More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4747 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2401  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  66.55 
 
 
569 aa  763    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4747  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  100 
 
 
574 aa  1153    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649883  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3786  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  70.92 
 
 
573 aa  802    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3790  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  70.56 
 
 
568 aa  799    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829218 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3859  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  70.92 
 
 
573 aa  802    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4245  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  66.14 
 
 
569 aa  753    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.525028  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1344  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  55.18 
 
 
561 aa  580  1e-164  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.430096  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1979  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  49.72 
 
 
555 aa  528  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623617  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2329  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  47.91 
 
 
622 aa  528  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4535  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  46.95 
 
 
615 aa  513  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0270  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  47.07 
 
 
618 aa  509  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.385681  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0411  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  46.9 
 
 
554 aa  509  1e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0836277  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0378  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  47.28 
 
 
554 aa  511  1e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0214512  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3278  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  46.9 
 
 
554 aa  508  1e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0146118  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0371  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  46.9 
 
 
554 aa  509  1e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00301  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  46.9 
 
 
554 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00155662  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3259  monooxygenase FAD-binding protein  46.72 
 
 
554 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.257115  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00305  hypothetical protein  46.9 
 
 
554 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00161031  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0422  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  46.72 
 
 
554 aa  505  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2893  monooxygenase FAD-binding  48.11 
 
 
564 aa  487  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6487  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  42.83 
 
 
542 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6722  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  42.83 
 
 
542 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.792631  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5808  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.71 
 
 
552 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3440  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.87 
 
 
605 aa  315  1.9999999999999998e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.845304  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5443  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase; 3-(3-hydroxy-phenyl)propionate hydroxylase FAD/NAD(P)-binding  38.74 
 
 
547 aa  303  6.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.728003  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0616  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  35.88 
 
 
580 aa  291  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3513  monooxygenase FAD-binding  34.65 
 
 
587 aa  276  6e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0593  monooxygenase, FAD-binding  33.01 
 
 
520 aa  240  5.999999999999999e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0928  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  40.41 
 
 
509 aa  233  6e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6461  monooxygenase FAD-binding  35.77 
 
 
537 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0929587  normal  0.112964 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5805  monooxygenase FAD-binding  34.99 
 
 
547 aa  224  4e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000018754  hitchhiker  0.00132409 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1569  monooxygenase, FAD-binding  31.32 
 
 
525 aa  219  7e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0161  monooxygenase, FAD-binding  33.46 
 
 
530 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4304  monooxygenase, FAD-binding  32.26 
 
 
520 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1541  monooxygenase FAD-binding  35.26 
 
 
497 aa  214  4.9999999999999996e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4947  monooxygenase FAD-binding protein  34.26 
 
 
481 aa  213  7.999999999999999e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7425  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  34.27 
 
 
503 aa  211  3e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4404  monooxygenase FAD-binding  35.83 
 
 
565 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984317  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5086  monooxygenase, FAD-binding  35.37 
 
 
570 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5774  monooxygenase, FAD-binding  35.37 
 
 
570 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.750601 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0990  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  32.27 
 
 
507 aa  206  9e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0725  monooxygenase FAD-binding protein  34.33 
 
 
509 aa  204  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.812372  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5585  putative FAD-binding monooxygenase  31.2 
 
 
514 aa  194  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.187805 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4203  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  36.91 
 
 
555 aa  183  9.000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3290  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  35.4 
 
 
523 aa  181  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1268  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  32.03 
 
 
530 aa  181  4e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2727  FAD-dependent oxidoreductase  30.27 
 
 
570 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00614764  normal  0.0524365 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3413  monooxygenase, FAD-binding  35.26 
 
 
503 aa  179  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0619698  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4483  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.15 
 
 
555 aa  179  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4834  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  33.82 
 
 
597 aa  176  7e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447643  decreased coverage  0.00803206 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2814  monooxygenase FAD-binding protein  32.68 
 
 
537 aa  175  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0957884  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4906  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.88 
 
 
511 aa  173  7.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4123  FAD-dependent oxidoreductase  28.81 
 
 
577 aa  169  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000743874  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0875  FAD-dependent oxidoreductase  28.29 
 
 
581 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.474503  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5524  monooxygenase FAD-binding  29.33 
 
 
518 aa  163  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000879135 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5105  monooxygenase FAD-binding  30.58 
 
 
550 aa  159  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5380  FAD-dependent oxidoreductase  27.85 
 
 
583 aa  157  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189642  normal  0.0809664 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4529  FAD-dependent oxidoreductase  33.17 
 
 
559 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.609398  normal  0.38599 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4661  FAD-dependent oxidoreductase  33.17 
 
 
559 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.135002 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3055  monooxygenase FAD-binding  30.96 
 
 
408 aa  152  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4008  monooxygenase FAD-binding  30.08 
 
 
578 aa  149  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.245549  normal  0.525361 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4192  FAD-dependent oxidoreductase  27.14 
 
 
564 aa  148  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18980  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  29.3 
 
 
554 aa  146  9e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.099299  normal  0.679289 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3422  monooxygenase, FAD-binding  27.5 
 
 
550 aa  145  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.448007  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3000  FAD-dependent oxidoreductase  27.92 
 
 
551 aa  144  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.296257 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4781  monooxygenase FAD-binding  28.67 
 
 
572 aa  144  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3526  monooxygenase, FAD-binding  32.16 
 
 
586 aa  144  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.120911 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0291  FAD-dependent oxidoreductase  32.89 
 
 
545 aa  143  8e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339644  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1850  hypothetical protein  32.3 
 
 
497 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3718  monooxygenase, FAD-binding  27.52 
 
 
585 aa  143  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1226  FAD-dependent oxidoreductase  27.37 
 
 
588 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4218  FAD-dependent oxidoreductase  30.97 
 
 
579 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2566  FAD-dependent oxidoreductase  29.06 
 
 
555 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  34.01 
 
 
506 aa  141  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0541  hypothetical protein  33.33 
 
 
512 aa  140  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3910  FAD-dependent oxidoreductase  28.88 
 
 
550 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5043  monooxygenase, FAD-binding  31.68 
 
 
505 aa  140  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483306  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1658  hypothetical protein  32.19 
 
 
502 aa  139  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1650  hypothetical protein  32.86 
 
 
502 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1624  hypothetical protein  32.29 
 
 
502 aa  138  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.459087  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1717  hypothetical protein  32.29 
 
 
502 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.587948  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0786  FAD-dependent oxidoreductase  27.8 
 
 
553 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0334  FAD-dependent oxidoreductase  27.8 
 
 
553 aa  137  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0817  FAD-dependent oxidoreductase  27.8 
 
 
553 aa  137  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0715  FAD-dependent oxidoreductase  27.9 
 
 
558 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.520934  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0698  FAD-dependent oxidoreductase  27.9 
 
 
555 aa  136  8e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  32.4 
 
 
475 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4050  FAD-dependent oxidoreductase  29.97 
 
 
570 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000538899  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  32.34 
 
 
537 aa  135  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0924  FAD-dependent oxidoreductase  25.05 
 
 
541 aa  135  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4669  hypothetical protein  33.33 
 
 
515 aa  135  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679977  normal  0.120633 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4320  monooxygenase FAD-binding  32.04 
 
 
522 aa  135  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5796  putative monooxygenase  33.61 
 
 
494 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79596  normal  0.121142 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0428  FAD-dependent oxidoreductase  30.56 
 
 
569 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00420765  normal  0.845447 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1304  FAD-dependent oxidoreductase  28.57 
 
 
535 aa  134  6e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26478  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4535  FAD-dependent oxidoreductase  32.86 
 
 
563 aa  134  6e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000237964  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0339  FAD-dependent oxidoreductase  30.25 
 
 
584 aa  134  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1432  FAD-dependent oxidoreductase  28.93 
 
 
546 aa  133  7.999999999999999e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.886265  normal  0.829223 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1323  FAD-dependent oxidoreductase  28.97 
 
 
545 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3183  monooxygenase FAD-binding  32.97 
 
 
511 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>