More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4192 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4192  FAD-dependent oxidoreductase  100 
 
 		 564 aa  1157    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5380  FAD-dependent oxidoreductase  64.72 
 
 		 583 aa  726    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189642  normal  0.0809664 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4123  FAD-dependent oxidoreductase  72.21 
 
 		 577 aa  837    Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000743874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2727  FAD-dependent oxidoreductase  75.67 
 
 		 570 aa  883    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00614764  normal  0.0524365 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1226  FAD-dependent oxidoreductase  64.59 
 
 		 588 aa  730    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0875  FAD-dependent oxidoreductase  71.35 
 
 		 581 aa  830    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.474503  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4781  monooxygenase FAD-binding  55.03 
 
 		 572 aa  575  1.0000000000000001e-163  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3000  FAD-dependent oxidoreductase  53.36 
 
 		 551 aa  568  1e-161  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.296257 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5321  FAD-dependent oxidoreductase  53.58 
 
 		 561 aa  545  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124532  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4632  monooxygenase, FAD-binding  50.27 
 
 		 557 aa  493  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4008  monooxygenase FAD-binding  47.45 
 
 		 578 aa  468  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.245549  normal  0.525361 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3526  monooxygenase, FAD-binding  48.87 
 
 		 586 aa  444  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.120911 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0428  FAD-dependent oxidoreductase  42.73 
 
 		 569 aa  432  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00420765  normal  0.845447 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0291  FAD-dependent oxidoreductase  43.15 
 
 		 545 aa  427  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339644  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7215  FAD-dependent oxidoreductase  41.95 
 
 		 569 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4218  FAD-dependent oxidoreductase  42.51 
 
 		 579 aa  412  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4050  FAD-dependent oxidoreductase  41.71 
 
 		 570 aa  410  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000538899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0850  FAD-dependent oxidoreductase  41.08 
 
 		 555 aa  410  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0192309  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1304  FAD-dependent oxidoreductase  39.21 
 
 		 535 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0339  FAD-dependent oxidoreductase  41.86 
 
 		 584 aa  402  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0579  FAD-dependent oxidoreductase  41.57 
 
 		 558 aa  399  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1323  FAD-dependent oxidoreductase  38.06 
 
 		 545 aa  389  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0903  FAD-dependent oxidoreductase  40.33 
 
 		 540 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0924  FAD-dependent oxidoreductase  41.74 
 
 		 541 aa  391  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01747  FAD-dependent oxidoreductase  41.93 
 
 		 563 aa  379  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.178537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4661  FAD-dependent oxidoreductase  39.01 
 
 		 559 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.135002 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4529  FAD-dependent oxidoreductase  39.01 
 
 		 559 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.609398  normal  0.38599 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4535  FAD-dependent oxidoreductase  40.74 
 
 		 563 aa  380  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000237964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0334  FAD-dependent oxidoreductase  41.88 
 
 		 553 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0817  FAD-dependent oxidoreductase  41.88 
 
 		 553 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0786  FAD-dependent oxidoreductase  41.51 
 
 		 553 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4300  FAD-dependent oxidoreductase  42.46 
 
 		 578 aa  377  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0715  FAD-dependent oxidoreductase  40.52 
 
 		 558 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.520934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0698  FAD-dependent oxidoreductase  40.89 
 
 		 555 aa  375  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3910  FAD-dependent oxidoreductase  41.04 
 
 		 550 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3231  FAD-dependent oxidoreductase  39.52 
 
 		 553 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2566  FAD-dependent oxidoreductase  39.37 
 
 		 555 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3216  FAD-dependent oxidoreductase  39.52 
 
 		 553 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1196  FAD-dependent oxidoreductase  40.11 
 
 		 554 aa  368  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1395  FAD-dependent oxidoreductase  39.37 
 
 		 553 aa  364  2e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1015  FAD-dependent oxidoreductase  39.96 
 
 		 540 aa  364  2e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.18031  normal  0.166528 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3177  FAD-dependent oxidoreductase  39.33 
 
 		 553 aa  364  2e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2059  FAD-dependent oxidoreductase  39.33 
 
 		 553 aa  363  6e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2685  FAD-dependent oxidoreductase  39.33 
 
 		 553 aa  363  6e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1924  FAD-dependent oxidoreductase  39.33 
 
 		 553 aa  363  6e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.421754  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0853  FAD-dependent oxidoreductase  39.33 
 
 		 553 aa  363  6e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0563  FAD-dependent oxidoreductase  38.87 
 
 		 544 aa  358  9.999999999999999e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0888  FAD-dependent oxidoreductase  39.69 
 
 		 535 aa  354  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0885397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5156  FAD-dependent oxidoreductase  38.62 
 
 		 535 aa  347  5e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328253  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2624  FAD-dependent oxidoreductase  39.78 
 
 		 535 aa  340  5e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.596702 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0776  FAD-dependent oxidoreductase  36.26 
 
 		 524 aa  337  3.9999999999999995e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.790337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3815  FAD-dependent oxidoreductase  37.87 
 
 		 541 aa  334  3e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.433248  normal  0.294357 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1432  FAD-dependent oxidoreductase  38.23 
 
 		 546 aa  329  9e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.886265  normal  0.829223 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5105  monooxygenase FAD-binding  39.9 
 
 		 550 aa  296  5e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3718  monooxygenase, FAD-binding  34.27 
 
 		 585 aa  293  7e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3422  monooxygenase, FAD-binding  34.57 
 
 		 550 aa  290  3e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.448007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18980  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  35.47 
 
 		 554 aa  266  7e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.099299  normal  0.679289 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1919  monooxygenase FAD-binding protein  34.43 
 
 		 547 aa  259  1e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.136855  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1867  monooxygenase FAD-binding protein  33.21 
 
 		 594 aa  243  6e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0814  monooxygenase FAD-binding  35.5 
 
 		 525 aa  207  5e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0653  monooxygenase, FAD-binding  34.96 
 
 		 484 aa  206  8e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3777  monooxygenase FAD-binding protein  30.67 
 
 		 504 aa  194  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.598965  hitchhiker  0.00382559 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  30.71 
 
 		 537 aa  194  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0623  monooxygenase FAD-binding  30 
 
 		 533 aa  174  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1979  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.02 
 
 		 555 aa  174  5e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623617  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2290  monooxygenase FAD-binding protein  31.89 
 
 		 407 aa  167  5e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2311  monooxygenase FAD-binding protein  31.65 
 
 		 408 aa  167  5e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0887  monooxygenase FAD-binding  69.09 
 
 		 294 aa  164  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.228672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3440  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.3 
 
 		 605 aa  158  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.845304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0616  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.38 
 
 		 580 aa  156  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  29.91 
 
 		 546 aa  154  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00301  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.66 
 
 		 554 aa  149  9e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00155662  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3259  monooxygenase FAD-binding protein  27.66 
 
 		 554 aa  149  9e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.257115  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00305  hypothetical protein  27.66 
 
 		 554 aa  149  9e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00161031  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0378  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.66 
 
 		 554 aa  149  9e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0214512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3278  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.66 
 
 		 554 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0146118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0422  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.66 
 
 		 554 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0411  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.66 
 
 		 554 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0836277  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0371  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.66 
 
 		 554 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0550  monooxygenase, FAD-binding  30.07 
 
 		 548 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732263  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1029  monooxygenase, FAD-binding  30.07 
 
 		 548 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0988  monooxygenase FAD-binding  29.89 
 
 		 548 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622027  normal  0.120457 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5443  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase; 3-(3-hydroxy-phenyl)propionate hydroxylase FAD/NAD(P)-binding  27.93 
 
 		 547 aa  145  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.728003  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2368  monooxygenase FAD-binding  29.3 
 
 		 549 aa  145  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128155  normal  0.778169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6034  monooxygenase FAD-binding protein  29.49 
 
 		 489 aa  145  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.829011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4747  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  26.92 
 
 		 574 aa  143  7e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  32.45 
 
 		 501 aa  143  8e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29830  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  28.9 
 
 		 543 aa  143  8e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.832343 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0905  monooxygenase FAD-binding  29.3 
 
 		 550 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.147157 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2512  monooxygenase FAD-binding  26.2 
 
 		 544 aa  143  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5808  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  26.7 
 
 		 552 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6487  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.33 
 
 		 542 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6722  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.33 
 
 		 542 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.792631  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  28.78 
 
 		 529 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4142  monooxygenase, FAD-binding  29.62 
 
 		 546 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3038  monooxygenase, FAD-binding  31.74 
 
 		 409 aa  141  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0893  monooxygenase, FAD-binding  28.94 
 
 		 550 aa  141  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207082  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  29.92 
 
 		 414 aa  141  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1569  monooxygenase, FAD-binding  27.44 
 
 		 525 aa  141  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  28.18 
 
 		 537 aa  140  6e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>