More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4834 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4834  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  100 
 
 
597 aa  1177    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447643  decreased coverage  0.00803206 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1268  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  48.95 
 
 
530 aa  461  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3290  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  53.46 
 
 
523 aa  442  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4203  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  48.35 
 
 
555 aa  419  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4483  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.21 
 
 
555 aa  304  4.0000000000000003e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5524  monooxygenase FAD-binding  42.63 
 
 
518 aa  278  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000879135 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1541  monooxygenase FAD-binding  40.97 
 
 
497 aa  270  5e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0161  monooxygenase, FAD-binding  33.4 
 
 
530 aa  259  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7425  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.94 
 
 
503 aa  243  7e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0990  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  43.09 
 
 
507 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4304  monooxygenase, FAD-binding  34.13 
 
 
520 aa  240  5e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0593  monooxygenase, FAD-binding  34.73 
 
 
520 aa  236  6e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1569  monooxygenase, FAD-binding  33.58 
 
 
525 aa  233  7.000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5585  putative FAD-binding monooxygenase  33.71 
 
 
514 aa  231  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.187805 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3440  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  34.09 
 
 
605 aa  228  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.845304  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0725  monooxygenase FAD-binding protein  42.22 
 
 
509 aa  227  5.0000000000000005e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.812372  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0928  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  40.87 
 
 
509 aa  225  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3513  monooxygenase FAD-binding  32.3 
 
 
587 aa  220  5e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2401  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  33.88 
 
 
569 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3413  monooxygenase, FAD-binding  39.2 
 
 
503 aa  215  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0619698  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0270  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.99 
 
 
618 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.385681  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3259  monooxygenase FAD-binding protein  29.67 
 
 
554 aa  213  7.999999999999999e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.257115  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00301  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.67 
 
 
554 aa  212  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00155662  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00305  hypothetical protein  29.67 
 
 
554 aa  212  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00161031  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0378  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.67 
 
 
554 aa  211  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0214512  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4947  monooxygenase FAD-binding protein  37.31 
 
 
481 aa  211  3e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1979  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.45 
 
 
555 aa  211  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623617  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0411  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.49 
 
 
554 aa  210  5e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0836277  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0371  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.49 
 
 
554 aa  210  5e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3278  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.49 
 
 
554 aa  210  5e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0146118  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3786  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  33.64 
 
 
573 aa  209  9e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3859  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  33.64 
 
 
573 aa  209  9e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4535  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.34 
 
 
615 aa  209  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0422  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.49 
 
 
554 aa  209  1e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3790  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  33.64 
 
 
568 aa  209  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829218 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5086  monooxygenase, FAD-binding  39.84 
 
 
570 aa  207  6e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5774  monooxygenase, FAD-binding  39.84 
 
 
570 aa  207  6e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.750601 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0616  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  32.47 
 
 
580 aa  206  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4404  monooxygenase FAD-binding  39.84 
 
 
565 aa  206  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984317  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4245  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  32.78 
 
 
569 aa  205  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.525028  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2329  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  36.91 
 
 
622 aa  205  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2893  monooxygenase FAD-binding  32.17 
 
 
564 aa  203  7e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4906  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.65 
 
 
511 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2814  monooxygenase FAD-binding protein  35.06 
 
 
537 aa  194  3e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0957884  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5805  monooxygenase FAD-binding  35.41 
 
 
547 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000018754  hitchhiker  0.00132409 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1344  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.86 
 
 
561 aa  190  5.999999999999999e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.430096  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4747  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  33.81 
 
 
574 aa  187  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649883  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5443  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase; 3-(3-hydroxy-phenyl)propionate hydroxylase FAD/NAD(P)-binding  36.86 
 
 
547 aa  180  5.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.728003  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5808  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  34.96 
 
 
552 aa  180  7e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6487  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.99 
 
 
542 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6722  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.99 
 
 
542 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.792631  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6461  monooxygenase FAD-binding  36.63 
 
 
537 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0929587  normal  0.112964 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18980  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  34.1 
 
 
554 aa  149  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.099299  normal  0.679289 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1304  FAD-dependent oxidoreductase  30.3 
 
 
535 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26478  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0903  FAD-dependent oxidoreductase  33.72 
 
 
540 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1323  FAD-dependent oxidoreductase  31.23 
 
 
545 aa  135  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0850  FAD-dependent oxidoreductase  32.08 
 
 
555 aa  134  5e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0192309  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2566  FAD-dependent oxidoreductase  31.65 
 
 
555 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0924  FAD-dependent oxidoreductase  30.95 
 
 
541 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0776  FAD-dependent oxidoreductase  30.36 
 
 
524 aa  130  9.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.790337  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4050  FAD-dependent oxidoreductase  32.06 
 
 
570 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000538899  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1395  FAD-dependent oxidoreductase  30.65 
 
 
553 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3177  FAD-dependent oxidoreductase  30.91 
 
 
553 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0579  FAD-dependent oxidoreductase  31.42 
 
 
558 aa  129  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3216  FAD-dependent oxidoreductase  30.91 
 
 
553 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3231  FAD-dependent oxidoreductase  30.91 
 
 
553 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  30.06 
 
 
535 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2324  monooxygenase FAD-binding  26.84 
 
 
547 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.261518  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0334  FAD-dependent oxidoreductase  31.04 
 
 
553 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0817  FAD-dependent oxidoreductase  31.04 
 
 
553 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0715  FAD-dependent oxidoreductase  31.81 
 
 
558 aa  128  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.520934  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0786  FAD-dependent oxidoreductase  30.79 
 
 
553 aa  128  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7215  FAD-dependent oxidoreductase  30.85 
 
 
569 aa  128  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2227  monooxygenase FAD-binding  32.97 
 
 
552 aa  127  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465072  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4218  FAD-dependent oxidoreductase  33.82 
 
 
579 aa  127  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0428  FAD-dependent oxidoreductase  30.53 
 
 
569 aa  127  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00420765  normal  0.845447 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1919  monooxygenase FAD-binding protein  31.32 
 
 
547 aa  127  8.000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.136855  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0698  FAD-dependent oxidoreductase  31.52 
 
 
555 aa  127  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1924  FAD-dependent oxidoreductase  30.65 
 
 
553 aa  126  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.421754  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2059  FAD-dependent oxidoreductase  30.65 
 
 
553 aa  126  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0853  FAD-dependent oxidoreductase  30.65 
 
 
553 aa  126  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2685  FAD-dependent oxidoreductase  30.65 
 
 
553 aa  126  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3910  FAD-dependent oxidoreductase  29.82 
 
 
550 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1867  monooxygenase FAD-binding protein  30.19 
 
 
594 aa  124  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167984  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5156  FAD-dependent oxidoreductase  31.17 
 
 
535 aa  124  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328253  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  30.43 
 
 
537 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4529  FAD-dependent oxidoreductase  34.02 
 
 
559 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.609398  normal  0.38599 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0291  FAD-dependent oxidoreductase  29.67 
 
 
545 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339644  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0339  FAD-dependent oxidoreductase  31.23 
 
 
584 aa  123  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4661  FAD-dependent oxidoreductase  34.02 
 
 
559 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.135002 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0563  FAD-dependent oxidoreductase  30.34 
 
 
544 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  30.43 
 
 
537 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  30.43 
 
 
537 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2196  monooxygenase, FAD-binding  32.55 
 
 
503 aa  121  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01747  FAD-dependent oxidoreductase  32.78 
 
 
563 aa  121  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.178537  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5796  putative monooxygenase  34.77 
 
 
494 aa  121  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79596  normal  0.121142 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4008  monooxygenase FAD-binding  30.7 
 
 
578 aa  120  6e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.245549  normal  0.525361 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  34.69 
 
 
501 aa  120  6e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2748  monooxygenase FAD-binding protein  32.8 
 
 
489 aa  120  6e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3079  monooxygenase FAD-binding protein  31.28 
 
 
503 aa  120  7.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.0830218 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>