More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3815 on replicon NC_009956
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009956  Dshi_3815  FAD-dependent oxidoreductase  100 
 
 		 541 aa  1100    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.433248  normal  0.294357 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1432  FAD-dependent oxidoreductase  61.79 
 
 		 546 aa  647    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.886265  normal  0.829223 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2624  FAD-dependent oxidoreductase  62.45 
 
 		 535 aa  648    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.596702 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1304  FAD-dependent oxidoreductase  52.62 
 
 		 535 aa  548  1e-154  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1323  FAD-dependent oxidoreductase  52.41 
 
 		 545 aa  540  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4218  FAD-dependent oxidoreductase  51.97 
 
 		 579 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0291  FAD-dependent oxidoreductase  51.75 
 
 		 545 aa  509  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339644  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3177  FAD-dependent oxidoreductase  51.07 
 
 		 553 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4535  FAD-dependent oxidoreductase  52.45 
 
 		 563 aa  505  9.999999999999999e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000237964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0579  FAD-dependent oxidoreductase  52.01 
 
 		 558 aa  506  9.999999999999999e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2566  FAD-dependent oxidoreductase  51.62 
 
 		 555 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3216  FAD-dependent oxidoreductase  50.89 
 
 		 553 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3231  FAD-dependent oxidoreductase  50.89 
 
 		 553 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0903  FAD-dependent oxidoreductase  51.1 
 
 		 540 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1924  FAD-dependent oxidoreductase  50.89 
 
 		 553 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.421754  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2059  FAD-dependent oxidoreductase  50.89 
 
 		 553 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0853  FAD-dependent oxidoreductase  50.89 
 
 		 553 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2685  FAD-dependent oxidoreductase  50.89 
 
 		 553 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1395  FAD-dependent oxidoreductase  49.73 
 
 		 553 aa  497  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0339  FAD-dependent oxidoreductase  50.36 
 
 		 584 aa  496  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0334  FAD-dependent oxidoreductase  52.14 
 
 		 553 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7215  FAD-dependent oxidoreductase  49.38 
 
 		 569 aa  497  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0698  FAD-dependent oxidoreductase  52.15 
 
 		 555 aa  495  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0817  FAD-dependent oxidoreductase  52.14 
 
 		 553 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4300  FAD-dependent oxidoreductase  51.35 
 
 		 578 aa  493  9.999999999999999e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0715  FAD-dependent oxidoreductase  51.78 
 
 		 558 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.520934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0428  FAD-dependent oxidoreductase  47.98 
 
 		 569 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00420765  normal  0.845447 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0786  FAD-dependent oxidoreductase  51.49 
 
 		 553 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4050  FAD-dependent oxidoreductase  48.41 
 
 		 570 aa  491  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000538899  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4661  FAD-dependent oxidoreductase  50 
 
 		 559 aa  488  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.135002 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3910  FAD-dependent oxidoreductase  50.56 
 
 		 550 aa  487  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4529  FAD-dependent oxidoreductase  50 
 
 		 559 aa  488  1e-136  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.609398  normal  0.38599 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0850  FAD-dependent oxidoreductase  50.1 
 
 		 555 aa  482  1e-135  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0192309  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5156  FAD-dependent oxidoreductase  53.05 
 
 		 535 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328253  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0776  FAD-dependent oxidoreductase  53.2 
 
 		 524 aa  477  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.790337  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01747  FAD-dependent oxidoreductase  51.21 
 
 		 563 aa  472  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.178537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1015  FAD-dependent oxidoreductase  52.19 
 
 		 540 aa  472  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.18031  normal  0.166528 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1196  FAD-dependent oxidoreductase  49.54 
 
 		 554 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0924  FAD-dependent oxidoreductase  47.35 
 
 		 541 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0888  FAD-dependent oxidoreductase  51.53 
 
 		 535 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0885397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0563  FAD-dependent oxidoreductase  49.34 
 
 		 544 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4192  FAD-dependent oxidoreductase  37.87 
 
 		 564 aa  341  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5105  monooxygenase FAD-binding  39.89 
 
 		 550 aa  335  1e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3422  monooxygenase, FAD-binding  37.7 
 
 		 550 aa  335  2e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.448007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2727  FAD-dependent oxidoreductase  37.7 
 
 		 570 aa  332  8e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00614764  normal  0.0524365 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4008  monooxygenase FAD-binding  38.58 
 
 		 578 aa  330  3e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.245549  normal  0.525361 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3000  FAD-dependent oxidoreductase  37.15 
 
 		 551 aa  328  2.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.296257 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4123  FAD-dependent oxidoreductase  37.02 
 
 		 577 aa  325  1e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000743874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5380  FAD-dependent oxidoreductase  36.94 
 
 		 583 aa  317  3e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189642  normal  0.0809664 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4781  monooxygenase FAD-binding  37.13 
 
 		 572 aa  316  8e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0875  FAD-dependent oxidoreductase  35.61 
 
 		 581 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.474503  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3718  monooxygenase, FAD-binding  36.38 
 
 		 585 aa  314  2.9999999999999996e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1226  FAD-dependent oxidoreductase  34.62 
 
 		 588 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3526  monooxygenase, FAD-binding  37.64 
 
 		 586 aa  309  1.0000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.120911 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5321  FAD-dependent oxidoreductase  36.7 
 
 		 561 aa  304  3.0000000000000004e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124532  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4632  monooxygenase, FAD-binding  36.51 
 
 		 557 aa  299  9e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18980  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  35.78 
 
 		 554 aa  277  3e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.099299  normal  0.679289 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1867  monooxygenase FAD-binding protein  37.02 
 
 		 594 aa  273  5.000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1919  monooxygenase FAD-binding protein  36.76 
 
 		 547 aa  273  6e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.136855  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0653  monooxygenase, FAD-binding  35.8 
 
 		 484 aa  231  4e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0814  monooxygenase FAD-binding  35.74 
 
 		 525 aa  230  4e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3777  monooxygenase FAD-binding protein  32.93 
 
 		 504 aa  210  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.598965  hitchhiker  0.00382559 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2368  monooxygenase FAD-binding  30.71 
 
 		 549 aa  169  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128155  normal  0.778169 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0550  monooxygenase, FAD-binding  30.39 
 
 		 548 aa  161  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732263  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1029  monooxygenase, FAD-binding  30.39 
 
 		 548 aa  161  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0962  putative monooxygenase, FAD-binding  29.53 
 
 		 574 aa  160  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0576419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4142  monooxygenase, FAD-binding  30.98 
 
 		 546 aa  160  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3440  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.83 
 
 		 605 aa  158  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.845304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0988  monooxygenase FAD-binding  29.83 
 
 		 548 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622027  normal  0.120457 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1620  pentachlorophenol 4-monooxygenase; PcpB  29.91 
 
 		 548 aa  156  9e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168334  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2401  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.79 
 
 		 569 aa  156  9e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  29.24 
 
 		 511 aa  153  8e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3025  monooxygenase FAD-binding  27.34 
 
 		 574 aa  153  8.999999999999999e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.114894  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0905  monooxygenase FAD-binding  29.51 
 
 		 550 aa  153  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.147157 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0893  monooxygenase, FAD-binding  29.51 
 
 		 550 aa  151  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207082  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  32.17 
 
 		 414 aa  151  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4799  monooxygenase FAD-binding  31.56 
 
 		 477 aa  149  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  29.12 
 
 		 501 aa  149  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  28.25 
 
 		 537 aa  148  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2328  monooxygenase FAD-binding  31.16 
 
 		 480 aa  147  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.238819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2905  FAD-dependent oxidoreductase  28.99 
 
 		 548 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2966  FAD-dependent oxidoreductase  28.99 
 
 		 548 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2227  monooxygenase FAD-binding  28.25 
 
 		 552 aa  146  9e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465072  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0452  pentachlorophenol 4-monooxygenase, putative  29.23 
 
 		 538 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3014  oxygenase  28.99 
 
 		 611 aa  146  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0178  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  29.23 
 
 		 538 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.74497  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2598  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  29.41 
 
 		 548 aa  146  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0969  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  29.41 
 
 		 548 aa  146  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0623  monooxygenase FAD-binding  27.46 
 
 		 533 aa  144  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4245  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.84 
 
 		 569 aa  144  6e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.525028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3790  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.22 
 
 		 568 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829218 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3786  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.22 
 
 		 573 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3859  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.22 
 
 		 573 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6034  monooxygenase FAD-binding protein  29.3 
 
 		 489 aa  142  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.829011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0725  monooxygenase FAD-binding  27.4 
 
 		 571 aa  141  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490959  normal  0.227588 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  29.97 
 
 		 388 aa  139  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5698  monooxygenase FAD-binding  27.39 
 
 		 531 aa  139  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0767168 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0616  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.71 
 
 		 580 aa  137  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3267  monooxygenase FAD-binding  29.14 
 
 		 486 aa  137  5e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  30.07 
 
 		 493 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>