More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0270 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4535  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  74.28 
 
 
615 aa  900    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0270  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  100 
 
 
618 aa  1259    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.385681  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1979  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  55.29 
 
 
555 aa  650    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623617  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2329  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  78.11 
 
 
622 aa  952    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0371  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  53.36 
 
 
554 aa  625  1e-178  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0378  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  53.53 
 
 
554 aa  625  1e-178  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0214512  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0411  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  53.36 
 
 
554 aa  625  1e-178  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0836277  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3278  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  53.36 
 
 
554 aa  624  1e-177  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0146118  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00301  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  53.18 
 
 
554 aa  620  1e-176  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00155662  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3259  monooxygenase FAD-binding protein  53.18 
 
 
554 aa  621  1e-176  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.257115  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00305  hypothetical protein  53.18 
 
 
554 aa  620  1e-176  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00161031  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0422  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  53.18 
 
 
554 aa  619  1e-176  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3790  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  46.96 
 
 
568 aa  505  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829218 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2401  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  46.86 
 
 
569 aa  505  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3786  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  47.04 
 
 
573 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3859  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  47.04 
 
 
573 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4747  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  47.62 
 
 
574 aa  501  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649883  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1344  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  47.01 
 
 
561 aa  493  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.430096  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4245  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  46.73 
 
 
569 aa  490  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.525028  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2893  monooxygenase FAD-binding  43.05 
 
 
564 aa  443  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6487  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  39.24 
 
 
542 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6722  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  39.24 
 
 
542 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.792631  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5808  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.95 
 
 
552 aa  342  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3513  monooxygenase FAD-binding  33.5 
 
 
587 aa  314  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5443  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase; 3-(3-hydroxy-phenyl)propionate hydroxylase FAD/NAD(P)-binding  35.04 
 
 
547 aa  292  1e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.728003  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3440  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  34.12 
 
 
605 aa  286  5e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.845304  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0616  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  32.97 
 
 
580 aa  272  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5805  monooxygenase FAD-binding  33.45 
 
 
547 aa  254  5.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000018754  hitchhiker  0.00132409 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5086  monooxygenase, FAD-binding  33.75 
 
 
570 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5774  monooxygenase, FAD-binding  33.75 
 
 
570 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.750601 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4404  monooxygenase FAD-binding  34.44 
 
 
565 aa  239  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984317  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1569  monooxygenase, FAD-binding  32.5 
 
 
525 aa  234  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0928  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  39.62 
 
 
509 aa  224  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0593  monooxygenase, FAD-binding  35.15 
 
 
520 aa  224  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0161  monooxygenase, FAD-binding  29.9 
 
 
530 aa  224  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7425  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.88 
 
 
503 aa  222  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1541  monooxygenase FAD-binding  35.71 
 
 
497 aa  208  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6461  monooxygenase FAD-binding  30.9 
 
 
537 aa  206  9e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0929587  normal  0.112964 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4304  monooxygenase, FAD-binding  28.34 
 
 
520 aa  204  5e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0990  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.64 
 
 
507 aa  198  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4834  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.07 
 
 
597 aa  192  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447643  decreased coverage  0.00803206 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1268  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.2 
 
 
530 aa  190  5.999999999999999e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0725  monooxygenase FAD-binding protein  32.56 
 
 
509 aa  189  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.812372  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4483  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.74 
 
 
555 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4947  monooxygenase FAD-binding protein  33.78 
 
 
481 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5585  putative FAD-binding monooxygenase  28.32 
 
 
514 aa  184  5.0000000000000004e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.187805 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5524  monooxygenase FAD-binding  33.78 
 
 
518 aa  177  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000879135 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2814  monooxygenase FAD-binding protein  31.54 
 
 
537 aa  172  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0957884  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4203  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  35.88 
 
 
555 aa  172  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3413  monooxygenase, FAD-binding  34.43 
 
 
503 aa  173  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0619698  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3290  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  35.56 
 
 
523 aa  162  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4906  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.17 
 
 
511 aa  161  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  36.44 
 
 
506 aa  152  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2324  monooxygenase FAD-binding  31.74 
 
 
547 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.261518  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0724  monooxygenase, FAD-binding  30.21 
 
 
461 aa  147  5e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  32.85 
 
 
506 aa  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4529  FAD-dependent oxidoreductase  30 
 
 
559 aa  145  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.609398  normal  0.38599 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4661  FAD-dependent oxidoreductase  30 
 
 
559 aa  145  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.135002 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  34.66 
 
 
481 aa  140  6e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4008  monooxygenase FAD-binding  27.82 
 
 
578 aa  139  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.245549  normal  0.525361 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9228  hypothetical protein  35.55 
 
 
504 aa  139  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.187294  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5796  putative monooxygenase  33.61 
 
 
494 aa  138  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79596  normal  0.121142 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4192  FAD-dependent oxidoreductase  28.05 
 
 
564 aa  137  8e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  32.7 
 
 
537 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2691  monooxygenase, FAD-binding  32.91 
 
 
473 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2661  monooxygenase, FAD-binding protein  32.91 
 
 
473 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  32.7 
 
 
537 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2706  monooxygenase, FAD-binding  32.91 
 
 
473 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  32.7 
 
 
537 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0715  FAD-dependent oxidoreductase  28.88 
 
 
558 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.520934  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2227  monooxygenase FAD-binding  31.15 
 
 
552 aa  135  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465072  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2727  FAD-dependent oxidoreductase  28.05 
 
 
570 aa  135  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00614764  normal  0.0524365 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4123  FAD-dependent oxidoreductase  28.46 
 
 
577 aa  134  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000743874  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1850  hypothetical protein  33.14 
 
 
497 aa  134  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0698  FAD-dependent oxidoreductase  28.61 
 
 
555 aa  134  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2111  monooxygenase, FAD-binding  31.38 
 
 
511 aa  134  6e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.0054618  normal  0.499354 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  32.43 
 
 
529 aa  134  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5380  FAD-dependent oxidoreductase  29.2 
 
 
583 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189642  normal  0.0809664 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  31.09 
 
 
493 aa  133  9e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  32.07 
 
 
486 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2377  hypothetical protein  32.32 
 
 
553 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.879652  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4156  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  33.33 
 
 
541 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  0.0299299 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4669  hypothetical protein  31.13 
 
 
515 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679977  normal  0.120633 
 
 
-
 
NC_003296  RS01747  FAD-dependent oxidoreductase  29.47 
 
 
563 aa  131  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.178537  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1226  FAD-dependent oxidoreductase  26.4 
 
 
588 aa  131  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0786  FAD-dependent oxidoreductase  29.03 
 
 
553 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0334  FAD-dependent oxidoreductase  29.03 
 
 
553 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0817  FAD-dependent oxidoreductase  29.03 
 
 
553 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2566  FAD-dependent oxidoreductase  28.34 
 
 
555 aa  130  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1658  hypothetical protein  31.23 
 
 
502 aa  130  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2389  hypothetical protein  31 
 
 
557 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0962  putative monooxygenase, FAD-binding  30.56 
 
 
574 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0576419  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0875  FAD-dependent oxidoreductase  29.13 
 
 
581 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.474503  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1656  hypothetical protein  32.36 
 
 
508 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.652016  normal  0.325297 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4781  monooxygenase FAD-binding  28.29 
 
 
572 aa  128  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1624  hypothetical protein  31.23 
 
 
502 aa  128  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.459087  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1717  hypothetical protein  30.95 
 
 
502 aa  128  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.587948  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0776  FAD-dependent oxidoreductase  28.73 
 
 
524 aa  127  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.790337  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1860  hypothetical protein  33.14 
 
 
498 aa  127  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.600833 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2512  monooxygenase FAD-binding  27.41 
 
 
544 aa  127  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>