More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1268 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1268  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  100 
 
 
530 aa  1057    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4834  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  48.48 
 
 
597 aa  461  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447643  decreased coverage  0.00803206 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4203  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  46.22 
 
 
555 aa  411  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3290  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  50.48 
 
 
523 aa  408  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4483  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  40.04 
 
 
555 aa  324  2e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5524  monooxygenase FAD-binding  39.06 
 
 
518 aa  307  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000879135 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5585  putative FAD-binding monooxygenase  36.76 
 
 
514 aa  282  8.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.187805 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1541  monooxygenase FAD-binding  38.31 
 
 
497 aa  281  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0161  monooxygenase, FAD-binding  34.29 
 
 
530 aa  269  7e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7425  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  36.09 
 
 
503 aa  267  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0990  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  36.54 
 
 
507 aa  260  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4304  monooxygenase, FAD-binding  33.14 
 
 
520 aa  256  7e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0928  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.95 
 
 
509 aa  253  6e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1569  monooxygenase, FAD-binding  34.22 
 
 
525 aa  238  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3259  monooxygenase FAD-binding protein  31.5 
 
 
554 aa  232  1e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.257115  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0371  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.3 
 
 
554 aa  232  1e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3278  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.86 
 
 
554 aa  232  1e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0146118  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0411  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.3 
 
 
554 aa  232  1e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0836277  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00301  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.05 
 
 
554 aa  231  2e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00155662  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0378  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.3 
 
 
554 aa  231  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0214512  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00305  hypothetical protein  31.05 
 
 
554 aa  231  2e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00161031  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0422  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.3 
 
 
554 aa  230  4e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3413  monooxygenase, FAD-binding  35.08 
 
 
503 aa  229  7e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0619698  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4947  monooxygenase FAD-binding protein  36 
 
 
481 aa  227  4e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0725  monooxygenase FAD-binding protein  35.88 
 
 
509 aa  225  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.812372  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3440  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  33.33 
 
 
605 aa  219  8.999999999999998e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.845304  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0593  monooxygenase, FAD-binding  32.42 
 
 
520 aa  219  8.999999999999998e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1979  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.99 
 
 
555 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623617  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3513  monooxygenase FAD-binding  32.6 
 
 
587 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5808  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  32.95 
 
 
552 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4535  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  34.42 
 
 
615 aa  213  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5086  monooxygenase, FAD-binding  33.27 
 
 
570 aa  210  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5774  monooxygenase, FAD-binding  33.27 
 
 
570 aa  210  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.750601 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4404  monooxygenase FAD-binding  32.96 
 
 
565 aa  210  5e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984317  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2814  monooxygenase FAD-binding protein  39.07 
 
 
537 aa  206  6e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0957884  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2329  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  35.81 
 
 
622 aa  205  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6461  monooxygenase FAD-binding  33.09 
 
 
537 aa  204  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0929587  normal  0.112964 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0270  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.2 
 
 
618 aa  196  7e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.385681  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2401  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.78 
 
 
569 aa  195  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6487  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.93 
 
 
542 aa  194  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6722  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.93 
 
 
542 aa  194  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.792631  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5805  monooxygenase FAD-binding  32.04 
 
 
547 aa  192  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000018754  hitchhiker  0.00132409 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4906  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  33.13 
 
 
511 aa  192  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5443  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase; 3-(3-hydroxy-phenyl)propionate hydroxylase FAD/NAD(P)-binding  36.18 
 
 
547 aa  189  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.728003  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0616  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.88 
 
 
580 aa  189  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1344  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  35.26 
 
 
561 aa  187  5e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.430096  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3790  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.01 
 
 
568 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829218 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4747  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.76 
 
 
574 aa  182  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649883  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3786  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.01 
 
 
573 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3859  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.01 
 
 
573 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2893  monooxygenase FAD-binding  34.27 
 
 
564 aa  177  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4245  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.57 
 
 
569 aa  172  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.525028  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2227  monooxygenase FAD-binding  31.27 
 
 
552 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465072  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0924  FAD-dependent oxidoreductase  29.81 
 
 
541 aa  131  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18980  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  29.95 
 
 
554 aa  131  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.099299  normal  0.679289 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  28.55 
 
 
501 aa  131  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  27.68 
 
 
535 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  31.82 
 
 
493 aa  126  9e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1216  hypothetical protein  32.34 
 
 
486 aa  126  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.795806  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2324  monooxygenase FAD-binding  26.96 
 
 
547 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.261518  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  29.1 
 
 
388 aa  124  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2748  monooxygenase FAD-binding protein  33.69 
 
 
489 aa  124  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1919  monooxygenase FAD-binding protein  31.34 
 
 
547 aa  124  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.136855  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4133  pentachlorophenol monooxygenase  30.41 
 
 
479 aa  122  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  31.48 
 
 
486 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1498  monooxygenase, FAD-binding  34.88 
 
 
477 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.106253  normal  0.474209 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1323  FAD-dependent oxidoreductase  27.27 
 
 
545 aa  121  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6034  monooxygenase FAD-binding protein  31.6 
 
 
489 aa  121  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.829011  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0776  FAD-dependent oxidoreductase  26.53 
 
 
524 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.790337  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0903  FAD-dependent oxidoreductase  30.03 
 
 
540 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1304  FAD-dependent oxidoreductase  27.99 
 
 
535 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26478  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  31.87 
 
 
475 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1940  monooxygenase, FAD-binding  32.17 
 
 
489 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3216  FAD-dependent oxidoreductase  29.03 
 
 
553 aa  118  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3231  FAD-dependent oxidoreductase  29.03 
 
 
553 aa  118  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  30.35 
 
 
511 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3267  monooxygenase FAD-binding  30.27 
 
 
486 aa  117  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  28.72 
 
 
537 aa  117  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0779  monooxygenase, FAD-binding  30.59 
 
 
500 aa  117  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.813515  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2135  monooxygenase FAD-binding  28.24 
 
 
540 aa  116  7.999999999999999e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.218617  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  28.95 
 
 
537 aa  116  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  28.95 
 
 
537 aa  116  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2512  monooxygenase FAD-binding  26.89 
 
 
544 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3177  FAD-dependent oxidoreductase  29.03 
 
 
553 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3910  FAD-dependent oxidoreductase  28.94 
 
 
550 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1649  hypothetical protein  29.63 
 
 
497 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0579  FAD-dependent oxidoreductase  27.85 
 
 
558 aa  115  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0853  FAD-dependent oxidoreductase  28.06 
 
 
553 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2059  FAD-dependent oxidoreductase  28.06 
 
 
553 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1924  FAD-dependent oxidoreductase  28.06 
 
 
553 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.421754  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2685  FAD-dependent oxidoreductase  28.06 
 
 
553 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0131  2,4-dichlorophenol 6-monooxygenase  29.2 
 
 
556 aa  114  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0320392  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2196  monooxygenase, FAD-binding  30.79 
 
 
503 aa  114  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  28.19 
 
 
414 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10582  FAD binding monooxygenase, putative (JCVI)  26.98 
 
 
566 aa  113  9e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.832072  normal  0.150999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  29.46 
 
 
506 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4529  FAD-dependent oxidoreductase  29.21 
 
 
559 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.609398  normal  0.38599 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0161  monooxygenase FAD-binding protein  31.69 
 
 
493 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4661  FAD-dependent oxidoreductase  29.21 
 
 
559 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.135002 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1867  monooxygenase FAD-binding protein  31.36 
 
 
594 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167984  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>