More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0623 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0623  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 		 533 aa  1088    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  59 
 
 		 537 aa  609  1e-173  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4192  FAD-dependent oxidoreductase  30 
 
 		 564 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2727  FAD-dependent oxidoreductase  30.13 
 
 		 570 aa  169  9e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00614764  normal  0.0524365 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1323  FAD-dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 545 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4008  monooxygenase FAD-binding  34.05 
 
 		 578 aa  164  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.245549  normal  0.525361 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5043  monooxygenase, FAD-binding  28.65 
 
 		 505 aa  163  8.000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5321  FAD-dependent oxidoreductase  29.66 
 
 		 561 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124532  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4123  FAD-dependent oxidoreductase  28.89 
 
 		 577 aa  161  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000743874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0875  FAD-dependent oxidoreductase  31.67 
 
 		 581 aa  157  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.474503  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0339  FAD-dependent oxidoreductase  33.72 
 
 		 584 aa  156  8e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  32 
 
 		 501 aa  156  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1304  FAD-dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 535 aa  151  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0924  FAD-dependent oxidoreductase  28.02 
 
 		 541 aa  150  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  32.34 
 
 		 511 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2512  monooxygenase FAD-binding  25.32 
 
 		 544 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5380  FAD-dependent oxidoreductase  31.91 
 
 		 583 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189642  normal  0.0809664 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4529  FAD-dependent oxidoreductase  32.56 
 
 		 559 aa  147  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.609398  normal  0.38599 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4661  FAD-dependent oxidoreductase  32.56 
 
 		 559 aa  147  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.135002 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2333  monooxygenase FAD-binding  30.43 
 
 		 536 aa  147  5e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.307173 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4050  FAD-dependent oxidoreductase  30.29 
 
 		 570 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000538899  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0291  FAD-dependent oxidoreductase  26.8 
 
 		 545 aa  145  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339644  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0616  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.98 
 
 		 580 aa  145  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3000  FAD-dependent oxidoreductase  28.25 
 
 		 551 aa  145  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.296257 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0698  FAD-dependent oxidoreductase  31.47 
 
 		 555 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6603  monooxygenase FAD-binding protein  32.89 
 
 		 400 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145948  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0715  FAD-dependent oxidoreductase  31.47 
 
 		 558 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.520934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0850  FAD-dependent oxidoreductase  30.33 
 
 		 555 aa  144  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0192309  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  34.13 
 
 		 493 aa  144  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3910  FAD-dependent oxidoreductase  30.27 
 
 		 550 aa  144  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1226  FAD-dependent oxidoreductase  31.62 
 
 		 588 aa  144  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5808  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.9 
 
 		 552 aa  144  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7215  FAD-dependent oxidoreductase  29.79 
 
 		 569 aa  143  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  34.13 
 
 		 486 aa  143  6e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3177  FAD-dependent oxidoreductase  30.99 
 
 		 553 aa  143  8e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0903  FAD-dependent oxidoreductase  31.66 
 
 		 540 aa  143  8e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3216  FAD-dependent oxidoreductase  30.99 
 
 		 553 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3231  FAD-dependent oxidoreductase  30.99 
 
 		 553 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0786  FAD-dependent oxidoreductase  31.18 
 
 		 553 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0334  FAD-dependent oxidoreductase  31.18 
 
 		 553 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2566  FAD-dependent oxidoreductase  30.88 
 
 		 555 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0817  FAD-dependent oxidoreductase  31.18 
 
 		 553 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4781  monooxygenase FAD-binding  32.43 
 
 		 572 aa  140  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1395  FAD-dependent oxidoreductase  31.18 
 
 		 553 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1924  FAD-dependent oxidoreductase  30.7 
 
 		 553 aa  140  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.421754  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2059  FAD-dependent oxidoreductase  30.7 
 
 		 553 aa  140  6e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0853  FAD-dependent oxidoreductase  30.7 
 
 		 553 aa  140  6e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2685  FAD-dependent oxidoreductase  30.7 
 
 		 553 aa  140  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3440  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.95 
 
 		 605 aa  140  7e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.845304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1919  monooxygenase FAD-binding protein  28.52 
 
 		 547 aa  139  8.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.136855  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4218  FAD-dependent oxidoreductase  31.07 
 
 		 579 aa  139  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0579  FAD-dependent oxidoreductase  30.95 
 
 		 558 aa  138  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0131  2,4-dichlorophenol 6-monooxygenase  32.2 
 
 		 556 aa  139  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0320392  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10582  FAD binding monooxygenase, putative (JCVI)  29.48 
 
 		 566 aa  138  3.0000000000000003e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.832072  normal  0.150999 
 
 
-
 
NC_003296  RS01747  FAD-dependent oxidoreductase  31.4 
 
 		 563 aa  137  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.178537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0428  FAD-dependent oxidoreductase  28.86 
 
 		 569 aa  137  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00420765  normal  0.845447 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  29.71 
 
 		 506 aa  137  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2389  hypothetical protein  27.23 
 
 		 557 aa  137  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  31.45 
 
 		 388 aa  137  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1039  monooxygenase FAD-binding  30.32 
 
 		 402 aa  137  7.000000000000001e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.460547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6487  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.62 
 
 		 542 aa  136  8e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6722  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.62 
 
 		 542 aa  136  8e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.792631  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00301  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.75 
 
 		 554 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00155662  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3259  monooxygenase FAD-binding protein  31.75 
 
 		 554 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.257115  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3815  FAD-dependent oxidoreductase  27.06 
 
 		 541 aa  135  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.433248  normal  0.294357 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3284  hypothetical protein  26.55 
 
 		 554 aa  135  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00305  hypothetical protein  31.75 
 
 		 554 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00161031  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3750  monooxygenase, FAD-binding  30.56 
 
 		 511 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0581872  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0371  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.75 
 
 		 554 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0411  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.75 
 
 		 554 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0836277  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3278  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.75 
 
 		 554 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0146118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18980  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  30.51 
 
 		 554 aa  135  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.099299  normal  0.679289 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0378  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.75 
 
 		 554 aa  134  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0214512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3526  monooxygenase, FAD-binding  29.03 
 
 		 586 aa  134  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.120911 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0422  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.75 
 
 		 554 aa  134  6e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1344  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.47 
 
 		 561 aa  133  7.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.430096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3894  monooxygenase FAD-binding  33.85 
 
 		 540 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0436183  normal  0.0134982 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5086  monooxygenase, FAD-binding  29.12 
 
 		 570 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5774  monooxygenase, FAD-binding  29.12 
 
 		 570 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.750601 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0776  FAD-dependent oxidoreductase  29.46 
 
 		 524 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.790337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1484  hypothetical protein  28.76 
 
 		 499 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115631  normal  0.323666 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  32.84 
 
 		 535 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3267  monooxygenase FAD-binding  32.24 
 
 		 486 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3055  monooxygenase FAD-binding  28.49 
 
 		 408 aa  131  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3769  hypothetical protein  29.33 
 
 		 564 aa  130  5.0000000000000004e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5698  monooxygenase FAD-binding  27.39 
 
 		 531 aa  130  6e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0767168 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6800  monooxygenase FAD-binding  29.82 
 
 		 518 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220979  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2162  monooxygenase FAD-binding  33.78 
 
 		 477 aa  130  8.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351168  decreased coverage  0.00237783 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4300  FAD-dependent oxidoreductase  30.42 
 
 		 578 aa  129  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5105  monooxygenase FAD-binding  28.57 
 
 		 550 aa  128  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1015  FAD-dependent oxidoreductase  25.6 
 
 		 540 aa  128  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.18031  normal  0.166528 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3786  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.86 
 
 		 573 aa  128  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1649  hypothetical protein  29.17 
 
 		 497 aa  128  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3859  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.86 
 
 		 573 aa  128  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3790  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.86 
 
 		 568 aa  128  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829218 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4320  monooxygenase FAD-binding  30.48 
 
 		 522 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2624  FAD-dependent oxidoreductase  29.88 
 
 		 535 aa  127  5e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.596702 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2893  monooxygenase FAD-binding  30.59 
 
 		 564 aa  127  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4404  monooxygenase FAD-binding  28.82 
 
 		 565 aa  127  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1541  monooxygenase FAD-binding  28.23 
 
 		 497 aa  127  6e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>