More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3422 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3422  monooxygenase, FAD-binding  100 
 
 
550 aa  1110    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.448007  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5105  monooxygenase FAD-binding  82 
 
 
550 aa  894    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3718  monooxygenase, FAD-binding  50.27 
 
 
585 aa  521  1e-146  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3910  FAD-dependent oxidoreductase  41.79 
 
 
550 aa  391  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0428  FAD-dependent oxidoreductase  41.3 
 
 
569 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00420765  normal  0.845447 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7215  FAD-dependent oxidoreductase  39.51 
 
 
569 aa  386  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0786  FAD-dependent oxidoreductase  42.59 
 
 
553 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1395  FAD-dependent oxidoreductase  41.01 
 
 
553 aa  382  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0334  FAD-dependent oxidoreductase  42.4 
 
 
553 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0817  FAD-dependent oxidoreductase  42.4 
 
 
553 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3177  FAD-dependent oxidoreductase  41.68 
 
 
553 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2685  FAD-dependent oxidoreductase  41.39 
 
 
553 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2059  FAD-dependent oxidoreductase  41.39 
 
 
553 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4218  FAD-dependent oxidoreductase  40.69 
 
 
579 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3231  FAD-dependent oxidoreductase  41.57 
 
 
553 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0853  FAD-dependent oxidoreductase  41.39 
 
 
553 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0715  FAD-dependent oxidoreductase  40.79 
 
 
558 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.520934  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1924  FAD-dependent oxidoreductase  41.39 
 
 
553 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.421754  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3216  FAD-dependent oxidoreductase  41.57 
 
 
553 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4661  FAD-dependent oxidoreductase  43.05 
 
 
559 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.135002 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0850  FAD-dependent oxidoreductase  46.93 
 
 
555 aa  376  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0192309  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4529  FAD-dependent oxidoreductase  43.05 
 
 
559 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.609398  normal  0.38599 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0698  FAD-dependent oxidoreductase  40.98 
 
 
555 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1304  FAD-dependent oxidoreductase  39.27 
 
 
535 aa  377  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26478  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0291  FAD-dependent oxidoreductase  42.11 
 
 
545 aa  375  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339644  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2566  FAD-dependent oxidoreductase  40.68 
 
 
555 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0579  FAD-dependent oxidoreductase  40.6 
 
 
558 aa  371  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4050  FAD-dependent oxidoreductase  40.95 
 
 
570 aa  371  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000538899  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1196  FAD-dependent oxidoreductase  42.47 
 
 
554 aa  367  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2624  FAD-dependent oxidoreductase  40.76 
 
 
535 aa  368  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.596702 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0924  FAD-dependent oxidoreductase  40.64 
 
 
541 aa  364  2e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1323  FAD-dependent oxidoreductase  38.18 
 
 
545 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0903  FAD-dependent oxidoreductase  39.74 
 
 
540 aa  354  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0339  FAD-dependent oxidoreductase  46.37 
 
 
584 aa  354  2.9999999999999997e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01747  FAD-dependent oxidoreductase  40.68 
 
 
563 aa  350  4e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.178537  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4300  FAD-dependent oxidoreductase  43.59 
 
 
578 aa  349  7e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4535  FAD-dependent oxidoreductase  37.95 
 
 
563 aa  335  1e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000237964  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5156  FAD-dependent oxidoreductase  40.4 
 
 
535 aa  335  2e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328253  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0563  FAD-dependent oxidoreductase  39.48 
 
 
544 aa  334  3e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1015  FAD-dependent oxidoreductase  38.58 
 
 
540 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.18031  normal  0.166528 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1432  FAD-dependent oxidoreductase  39.75 
 
 
546 aa  324  2e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.886265  normal  0.829223 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0888  FAD-dependent oxidoreductase  38.4 
 
 
535 aa  323  5e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0885397  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3815  FAD-dependent oxidoreductase  37.7 
 
 
541 aa  323  7e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.433248  normal  0.294357 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0776  FAD-dependent oxidoreductase  42.6 
 
 
524 aa  312  1e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.790337  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2727  FAD-dependent oxidoreductase  40.38 
 
 
570 aa  297  4e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00614764  normal  0.0524365 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0875  FAD-dependent oxidoreductase  39.76 
 
 
581 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.474503  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4192  FAD-dependent oxidoreductase  34.5 
 
 
564 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4123  FAD-dependent oxidoreductase  39.25 
 
 
577 aa  283  8.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000743874  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3000  FAD-dependent oxidoreductase  35.27 
 
 
551 aa  282  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.296257 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1226  FAD-dependent oxidoreductase  34.21 
 
 
588 aa  281  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3526  monooxygenase, FAD-binding  38.1 
 
 
586 aa  279  8e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.120911 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4008  monooxygenase FAD-binding  38.48 
 
 
578 aa  275  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.245549  normal  0.525361 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5380  FAD-dependent oxidoreductase  33.8 
 
 
583 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189642  normal  0.0809664 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5321  FAD-dependent oxidoreductase  34.47 
 
 
561 aa  260  5.0000000000000005e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124532  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4781  monooxygenase FAD-binding  37.66 
 
 
572 aa  257  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4632  monooxygenase, FAD-binding  35.39 
 
 
557 aa  253  6e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1867  monooxygenase FAD-binding protein  36.41 
 
 
594 aa  249  8e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167984  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1919  monooxygenase FAD-binding protein  33.33 
 
 
547 aa  239  8e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.136855  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18980  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  37.85 
 
 
554 aa  236  6e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.099299  normal  0.679289 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0814  monooxygenase FAD-binding  37.02 
 
 
525 aa  209  1e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0653  monooxygenase, FAD-binding  33.07 
 
 
484 aa  207  3e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3777  monooxygenase FAD-binding protein  31.42 
 
 
504 aa  182  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.598965  hitchhiker  0.00382559 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  32.96 
 
 
546 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  32.82 
 
 
414 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5796  putative monooxygenase  30.75 
 
 
494 aa  143  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79596  normal  0.121142 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4747  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.4 
 
 
574 aa  140  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649883  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  30.89 
 
 
506 aa  139  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2377  hypothetical protein  30.95 
 
 
553 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.879652  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1650  hypothetical protein  29.32 
 
 
502 aa  139  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1624  hypothetical protein  29.26 
 
 
502 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.459087  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  27.57 
 
 
537 aa  137  7.000000000000001e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  30.95 
 
 
529 aa  136  8e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3790  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.14 
 
 
568 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829218 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2311  monooxygenase FAD-binding protein  29.66 
 
 
408 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4181  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  31.82 
 
 
531 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.895625  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3786  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.14 
 
 
573 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1717  hypothetical protein  29.46 
 
 
502 aa  136  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.587948  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3859  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.14 
 
 
573 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2401  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.4 
 
 
569 aa  135  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  30.81 
 
 
511 aa  134  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1658  hypothetical protein  29.07 
 
 
502 aa  134  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6034  monooxygenase FAD-binding protein  30.77 
 
 
489 aa  131  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.829011  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0616  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.32 
 
 
580 aa  131  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2290  monooxygenase FAD-binding protein  29.55 
 
 
407 aa  131  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5009  monooxygenase, FAD-binding  28.84 
 
 
506 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2055  monooxygenase, FAD-binding  32.24 
 
 
486 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0541  hypothetical protein  31.65 
 
 
512 aa  129  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1344  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.37 
 
 
561 aa  127  5e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.430096  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  29.54 
 
 
537 aa  126  9e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0750  monooxygenase FAD-binding protein  30.04 
 
 
485 aa  126  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3894  monooxygenase FAD-binding  29.32 
 
 
540 aa  126  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0436183  normal  0.0134982 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29830  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  27.39 
 
 
543 aa  125  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.832343 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0623  monooxygenase FAD-binding  26.92 
 
 
533 aa  126  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2162  monooxygenase FAD-binding  33.14 
 
 
477 aa  125  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351168  decreased coverage  0.00237783 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4245  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.25 
 
 
569 aa  125  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.525028  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1860  hypothetical protein  29.94 
 
 
498 aa  125  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.600833 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  29.55 
 
 
486 aa  124  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  29.27 
 
 
537 aa  124  6e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  29.27 
 
 
537 aa  124  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0724  monooxygenase, FAD-binding  30.08 
 
 
461 aa  123  8e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>