More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3718 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_3718  monooxygenase, FAD-binding  100 
 
 
585 aa  1210    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3422  monooxygenase, FAD-binding  50.27 
 
 
550 aa  521  1e-146  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.448007  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5105  monooxygenase FAD-binding  56.3 
 
 
550 aa  518  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0715  FAD-dependent oxidoreductase  40.74 
 
 
558 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.520934  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0924  FAD-dependent oxidoreductase  39.78 
 
 
541 aa  371  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0698  FAD-dependent oxidoreductase  40.93 
 
 
555 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0786  FAD-dependent oxidoreductase  40.77 
 
 
553 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0334  FAD-dependent oxidoreductase  41.11 
 
 
553 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0817  FAD-dependent oxidoreductase  41.11 
 
 
553 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2566  FAD-dependent oxidoreductase  40.37 
 
 
555 aa  365  1e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3231  FAD-dependent oxidoreductase  41.64 
 
 
553 aa  363  4e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3216  FAD-dependent oxidoreductase  41.64 
 
 
553 aa  363  4e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3177  FAD-dependent oxidoreductase  41.64 
 
 
553 aa  362  9e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0291  FAD-dependent oxidoreductase  41.47 
 
 
545 aa  361  2e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339644  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2685  FAD-dependent oxidoreductase  41.45 
 
 
553 aa  360  5e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2059  FAD-dependent oxidoreductase  41.45 
 
 
553 aa  360  5e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0853  FAD-dependent oxidoreductase  41.45 
 
 
553 aa  360  5e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1924  FAD-dependent oxidoreductase  41.45 
 
 
553 aa  360  5e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.421754  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1395  FAD-dependent oxidoreductase  40.37 
 
 
553 aa  359  9.999999999999999e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1304  FAD-dependent oxidoreductase  38.45 
 
 
535 aa  357  2.9999999999999997e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26478  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3910  FAD-dependent oxidoreductase  45.07 
 
 
550 aa  355  1e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4535  FAD-dependent oxidoreductase  40.8 
 
 
563 aa  348  1e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000237964  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01747  FAD-dependent oxidoreductase  47.8 
 
 
563 aa  345  1e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.178537  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4218  FAD-dependent oxidoreductase  40.15 
 
 
579 aa  343  4e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0339  FAD-dependent oxidoreductase  40.11 
 
 
584 aa  340  5e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4050  FAD-dependent oxidoreductase  38.53 
 
 
570 aa  339  8e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000538899  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1323  FAD-dependent oxidoreductase  36.56 
 
 
545 aa  339  8e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7215  FAD-dependent oxidoreductase  38.66 
 
 
569 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0850  FAD-dependent oxidoreductase  38.22 
 
 
555 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0192309  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0428  FAD-dependent oxidoreductase  38.27 
 
 
569 aa  335  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00420765  normal  0.845447 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1196  FAD-dependent oxidoreductase  39.29 
 
 
554 aa  332  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0903  FAD-dependent oxidoreductase  38.06 
 
 
540 aa  331  2e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4661  FAD-dependent oxidoreductase  39.48 
 
 
559 aa  331  3e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.135002 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4529  FAD-dependent oxidoreductase  39.48 
 
 
559 aa  331  3e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.609398  normal  0.38599 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0579  FAD-dependent oxidoreductase  44.09 
 
 
558 aa  330  3e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1015  FAD-dependent oxidoreductase  38.53 
 
 
540 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.18031  normal  0.166528 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1432  FAD-dependent oxidoreductase  39.38 
 
 
546 aa  324  3e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.886265  normal  0.829223 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5156  FAD-dependent oxidoreductase  38.49 
 
 
535 aa  323  6e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328253  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4300  FAD-dependent oxidoreductase  44.79 
 
 
578 aa  322  9.999999999999999e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0563  FAD-dependent oxidoreductase  38.36 
 
 
544 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0888  FAD-dependent oxidoreductase  39.76 
 
 
535 aa  316  7e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0885397  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2624  FAD-dependent oxidoreductase  40.14 
 
 
535 aa  313  6.999999999999999e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.596702 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3815  FAD-dependent oxidoreductase  36.38 
 
 
541 aa  299  8e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.433248  normal  0.294357 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2727  FAD-dependent oxidoreductase  34.98 
 
 
570 aa  298  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00614764  normal  0.0524365 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4192  FAD-dependent oxidoreductase  34.27 
 
 
564 aa  293  8e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5380  FAD-dependent oxidoreductase  34.28 
 
 
583 aa  278  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189642  normal  0.0809664 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0776  FAD-dependent oxidoreductase  34.3 
 
 
524 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.790337  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1226  FAD-dependent oxidoreductase  33.87 
 
 
588 aa  272  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0875  FAD-dependent oxidoreductase  36.61 
 
 
581 aa  272  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.474503  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4123  FAD-dependent oxidoreductase  36.68 
 
 
577 aa  267  4e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000743874  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4781  monooxygenase FAD-binding  35.17 
 
 
572 aa  263  8e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4008  monooxygenase FAD-binding  37.05 
 
 
578 aa  257  4e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.245549  normal  0.525361 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3000  FAD-dependent oxidoreductase  33.52 
 
 
551 aa  250  5e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.296257 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3526  monooxygenase, FAD-binding  35.19 
 
 
586 aa  248  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.120911 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1867  monooxygenase FAD-binding protein  38.72 
 
 
594 aa  245  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167984  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1919  monooxygenase FAD-binding protein  38.18 
 
 
547 aa  241  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.136855  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5321  FAD-dependent oxidoreductase  34.6 
 
 
561 aa  241  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124532  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18980  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  37.99 
 
 
554 aa  239  8e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.099299  normal  0.679289 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4632  monooxygenase, FAD-binding  32.93 
 
 
557 aa  236  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0814  monooxygenase FAD-binding  35.73 
 
 
525 aa  206  9e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0653  monooxygenase, FAD-binding  35.01 
 
 
484 aa  199  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3777  monooxygenase FAD-binding protein  33.25 
 
 
504 aa  188  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.598965  hitchhiker  0.00382559 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  29.49 
 
 
546 aa  141  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5796  putative monooxygenase  30.21 
 
 
494 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79596  normal  0.121142 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4747  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.41 
 
 
574 aa  137  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649883  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  30.4 
 
 
414 aa  136  9e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2401  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  26.11 
 
 
569 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3440  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  26.29 
 
 
605 aa  133  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.845304  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  27.32 
 
 
506 aa  133  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0550  monooxygenase, FAD-binding  28.44 
 
 
548 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732263  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1029  monooxygenase, FAD-binding  28.44 
 
 
548 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0988  monooxygenase FAD-binding  28.44 
 
 
548 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622027  normal  0.120457 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2368  monooxygenase FAD-binding  28.44 
 
 
549 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128155  normal  0.778169 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0616  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  26.11 
 
 
580 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4142  monooxygenase, FAD-binding  28.23 
 
 
546 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372966  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3786  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27 
 
 
573 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3859  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27 
 
 
573 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3790  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27 
 
 
568 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829218 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2512  monooxygenase FAD-binding  25.36 
 
 
544 aa  128  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3267  monooxygenase FAD-binding  31.08 
 
 
486 aa  128  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2311  monooxygenase FAD-binding protein  29 
 
 
408 aa  127  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6034  monooxygenase FAD-binding protein  31.37 
 
 
489 aa  126  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.829011  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0905  monooxygenase FAD-binding  28.13 
 
 
550 aa  124  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.147157 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6487  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.78 
 
 
542 aa  124  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6722  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.78 
 
 
542 aa  124  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.792631  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  28.91 
 
 
388 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2290  monooxygenase FAD-binding protein  28.79 
 
 
407 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  28.44 
 
 
535 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4245  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.06 
 
 
569 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.525028  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1624  hypothetical protein  27.34 
 
 
502 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.459087  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  31.95 
 
 
493 aa  122  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  29.18 
 
 
537 aa  122  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  28.13 
 
 
511 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3183  monooxygenase FAD-binding  28.46 
 
 
511 aa  120  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2328  monooxygenase FAD-binding  28.57 
 
 
480 aa  120  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.238819  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1620  pentachlorophenol 4-monooxygenase; PcpB  27.37 
 
 
548 aa  120  7e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168334  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1717  hypothetical protein  27.77 
 
 
502 aa  120  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.587948  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  31.95 
 
 
486 aa  120  7.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3038  monooxygenase, FAD-binding  26.28 
 
 
409 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2135  monooxygenase FAD-binding  30.4 
 
 
540 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.218617  normal  0.0232179 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>