More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2624 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009956  Dshi_3815  FAD-dependent oxidoreductase  62.45 
 
 		 541 aa  654    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.433248  normal  0.294357 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2624  FAD-dependent oxidoreductase  100 
 
 		 535 aa  1093    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.596702 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1432  FAD-dependent oxidoreductase  60.86 
 
 		 546 aa  627  1e-178  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.886265  normal  0.829223 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1304  FAD-dependent oxidoreductase  56.11 
 
 		 535 aa  603  1.0000000000000001e-171  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1323  FAD-dependent oxidoreductase  56.01 
 
 		 545 aa  596  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0579  FAD-dependent oxidoreductase  57.25 
 
 		 558 aa  585  1e-166  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0334  FAD-dependent oxidoreductase  56.5 
 
 		 553 aa  568  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0817  FAD-dependent oxidoreductase  56.5 
 
 		 553 aa  568  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0786  FAD-dependent oxidoreductase  57.62 
 
 		 553 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2566  FAD-dependent oxidoreductase  55.3 
 
 		 555 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0698  FAD-dependent oxidoreductase  57.52 
 
 		 555 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3177  FAD-dependent oxidoreductase  56.49 
 
 		 553 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3216  FAD-dependent oxidoreductase  56.49 
 
 		 553 aa  561  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4218  FAD-dependent oxidoreductase  54.72 
 
 		 579 aa  561  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3231  FAD-dependent oxidoreductase  56.49 
 
 		 553 aa  561  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3910  FAD-dependent oxidoreductase  56.22 
 
 		 550 aa  559  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0715  FAD-dependent oxidoreductase  57.28 
 
 		 558 aa  560  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.520934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0850  FAD-dependent oxidoreductase  54.03 
 
 		 555 aa  559  1e-158  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0192309  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1924  FAD-dependent oxidoreductase  56.31 
 
 		 553 aa  557  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.421754  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2059  FAD-dependent oxidoreductase  56.31 
 
 		 553 aa  557  1e-157  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0853  FAD-dependent oxidoreductase  56.31 
 
 		 553 aa  557  1e-157  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2685  FAD-dependent oxidoreductase  56.31 
 
 		 553 aa  557  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1395  FAD-dependent oxidoreductase  56 
 
 		 553 aa  555  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4535  FAD-dependent oxidoreductase  55.15 
 
 		 563 aa  553  1e-156  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000237964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7215  FAD-dependent oxidoreductase  53.31 
 
 		 569 aa  551  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0291  FAD-dependent oxidoreductase  53.78 
 
 		 545 aa  548  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339644  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0428  FAD-dependent oxidoreductase  53.87 
 
 		 569 aa  548  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00420765  normal  0.845447 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4529  FAD-dependent oxidoreductase  54.45 
 
 		 559 aa  544  1e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.609398  normal  0.38599 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4050  FAD-dependent oxidoreductase  52.11 
 
 		 570 aa  543  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000538899  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4661  FAD-dependent oxidoreductase  54.45 
 
 		 559 aa  544  1e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.135002 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0339  FAD-dependent oxidoreductase  55.29 
 
 		 584 aa  544  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01747  FAD-dependent oxidoreductase  54.84 
 
 		 563 aa  530  1e-149  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.178537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4300  FAD-dependent oxidoreductase  54.73 
 
 		 578 aa  529  1e-149  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0903  FAD-dependent oxidoreductase  53.73 
 
 		 540 aa  525  1e-148  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0924  FAD-dependent oxidoreductase  52.35 
 
 		 541 aa  510  1e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1196  FAD-dependent oxidoreductase  54.03 
 
 		 554 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0563  FAD-dependent oxidoreductase  54.65 
 
 		 544 aa  505  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5156  FAD-dependent oxidoreductase  55.34 
 
 		 535 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328253  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0776  FAD-dependent oxidoreductase  55.27 
 
 		 524 aa  501  1e-140  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.790337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0888  FAD-dependent oxidoreductase  54.27 
 
 		 535 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0885397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1015  FAD-dependent oxidoreductase  53.79 
 
 		 540 aa  495  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.18031  normal  0.166528 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3422  monooxygenase, FAD-binding  40.94 
 
 		 550 aa  384  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.448007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5105  monooxygenase FAD-binding  39.27 
 
 		 550 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4192  FAD-dependent oxidoreductase  39.93 
 
 		 564 aa  354  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2727  FAD-dependent oxidoreductase  37.94 
 
 		 570 aa  345  1e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00614764  normal  0.0524365 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1226  FAD-dependent oxidoreductase  38.33 
 
 		 588 aa  342  9e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4123  FAD-dependent oxidoreductase  38.33 
 
 		 577 aa  341  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000743874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3526  monooxygenase, FAD-binding  41.76 
 
 		 586 aa  340  4e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.120911 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0875  FAD-dependent oxidoreductase  37.76 
 
 		 581 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.474503  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4781  monooxygenase FAD-binding  38.08 
 
 		 572 aa  334  3e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3000  FAD-dependent oxidoreductase  37.03 
 
 		 551 aa  333  5e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.296257 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4008  monooxygenase FAD-binding  39.13 
 
 		 578 aa  332  1e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.245549  normal  0.525361 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3718  monooxygenase, FAD-binding  40.14 
 
 		 585 aa  328  1.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5380  FAD-dependent oxidoreductase  37.01 
 
 		 583 aa  327  3e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189642  normal  0.0809664 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5321  FAD-dependent oxidoreductase  37.05 
 
 		 561 aa  318  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124532  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4632  monooxygenase, FAD-binding  36.01 
 
 		 557 aa  293  5e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1867  monooxygenase FAD-binding protein  37.57 
 
 		 594 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18980  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  35.83 
 
 		 554 aa  283  7.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.099299  normal  0.679289 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1919  monooxygenase FAD-binding protein  36.5 
 
 		 547 aa  277  3e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.136855  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0653  monooxygenase, FAD-binding  34.45 
 
 		 484 aa  241  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0814  monooxygenase FAD-binding  36.95 
 
 		 525 aa  237  3e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3777  monooxygenase FAD-binding protein  33.33 
 
 		 504 aa  230  6e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.598965  hitchhiker  0.00382559 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  32.65 
 
 		 414 aa  169  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  29.17 
 
 		 537 aa  166  8e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6034  monooxygenase FAD-binding protein  33.02 
 
 		 489 aa  164  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.829011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0550  monooxygenase, FAD-binding  30.54 
 
 		 548 aa  162  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732263  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1029  monooxygenase, FAD-binding  30.54 
 
 		 548 aa  162  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0988  monooxygenase FAD-binding  30.35 
 
 		 548 aa  160  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622027  normal  0.120457 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2368  monooxygenase FAD-binding  30.28 
 
 		 549 aa  156  7e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128155  normal  0.778169 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1620  pentachlorophenol 4-monooxygenase; PcpB  29.46 
 
 		 548 aa  155  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168334  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0969  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  29.46 
 
 		 548 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2598  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  29.46 
 
 		 548 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2966  FAD-dependent oxidoreductase  29.21 
 
 		 548 aa  154  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2905  FAD-dependent oxidoreductase  29.21 
 
 		 548 aa  154  5e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3014  oxygenase  29.21 
 
 		 611 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0452  pentachlorophenol 4-monooxygenase, putative  29.27 
 
 		 538 aa  153  7e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0178  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  29.27 
 
 		 538 aa  153  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.74497  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0962  putative monooxygenase, FAD-binding  29.58 
 
 		 574 aa  153  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0576419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0905  monooxygenase FAD-binding  29.72 
 
 		 550 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.147157 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3025  monooxygenase FAD-binding  27.81 
 
 		 574 aa  151  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.114894  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0893  monooxygenase, FAD-binding  29.53 
 
 		 550 aa  150  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207082  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4142  monooxygenase, FAD-binding  29.48 
 
 		 546 aa  150  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3440  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28 
 
 		 605 aa  145  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.845304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  28.99 
 
 		 501 aa  146  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5009  monooxygenase, FAD-binding  29.37 
 
 		 506 aa  144  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6800  monooxygenase FAD-binding  31.13 
 
 		 518 aa  144  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220979  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0623  monooxygenase FAD-binding  31.07 
 
 		 533 aa  144  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2324  monooxygenase FAD-binding  30.96 
 
 		 547 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.261518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  27.02 
 
 		 535 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0616  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.67 
 
 		 580 aa  142  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4799  monooxygenase FAD-binding  30.06 
 
 		 477 aa  142  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  28.92 
 
 		 493 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  29.41 
 
 		 511 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1649  hypothetical protein  30.13 
 
 		 497 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2311  monooxygenase FAD-binding protein  35.24 
 
 		 408 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2290  monooxygenase FAD-binding protein  34.6 
 
 		 407 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  28.71 
 
 		 486 aa  139  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2055  monooxygenase, FAD-binding  32.35 
 
 		 486 aa  138  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2162  monooxygenase FAD-binding  28.66 
 
 		 477 aa  137  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351168  decreased coverage  0.00237783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2328  monooxygenase FAD-binding  30.82 
 
 		 480 aa  137  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.238819  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>