More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0291 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A2685  FAD-dependent oxidoreductase  63.52 
 
 		 553 aa  679    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4661  FAD-dependent oxidoreductase  63.62 
 
 		 559 aa  663    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.135002 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0291  FAD-dependent oxidoreductase  100 
 
 		 545 aa  1115    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339644  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7215  FAD-dependent oxidoreductase  61.27 
 
 		 569 aa  686    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2059  FAD-dependent oxidoreductase  63.52 
 
 		 553 aa  679    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0715  FAD-dependent oxidoreductase  65.9 
 
 		 558 aa  687    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.520934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4218  FAD-dependent oxidoreductase  64.17 
 
 		 579 aa  699    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3231  FAD-dependent oxidoreductase  63.7 
 
 		 553 aa  683    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3910  FAD-dependent oxidoreductase  67.32 
 
 		 550 aa  696    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1395  FAD-dependent oxidoreductase  63.86 
 
 		 553 aa  680    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4050  FAD-dependent oxidoreductase  61.65 
 
 		 570 aa  680    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000538899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4535  FAD-dependent oxidoreductase  73.91 
 
 		 563 aa  804    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000237964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0428  FAD-dependent oxidoreductase  61.97 
 
 		 569 aa  697    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00420765  normal  0.845447 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4529  FAD-dependent oxidoreductase  63.62 
 
 		 559 aa  663    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.609398  normal  0.38599 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3216  FAD-dependent oxidoreductase  63.7 
 
 		 553 aa  683    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3177  FAD-dependent oxidoreductase  63.88 
 
 		 553 aa  684    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0339  FAD-dependent oxidoreductase  61.84 
 
 		 584 aa  664    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0334  FAD-dependent oxidoreductase  66.97 
 
 		 553 aa  696    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1304  FAD-dependent oxidoreductase  58.2 
 
 		 535 aa  638    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2566  FAD-dependent oxidoreductase  65.05 
 
 		 555 aa  679    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0698  FAD-dependent oxidoreductase  65.72 
 
 		 555 aa  683    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0579  FAD-dependent oxidoreductase  66.85 
 
 		 558 aa  704    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1924  FAD-dependent oxidoreductase  63.52 
 
 		 553 aa  679    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.421754  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0817  FAD-dependent oxidoreductase  66.97 
 
 		 553 aa  696    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0786  FAD-dependent oxidoreductase  67.15 
 
 		 553 aa  692    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4300  FAD-dependent oxidoreductase  67.69 
 
 		 578 aa  711    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0853  FAD-dependent oxidoreductase  63.52 
 
 		 553 aa  679    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01747  FAD-dependent oxidoreductase  63.74 
 
 		 563 aa  633  1e-180  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.178537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1323  FAD-dependent oxidoreductase  55.41 
 
 		 545 aa  599  1e-170  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0850  FAD-dependent oxidoreductase  56.13 
 
 		 555 aa  598  1e-169  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0192309  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0903  FAD-dependent oxidoreductase  56.35 
 
 		 540 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0924  FAD-dependent oxidoreductase  54.53 
 
 		 541 aa  571  1e-161  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1015  FAD-dependent oxidoreductase  56.2 
 
 		 540 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.18031  normal  0.166528 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5156  FAD-dependent oxidoreductase  55.53 
 
 		 535 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328253  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1196  FAD-dependent oxidoreductase  54.46 
 
 		 554 aa  536  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0888  FAD-dependent oxidoreductase  54.89 
 
 		 535 aa  535  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0885397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0563  FAD-dependent oxidoreductase  53.75 
 
 		 544 aa  532  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2624  FAD-dependent oxidoreductase  53.78 
 
 		 535 aa  525  1e-148  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.596702 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3815  FAD-dependent oxidoreductase  52.02 
 
 		 541 aa  495  9.999999999999999e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.433248  normal  0.294357 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0776  FAD-dependent oxidoreductase  51.15 
 
 		 524 aa  484  1e-135  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.790337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1432  FAD-dependent oxidoreductase  51.01 
 
 		 546 aa  473  1e-132  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.886265  normal  0.829223 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2727  FAD-dependent oxidoreductase  44.14 
 
 		 570 aa  428  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00614764  normal  0.0524365 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4192  FAD-dependent oxidoreductase  43.15 
 
 		 564 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4123  FAD-dependent oxidoreductase  41.12 
 
 		 577 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000743874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0875  FAD-dependent oxidoreductase  41.27 
 
 		 581 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.474503  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1226  FAD-dependent oxidoreductase  41.89 
 
 		 588 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5380  FAD-dependent oxidoreductase  41.42 
 
 		 583 aa  390  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189642  normal  0.0809664 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3422  monooxygenase, FAD-binding  42.11 
 
 		 550 aa  375  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.448007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5105  monooxygenase FAD-binding  41.59 
 
 		 550 aa  374  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4008  monooxygenase FAD-binding  39.51 
 
 		 578 aa  361  2e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.245549  normal  0.525361 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3000  FAD-dependent oxidoreductase  38.91 
 
 		 551 aa  361  2e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.296257 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3718  monooxygenase, FAD-binding  41.47 
 
 		 585 aa  361  2e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5321  FAD-dependent oxidoreductase  38.78 
 
 		 561 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124532  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4781  monooxygenase FAD-binding  38.26 
 
 		 572 aa  344  2e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3526  monooxygenase, FAD-binding  41.75 
 
 		 586 aa  331  2e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.120911 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4632  monooxygenase, FAD-binding  38.49 
 
 		 557 aa  329  6e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18980  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  39.93 
 
 		 554 aa  318  1e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.099299  normal  0.679289 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1919  monooxygenase FAD-binding protein  37.57 
 
 		 547 aa  289  8e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.136855  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1867  monooxygenase FAD-binding protein  37.61 
 
 		 594 aa  282  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0814  monooxygenase FAD-binding  37.12 
 
 		 525 aa  249  8e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0653  monooxygenase, FAD-binding  35.63 
 
 		 484 aa  240  5.999999999999999e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3777  monooxygenase FAD-binding protein  33.21 
 
 		 504 aa  234  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.598965  hitchhiker  0.00382559 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2368  monooxygenase FAD-binding  31.73 
 
 		 549 aa  179  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128155  normal  0.778169 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0550  monooxygenase, FAD-binding  30.9 
 
 		 548 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732263  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1029  monooxygenase, FAD-binding  30.9 
 
 		 548 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0988  monooxygenase FAD-binding  30.9 
 
 		 548 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622027  normal  0.120457 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0905  monooxygenase FAD-binding  31.54 
 
 		 550 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.147157 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0893  monooxygenase, FAD-binding  31.17 
 
 		 550 aa  166  8e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207082  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4142  monooxygenase, FAD-binding  30.44 
 
 		 546 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0725  monooxygenase FAD-binding  29.04 
 
 		 571 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490959  normal  0.227588 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6034  monooxygenase FAD-binding protein  32.15 
 
 		 489 aa  161  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.829011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5796  putative monooxygenase  34.57 
 
 		 494 aa  161  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79596  normal  0.121142 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1620  pentachlorophenol 4-monooxygenase; PcpB  30.74 
 
 		 548 aa  160  7e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168334  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2966  FAD-dependent oxidoreductase  31.61 
 
 		 548 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2905  FAD-dependent oxidoreductase  31.61 
 
 		 548 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  29.98 
 
 		 546 aa  159  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3014  oxygenase  31.61 
 
 		 611 aa  159  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  33.92 
 
 		 414 aa  157  6e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  31.85 
 
 		 537 aa  157  7e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  31.6 
 
 		 511 aa  156  8e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0969  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  31.43 
 
 		 548 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2311  monooxygenase FAD-binding protein  34.74 
 
 		 408 aa  155  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4799  monooxygenase FAD-binding  29.24 
 
 		 477 aa  155  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2598  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  31.43 
 
 		 548 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2324  monooxygenase FAD-binding  30.03 
 
 		 547 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.261518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2290  monooxygenase FAD-binding protein  34.33 
 
 		 407 aa  153  8e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0452  pentachlorophenol 4-monooxygenase, putative  31.12 
 
 		 538 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0178  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  31.12 
 
 		 538 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.74497  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  32.81 
 
 		 388 aa  151  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1649  hypothetical protein  32.47 
 
 		 497 aa  151  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3025  monooxygenase FAD-binding  29.49 
 
 		 574 aa  151  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.114894  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3055  monooxygenase FAD-binding  30.9 
 
 		 408 aa  151  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0616  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.4 
 
 		 580 aa  150  4e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0962  putative monooxygenase, FAD-binding  30.5 
 
 		 574 aa  150  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0576419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2328  monooxygenase FAD-binding  33.16 
 
 		 480 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.238819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  30.1 
 
 		 506 aa  149  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5698  monooxygenase FAD-binding  28.54 
 
 		 531 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0767168 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5043  monooxygenase, FAD-binding  31.36 
 
 		 505 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  31.25 
 
 		 537 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1850  hypothetical protein  32.98 
 
 		 497 aa  146  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.790198 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>