.25 
 
 
553 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2059  FAD-dependent oxidoreductase  57.25 
 
 
553 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2685  FAD-dependent oxidoreductase  57.25 
 
 
553 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0850  FAD-dependent oxidoreductase  54.95 
 
 
555 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0192309  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1924  FAD-dependent oxidoreductase  57.25 
 
 
553 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.421754  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2566  FAD-dependent oxidoreductase  57.3 
 
 
555 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4661  FAD-dependent oxidoreductase  58.06 
 
 
559 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.135002 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0579  FAD-dependent oxidoreductase  56.85 
 
 
558 aa  574  1.0000000000000001e-162  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4529  FAD-dependent oxidoreductase  58.06 
 
 
559 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.609398  normal  0.38599 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0339  FAD-dependent oxidoreductase  56.85 
 
 
584 aa  569  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4050  FAD-dependent oxidoreductase  55.15 
 
 
570 aa  570  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000538899  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1304  FAD-dependent oxidoreductase  55.25 
 
 
535 aa  571  1e-161  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26478  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3910  FAD-dependent oxidoreductase  58.09 
 
 
550 aa  565  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0291  FAD-dependent oxidoreductase  54.46 
 
 
545 aa  558  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339644  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0903  FAD-dependent oxidoreductase  54 
 
 
540 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0924  FAD-dependent oxidoreductase  52.11 
 
 
541 aa  542  1e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4300  FAD-dependent oxidoreductase  55.93 
 
 
578 aa  531  1e-149  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5156  FAD-dependent oxidoreductase  54.56 
 
 
535 aa  525  1e-148  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328253  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4535  FAD-dependent oxidoreductase  53.45 
 
 
563 aa  521  1e-146  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000237964  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1015  FAD-dependent oxidoreductase  53.79 
 
 
540 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.18031  normal  0.166528 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0563  FAD-dependent oxidoreductase  53.4 
 
 
544 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2624  FAD-dependent oxidoreductase  54.03 
 
 
535 aa  508  9.999999999999999e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.596702 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1432  FAD-dependent oxidoreductase  53.37 
 
 
546 aa  497  1e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.886265  normal  0.829223 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0888  FAD-dependent oxidoreductase  52.61 
 
 
535 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0885397  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0776  FAD-dependent oxidoreductase  51.87 
 
 
524 aa  490  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.790337  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3815  FAD-dependent oxidoreductase  49.54 
 
 
541 aa  477  1e-133  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.433248  normal  0.294357 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5105  monooxygenase FAD-binding  42.25 
 
 
550 aa  387  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3422  monooxygenase, FAD-binding  42.47 
 
 
550 aa  387  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.448007  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4192  FAD-dependent oxidoreductase  40.11 
 
 
564 aa  381  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2727  FAD-dependent oxidoreductase  39.56 
 
 
570 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00614764  normal  0.0524365 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4008  monooxygenase FAD-binding  41.49 
 
 
578 aa  367  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.245549  normal  0.525361 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4123  FAD-dependent oxidoreductase  39.27 
 
 
577 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000743874  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0875  FAD-dependent oxidoreductase  39.82 
 
 
581 aa  361  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.474503  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3718  monooxygenase, FAD-binding  40.54 
 
 
585 aa  355  8.999999999999999e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3000  FAD-dependent oxidoreductase  38.35 
 
 
551 aa  352  8e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.296257 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5380  FAD-dependent oxidoreductase  38.32 
 
 
583 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189642  normal  0.0809664 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1226  FAD-dependent oxidoreductase  37.3 
 
 
588 aa  335  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5321  FAD-dependent oxidoreductase  37.19 
 
 
561 aa  326  6e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124532  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4781  monooxygenase FAD-binding  37.69 
 
 
572 aa  320  3e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18980  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  39.71 
 
 
554 aa  311  1e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.099299  normal  0.679289 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3526  monooxygenase, FAD-binding  39.89 
 
 
586 aa  306  5.0000000000000004e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.120911 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1867  monooxygenase FAD-binding protein  39.96 
 
 
594 aa  298  1e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167984  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1919  monooxygenase FAD-binding protein  38.49 
 
 
547 aa  298  1e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.136855  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4632  monooxygenase, FAD-binding  36.33 
 
 
557 aa  295  2e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0814  monooxygenase FAD-binding  37.88 
 
 
525 aa  258  2e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3777  monooxygenase FAD-binding protein  36.14 
 
 
504 aa  252  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.598965  hitchhiker  0.00382559 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0653  monooxygenase, FAD-binding  36.47 
 
 
484 aa  244  3.9999999999999997e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0550  monooxygenase, FAD-binding  32.54 
 
 
548 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732263  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1029  monooxygenase, FAD-binding  32.54 
 
 
548 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0988  monooxygenase FAD-binding  32.17 
 
 
548 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622027  normal  0.120457 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0905  monooxygenase FAD-binding  31.73 
 
 
550 aa  167  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.147157 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1620  pentachlorophenol 4-monooxygenase; PcpB  31.88 
 
 
548 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168334  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0969  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  32.3 
 
 
548 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2598  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  32.3 
 
 
548 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2966  FAD-dependent oxidoreductase  31.88 
 
 
548 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3014  oxygenase  31.88 
 
 
611 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2905  FAD-dependent oxidoreductase  31.88 
 
 
548 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0893  monooxygenase, FAD-binding  31.73 
 
 
550 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207082  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2368  monooxygenase FAD-binding  31.25 
 
 
549 aa  164  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128155  normal  0.778169 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4142  monooxygenase, FAD-binding  31.78 
 
 
546 aa  163  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372966  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0452  pentachlorophenol 4-monooxygenase, putative  32.16 
 
 
538 aa  161  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0178  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  32.16 
 
 
538 aa  161  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.74497  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  33.46 
 
 
546 aa  160  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0962  putative monooxygenase, FAD-binding  30.58 
 
 
574 aa  156  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0576419  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4799  monooxygenase FAD-binding  31.84 
 
 
477 aa  154  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3440  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.49 
 
 
605 aa  153  7e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.845304  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  30.96 
 
 
529 aa  152  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0616  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.44 
 
 
580 aa  152  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  31.51 
 
 
537 aa  152  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3025  monooxygenase FAD-binding  29.19 
 
 
574 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.114894  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2377  hypothetical protein  30.27 
 
 
553 aa  151  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.879652  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0725  monooxygenase FAD-binding  29.77 
 
 
571 aa  151  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490959  normal  0.227588 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  30.37 
 
 
506 aa  150  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0750  monooxygenase FAD-binding protein  32.61 
 
 
485 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  32.5 
 
 
537 aa  147  6e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  32.5 
 
 
537 aa  147  6e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  32.5 
 
 
537 aa  147  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  30.16 
 
 
501 aa  146  8.000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  34.41 
 
 
481 aa  144  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0297  monooxygenase FAD-binding protein  36.08 
 
 
406 aa  142  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000836883 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3183  monooxygenase FAD-binding  32.07 
 
 
511 aa  142  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5009  monooxygenase, FAD-binding  29.7 
 
 
506 aa  141  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  31.63 
 
 
535 aa  141  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2311  monooxygenase FAD-binding protein  33.23 
 
 
408 aa  140  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0725  monooxygenase FAD-binding protein  32.87 
 
 
509 aa  139  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.812372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>