More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0698 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4529  FAD-dependent oxidoreductase  69.13 
 
 		 559 aa  738    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.609398  normal  0.38599 
 
 
-
 
NC_003296  RS01747  FAD-dependent oxidoreductase  70.07 
 
 		 563 aa  717    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.178537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0786  FAD-dependent oxidoreductase  92.07 
 
 		 553 aa  1026    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0291  FAD-dependent oxidoreductase  65.9 
 
 		 545 aa  700    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339644  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2059  FAD-dependent oxidoreductase  82.28 
 
 		 553 aa  917    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2685  FAD-dependent oxidoreductase  82.28 
 
 		 553 aa  917    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4218  FAD-dependent oxidoreductase  69.86 
 
 		 579 aa  781    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3231  FAD-dependent oxidoreductase  82.46 
 
 		 553 aa  920    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3910  FAD-dependent oxidoreductase  91.35 
 
 		 550 aa  973    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3177  FAD-dependent oxidoreductase  82.28 
 
 		 553 aa  920    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4661  FAD-dependent oxidoreductase  69.13 
 
 		 559 aa  738    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.135002 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1395  FAD-dependent oxidoreductase  81.19 
 
 		 553 aa  887    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3216  FAD-dependent oxidoreductase  82.46 
 
 		 553 aa  920    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0850  FAD-dependent oxidoreductase  59.75 
 
 		 555 aa  637    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0192309  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4050  FAD-dependent oxidoreductase  68.5 
 
 		 570 aa  762    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000538899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4535  FAD-dependent oxidoreductase  64.32 
 
 		 563 aa  660    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000237964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0428  FAD-dependent oxidoreductase  69.08 
 
 		 569 aa  773    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00420765  normal  0.845447 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0853  FAD-dependent oxidoreductase  82.28 
 
 		 553 aa  917    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1924  FAD-dependent oxidoreductase  82.28 
 
 		 553 aa  917    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.421754  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0339  FAD-dependent oxidoreductase  68.15 
 
 		 584 aa  738    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0334  FAD-dependent oxidoreductase  92.43 
 
 		 553 aa  1030    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7215  FAD-dependent oxidoreductase  69.79 
 
 		 569 aa  776    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0698  FAD-dependent oxidoreductase  100 
 
 		 555 aa  1124    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0715  FAD-dependent oxidoreductase  98.92 
 
 		 558 aa  1116    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.520934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2566  FAD-dependent oxidoreductase  88.81 
 
 		 555 aa  979    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0817  FAD-dependent oxidoreductase  92.43 
 
 		 553 aa  1030    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1304  FAD-dependent oxidoreductase  59.75 
 
 		 535 aa  654    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0579  FAD-dependent oxidoreductase  64.31 
 
 		 558 aa  679    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4300  FAD-dependent oxidoreductase  63.72 
 
 		 578 aa  647    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1323  FAD-dependent oxidoreductase  56.34 
 
 		 545 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0903  FAD-dependent oxidoreductase  55.33 
 
 		 540 aa  575  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0924  FAD-dependent oxidoreductase  54.84 
 
 		 541 aa  567  1e-160  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1196  FAD-dependent oxidoreductase  58.39 
 
 		 554 aa  565  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2624  FAD-dependent oxidoreductase  56.92 
 
 		 535 aa  549  1e-155  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.596702 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1015  FAD-dependent oxidoreductase  55.2 
 
 		 540 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.18031  normal  0.166528 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0888  FAD-dependent oxidoreductase  55.8 
 
 		 535 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0885397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5156  FAD-dependent oxidoreductase  55.69 
 
 		 535 aa  525  1e-148  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328253  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0563  FAD-dependent oxidoreductase  54.78 
 
 		 544 aa  514  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3815  FAD-dependent oxidoreductase  51.9 
 
 		 541 aa  489  1e-137  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.433248  normal  0.294357 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1432  FAD-dependent oxidoreductase  52.36 
 
 		 546 aa  489  1e-137  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.886265  normal  0.829223 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0776  FAD-dependent oxidoreductase  49.82 
 
 		 524 aa  474  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.790337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3422  monooxygenase, FAD-binding  40.98 
 
 		 550 aa  378  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.448007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4123  FAD-dependent oxidoreductase  40.92 
 
 		 577 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000743874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5105  monooxygenase FAD-binding  46.41 
 
 		 550 aa  374  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4192  FAD-dependent oxidoreductase  39.61 
 
 		 564 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3718  monooxygenase, FAD-binding  40.62 
 
 		 585 aa  372  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2727  FAD-dependent oxidoreductase  39.12 
 
 		 570 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00614764  normal  0.0524365 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0875  FAD-dependent oxidoreductase  40.33 
 
 		 581 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.474503  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3000  FAD-dependent oxidoreductase  39.17 
 
 		 551 aa  362  1e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.296257 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5321  FAD-dependent oxidoreductase  39.96 
 
 		 561 aa  361  2e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124532  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5380  FAD-dependent oxidoreductase  39.39 
 
 		 583 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189642  normal  0.0809664 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4008  monooxygenase FAD-binding  38.46 
 
 		 578 aa  351  2e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.245549  normal  0.525361 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1226  FAD-dependent oxidoreductase  38.24 
 
 		 588 aa  350  3e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4781  monooxygenase FAD-binding  40.08 
 
 		 572 aa  331  2e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3526  monooxygenase, FAD-binding  40.45 
 
 		 586 aa  327  3e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.120911 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18980  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  38.12 
 
 		 554 aa  303  8.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.099299  normal  0.679289 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4632  monooxygenase, FAD-binding  36.61 
 
 		 557 aa  292  9e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1919  monooxygenase FAD-binding protein  37.02 
 
 		 547 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.136855  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1867  monooxygenase FAD-binding protein  36.91 
 
 		 594 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0814  monooxygenase FAD-binding  39.15 
 
 		 525 aa  230  4e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0653  monooxygenase, FAD-binding  37.17 
 
 		 484 aa  224  4e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3777  monooxygenase FAD-binding protein  30.64 
 
 		 504 aa  216  7e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.598965  hitchhiker  0.00382559 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0550  monooxygenase, FAD-binding  31.37 
 
 		 548 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732263  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1029  monooxygenase, FAD-binding  31.37 
 
 		 548 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0988  monooxygenase FAD-binding  31.18 
 
 		 548 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622027  normal  0.120457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  32.72 
 
 		 546 aa  174  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4142  monooxygenase, FAD-binding  31.74 
 
 		 546 aa  172  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2368  monooxygenase FAD-binding  32.46 
 
 		 549 aa  170  6e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128155  normal  0.778169 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0905  monooxygenase FAD-binding  32.48 
 
 		 550 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.147157 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0962  putative monooxygenase, FAD-binding  32.03 
 
 		 574 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0576419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0893  monooxygenase, FAD-binding  32.66 
 
 		 550 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207082  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3025  monooxygenase FAD-binding  33.42 
 
 		 574 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.114894  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  33.53 
 
 		 537 aa  164  5.0000000000000005e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6034  monooxygenase FAD-binding protein  33.06 
 
 		 489 aa  158  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.829011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2311  monooxygenase FAD-binding protein  36.86 
 
 		 408 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3055  monooxygenase FAD-binding  31.7 
 
 		 408 aa  154  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0725  monooxygenase FAD-binding  31.77 
 
 		 571 aa  153  8e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490959  normal  0.227588 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  30.91 
 
 		 414 aa  152  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0725  monooxygenase FAD-binding protein  32.21 
 
 		 509 aa  151  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.812372  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2290  monooxygenase FAD-binding protein  36.06 
 
 		 407 aa  150  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  30.64 
 
 		 486 aa  151  4e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  28.57 
 
 		 493 aa  151  4e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29830  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  27.34 
 
 		 543 aa  149  9e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.832343 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  30.73 
 
 		 537 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  30.73 
 
 		 537 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  30.73 
 
 		 537 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3513  monooxygenase FAD-binding  27.99 
 
 		 587 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0616  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.29 
 
 		 580 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1620  pentachlorophenol 4-monooxygenase; PcpB  31.2 
 
 		 548 aa  148  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168334  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2905  FAD-dependent oxidoreductase  29.12 
 
 		 548 aa  148  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2966  FAD-dependent oxidoreductase  29.12 
 
 		 548 aa  148  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3014  oxygenase  29.12 
 
 		 611 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  28.88 
 
 		 501 aa  145  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0623  monooxygenase FAD-binding  31.47 
 
 		 533 aa  145  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3786  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.44 
 
 		 573 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3859  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.44 
 
 		 573 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0969  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  28.55 
 
 		 548 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2055  monooxygenase, FAD-binding  31.76 
 
 		 486 aa  145  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2598  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  28.55 
 
 		 548 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3790  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.16 
 
 		 568 aa  145  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829218 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>