More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5105 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3422  monooxygenase, FAD-binding  82 
 
 		 550 aa  912    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.448007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5105  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 		 550 aa  1111    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3718  monooxygenase, FAD-binding  51.23 
 
 		 585 aa  526  1e-148  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1395  FAD-dependent oxidoreductase  42.21 
 
 		 553 aa  396  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3216  FAD-dependent oxidoreductase  42.51 
 
 		 553 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3231  FAD-dependent oxidoreductase  42.51 
 
 		 553 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3177  FAD-dependent oxidoreductase  42.4 
 
 		 553 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2685  FAD-dependent oxidoreductase  42.32 
 
 		 553 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2059  FAD-dependent oxidoreductase  42.32 
 
 		 553 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1924  FAD-dependent oxidoreductase  42.32 
 
 		 553 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.421754  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0853  FAD-dependent oxidoreductase  42.32 
 
 		 553 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1304  FAD-dependent oxidoreductase  40 
 
 		 535 aa  387  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3910  FAD-dependent oxidoreductase  48.19 
 
 		 550 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0428  FAD-dependent oxidoreductase  39.42 
 
 		 569 aa  386  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00420765  normal  0.845447 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0715  FAD-dependent oxidoreductase  40.79 
 
 		 558 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.520934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4661  FAD-dependent oxidoreductase  42.49 
 
 		 559 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.135002 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4529  FAD-dependent oxidoreductase  42.49 
 
 		 559 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.609398  normal  0.38599 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0786  FAD-dependent oxidoreductase  42.4 
 
 		 553 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0334  FAD-dependent oxidoreductase  41.29 
 
 		 553 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7215  FAD-dependent oxidoreductase  39.12 
 
 		 569 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0817  FAD-dependent oxidoreductase  41.29 
 
 		 553 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2566  FAD-dependent oxidoreductase  47.4 
 
 		 555 aa  376  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0850  FAD-dependent oxidoreductase  46.32 
 
 		 555 aa  378  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0192309  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0924  FAD-dependent oxidoreductase  41.06 
 
 		 541 aa  378  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0698  FAD-dependent oxidoreductase  41.17 
 
 		 555 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4050  FAD-dependent oxidoreductase  47.19 
 
 		 570 aa  376  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000538899  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0291  FAD-dependent oxidoreductase  42.08 
 
 		 545 aa  377  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339644  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4218  FAD-dependent oxidoreductase  41.39 
 
 		 579 aa  375  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1196  FAD-dependent oxidoreductase  43.04 
 
 		 554 aa  370  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0579  FAD-dependent oxidoreductase  47.55 
 
 		 558 aa  368  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0339  FAD-dependent oxidoreductase  41.03 
 
 		 584 aa  361  2e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1323  FAD-dependent oxidoreductase  38.76 
 
 		 545 aa  359  6e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0903  FAD-dependent oxidoreductase  40.41 
 
 		 540 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01747  FAD-dependent oxidoreductase  44.77 
 
 		 563 aa  353  5.9999999999999994e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.178537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2624  FAD-dependent oxidoreductase  39.96 
 
 		 535 aa  351  2e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.596702 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4300  FAD-dependent oxidoreductase  41.97 
 
 		 578 aa  350  4e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5156  FAD-dependent oxidoreductase  40.49 
 
 		 535 aa  342  8e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328253  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4535  FAD-dependent oxidoreductase  46.55 
 
 		 563 aa  340  2.9999999999999998e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000237964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1015  FAD-dependent oxidoreductase  39.92 
 
 		 540 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.18031  normal  0.166528 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0563  FAD-dependent oxidoreductase  39.08 
 
 		 544 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3815  FAD-dependent oxidoreductase  39.89 
 
 		 541 aa  327  4.0000000000000003e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.433248  normal  0.294357 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1432  FAD-dependent oxidoreductase  41.24 
 
 		 546 aa  325  1e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.886265  normal  0.829223 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0888  FAD-dependent oxidoreductase  39.08 
 
 		 535 aa  325  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0885397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2727  FAD-dependent oxidoreductase  37.91 
 
 		 570 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00614764  normal  0.0524365 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0776  FAD-dependent oxidoreductase  38.81 
 
 		 524 aa  317  3e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.790337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0875  FAD-dependent oxidoreductase  36.33 
 
 		 581 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.474503  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4192  FAD-dependent oxidoreductase  39.9 
 
 		 564 aa  296  5e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4123  FAD-dependent oxidoreductase  40.6 
 
 		 577 aa  294  3e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000743874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3526  monooxygenase, FAD-binding  38.7 
 
 		 586 aa  289  7e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.120911 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3000  FAD-dependent oxidoreductase  36.57 
 
 		 551 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.296257 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4008  monooxygenase FAD-binding  39.51 
 
 		 578 aa  279  8e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.245549  normal  0.525361 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1226  FAD-dependent oxidoreductase  37.95 
 
 		 588 aa  279  9e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5380  FAD-dependent oxidoreductase  39.23 
 
 		 583 aa  276  6e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189642  normal  0.0809664 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4781  monooxygenase FAD-binding  36.65 
 
 		 572 aa  271  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5321  FAD-dependent oxidoreductase  38.64 
 
 		 561 aa  264  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124532  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4632  monooxygenase, FAD-binding  36.32 
 
 		 557 aa  254  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18980  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  36.96 
 
 		 554 aa  251  2e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.099299  normal  0.679289 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1867  monooxygenase FAD-binding protein  35.94 
 
 		 594 aa  245  9.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1919  monooxygenase FAD-binding protein  37.53 
 
 		 547 aa  236  6e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.136855  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0814  monooxygenase FAD-binding  37.44 
 
 		 525 aa  215  1.9999999999999998e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0653  monooxygenase, FAD-binding  33.86 
 
 		 484 aa  197  6e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3777  monooxygenase FAD-binding protein  32.83 
 
 		 504 aa  182  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.598965  hitchhiker  0.00382559 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  32.9 
 
 		 414 aa  162  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4747  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.49 
 
 		 574 aa  155  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5796  putative monooxygenase  32.11 
 
 		 494 aa  154  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79596  normal  0.121142 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  30.48 
 
 		 511 aa  153  7e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6034  monooxygenase FAD-binding protein  32.17 
 
 		 489 aa  153  7e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.829011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  30.15 
 
 		 546 aa  151  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2401  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.08 
 
 		 569 aa  146  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4245  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.74 
 
 		 569 aa  143  6e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.525028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0541  hypothetical protein  28.43 
 
 		 512 aa  142  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3790  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  26.82 
 
 		 568 aa  143  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829218 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3786  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  26.82 
 
 		 573 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3859  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  26.82 
 
 		 573 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2311  monooxygenase FAD-binding protein  29.27 
 
 		 408 aa  140  6e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2162  monooxygenase FAD-binding  32.64 
 
 		 477 aa  138  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351168  decreased coverage  0.00237783 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  28.15 
 
 		 535 aa  138  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  30.67 
 
 		 501 aa  138  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2135  monooxygenase FAD-binding  29.27 
 
 		 540 aa  137  7.000000000000001e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.218617  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1344  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.9 
 
 		 561 aa  136  8e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.430096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  28.02 
 
 		 537 aa  136  9e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0724  monooxygenase, FAD-binding  30.56 
 
 		 461 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  30.17 
 
 		 506 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2290  monooxygenase FAD-binding protein  29.55 
 
 		 407 aa  135  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  31.13 
 
 		 493 aa  134  5e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0623  monooxygenase FAD-binding  27.79 
 
 		 533 aa  133  9e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  30.9 
 
 		 486 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2055  monooxygenase, FAD-binding  31.51 
 
 		 486 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4320  monooxygenase FAD-binding  32.55 
 
 		 522 aa  131  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5009  monooxygenase, FAD-binding  29.4 
 
 		 506 aa  131  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2377  hypothetical protein  29.17 
 
 		 553 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.879652  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  31.36 
 
 		 506 aa  129  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3038  monooxygenase, FAD-binding  28.16 
 
 		 409 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2368  monooxygenase FAD-binding  28.31 
 
 		 549 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128155  normal  0.778169 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6800  monooxygenase FAD-binding  29.27 
 
 		 518 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220979  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  30.83 
 
 		 475 aa  128  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1515  monooxygenase, FAD-binding  29.25 
 
 		 478 aa  127  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5043  monooxygenase, FAD-binding  29.81 
 
 		 505 aa  126  9e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  32.42 
 
 		 481 aa  126  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1567  monooxygenase, FAD-binding  28.85 
 
 		 478 aa  126  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>