More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5443 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5443  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase; 3-(3-hydroxy-phenyl)propionate hydroxylase FAD/NAD(P)-binding  100 
 
 		 547 aa  1113    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.728003  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0616  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  49.35 
 
 		 580 aa  428  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5808  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  50 
 
 		 552 aa  414  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3440  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  45.26 
 
 		 605 aa  410  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.845304  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3259  monooxygenase FAD-binding protein  37.45 
 
 		 554 aa  334  2e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.257115  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0411  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.45 
 
 		 554 aa  333  3e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0836277  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0371  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.45 
 
 		 554 aa  333  3e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00301  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.45 
 
 		 554 aa  333  4e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00155662  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3278  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.45 
 
 		 554 aa  333  4e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0146118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00305  hypothetical protein  37.45 
 
 		 554 aa  333  4e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00161031  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0378  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.45 
 
 		 554 aa  332  1e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0214512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3790  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  40.43 
 
 		 568 aa  332  1e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829218 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0422  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.26 
 
 		 554 aa  331  2e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3786  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  40.43 
 
 		 573 aa  331  3e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3859  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  40.43 
 
 		 573 aa  331  3e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1979  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.45 
 
 		 555 aa  326  7e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623617  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2401  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  38.56 
 
 		 569 aa  317  4e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1344  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.5 
 
 		 561 aa  316  7e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.430096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4245  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  38.46 
 
 		 569 aa  309  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.525028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0270  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  34.84 
 
 		 618 aa  298  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.385681  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4747  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  38.58 
 
 		 574 aa  297  3e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6487  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.28 
 
 		 542 aa  297  3e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6722  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.28 
 
 		 542 aa  297  3e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.792631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2329  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.87 
 
 		 622 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4535  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.9 
 
 		 615 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0593  monooxygenase, FAD-binding  36 
 
 		 520 aa  280  4e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5086  monooxygenase, FAD-binding  38.85 
 
 		 570 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5774  monooxygenase, FAD-binding  38.85 
 
 		 570 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.750601 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2893  monooxygenase FAD-binding  33.39 
 
 		 564 aa  269  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4404  monooxygenase FAD-binding  38.94 
 
 		 565 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5805  monooxygenase FAD-binding  34.96 
 
 		 547 aa  265  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000018754  hitchhiker  0.00132409 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6461  monooxygenase FAD-binding  39.62 
 
 		 537 aa  253  7e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0929587  normal  0.112964 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3513  monooxygenase FAD-binding  35.51 
 
 		 587 aa  252  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0928  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  41.62 
 
 		 509 aa  239  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4304  monooxygenase, FAD-binding  34.77 
 
 		 520 aa  233  9e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1569  monooxygenase, FAD-binding  38.04 
 
 		 525 aa  232  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7425  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  38.75 
 
 		 503 aa  229  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5585  putative FAD-binding monooxygenase  34.8 
 
 		 514 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.187805 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0990  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  38.07 
 
 		 507 aa  220  6e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0161  monooxygenase, FAD-binding  32.14 
 
 		 530 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0725  monooxygenase FAD-binding protein  40.51 
 
 		 509 aa  218  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.812372  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1541  monooxygenase FAD-binding  35.73 
 
 		 497 aa  217  4e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4483  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  35.06 
 
 		 555 aa  212  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3413  monooxygenase, FAD-binding  36.78 
 
 		 503 aa  208  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0619698  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4906  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  36.08 
 
 		 511 aa  208  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2814  monooxygenase FAD-binding protein  36.77 
 
 		 537 aa  207  6e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0957884  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4947  monooxygenase FAD-binding protein  35.75 
 
 		 481 aa  193  8e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5524  monooxygenase FAD-binding  36.94 
 
 		 518 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000879135 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1268  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  36.49 
 
 		 530 aa  190  5.999999999999999e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4834  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  36.66 
 
 		 597 aa  173  5.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447643  decreased coverage  0.00803206 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4661  FAD-dependent oxidoreductase  32.04 
 
 		 559 aa  168  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.135002 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4529  FAD-dependent oxidoreductase  32.04 
 
 		 559 aa  168  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.609398  normal  0.38599 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4203  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  34.08 
 
 		 555 aa  164  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5321  FAD-dependent oxidoreductase  30.5 
 
 		 561 aa  163  9e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124532  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0428  FAD-dependent oxidoreductase  29.65 
 
 		 569 aa  158  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00420765  normal  0.845447 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29830  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  32.87 
 
 		 543 aa  155  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.832343 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3290  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.46 
 
 		 523 aa  156  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4050  FAD-dependent oxidoreductase  31.36 
 
 		 570 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000538899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7215  FAD-dependent oxidoreductase  31.15 
 
 		 569 aa  154  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  32.34 
 
 		 537 aa  153  7e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  32.34 
 
 		 537 aa  153  7e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  32.34 
 
 		 537 aa  153  7e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0339  FAD-dependent oxidoreductase  30.95 
 
 		 584 aa  151  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01747  FAD-dependent oxidoreductase  32.78 
 
 		 563 aa  151  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.178537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2727  FAD-dependent oxidoreductase  27.61 
 
 		 570 aa  151  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00614764  normal  0.0524365 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4192  FAD-dependent oxidoreductase  28.42 
 
 		 564 aa  150  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  33.52 
 
 		 501 aa  150  8e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4123  FAD-dependent oxidoreductase  29.13 
 
 		 577 aa  148  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000743874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0875  FAD-dependent oxidoreductase  28.91 
 
 		 581 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.474503  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2566  FAD-dependent oxidoreductase  30.21 
 
 		 555 aa  147  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1658  hypothetical protein  32.77 
 
 		 502 aa  147  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3231  FAD-dependent oxidoreductase  31.91 
 
 		 553 aa  146  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4588  monooxygenase FAD-binding  31.54 
 
 		 555 aa  146  9e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3177  FAD-dependent oxidoreductase  31.91 
 
 		 553 aa  146  9e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3216  FAD-dependent oxidoreductase  31.91 
 
 		 553 aa  146  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1650  hypothetical protein  32.12 
 
 		 502 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  32.24 
 
 		 388 aa  146  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3000  FAD-dependent oxidoreductase  31.56 
 
 		 551 aa  145  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.296257 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1717  hypothetical protein  32.49 
 
 		 502 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.587948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3910  FAD-dependent oxidoreductase  30.21 
 
 		 550 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0853  FAD-dependent oxidoreductase  31.65 
 
 		 553 aa  143  6e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1924  FAD-dependent oxidoreductase  31.65 
 
 		 553 aa  143  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.421754  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2059  FAD-dependent oxidoreductase  31.65 
 
 		 553 aa  143  6e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4218  FAD-dependent oxidoreductase  32.11 
 
 		 579 aa  143  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2685  FAD-dependent oxidoreductase  31.65 
 
 		 553 aa  143  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1304  FAD-dependent oxidoreductase  28.67 
 
 		 535 aa  143  8e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  32.88 
 
 		 475 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1624  hypothetical protein  32.49 
 
 		 502 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.459087  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0715  FAD-dependent oxidoreductase  29.95 
 
 		 558 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.520934  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0724  monooxygenase, FAD-binding  30.1 
 
 		 461 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  33.33 
 
 		 537 aa  142  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0786  FAD-dependent oxidoreductase  29.95 
 
 		 553 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1395  FAD-dependent oxidoreductase  31.3 
 
 		 553 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0334  FAD-dependent oxidoreductase  29.95 
 
 		 553 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0817  FAD-dependent oxidoreductase  29.95 
 
 		 553 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0776  FAD-dependent oxidoreductase  30.42 
 
 		 524 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.790337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0698  FAD-dependent oxidoreductase  29.68 
 
 		 555 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0850  FAD-dependent oxidoreductase  29.74 
 
 		 555 aa  140  7e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0192309  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0924  FAD-dependent oxidoreductase  30.56 
 
 		 541 aa  139  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0779  monooxygenase, FAD-binding  32.99 
 
 		 500 aa  139  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.813515  normal  0.655211 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>