More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5380 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5380  FAD-dependent oxidoreductase  100 
 
 		 583 aa  1196    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189642  normal  0.0809664 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4123  FAD-dependent oxidoreductase  63.12 
 
 		 577 aa  691    Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000743874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2727  FAD-dependent oxidoreductase  62.99 
 
 		 570 aa  711    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00614764  normal  0.0524365 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1226  FAD-dependent oxidoreductase  85.93 
 
 		 588 aa  1026    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0875  FAD-dependent oxidoreductase  62.52 
 
 		 581 aa  697    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.474503  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4192  FAD-dependent oxidoreductase  64.37 
 
 		 564 aa  715    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4781  monooxygenase FAD-binding  51.18 
 
 		 572 aa  518  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3000  FAD-dependent oxidoreductase  49.46 
 
 		 551 aa  513  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.296257 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5321  FAD-dependent oxidoreductase  50.65 
 
 		 561 aa  499  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124532  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4632  monooxygenase, FAD-binding  45.52 
 
 		 557 aa  434  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4008  monooxygenase FAD-binding  43.71 
 
 		 578 aa  401  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.245549  normal  0.525361 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7215  FAD-dependent oxidoreductase  41.73 
 
 		 569 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0428  FAD-dependent oxidoreductase  40.85 
 
 		 569 aa  392  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00420765  normal  0.845447 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0291  FAD-dependent oxidoreductase  41.42 
 
 		 545 aa  390  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339644  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3526  monooxygenase, FAD-binding  45.13 
 
 		 586 aa  385  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.120911 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4218  FAD-dependent oxidoreductase  40.07 
 
 		 579 aa  375  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4050  FAD-dependent oxidoreductase  39.32 
 
 		 570 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000538899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0579  FAD-dependent oxidoreductase  39.46 
 
 		 558 aa  371  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1304  FAD-dependent oxidoreductase  37.31 
 
 		 535 aa  369  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0850  FAD-dependent oxidoreductase  39.24 
 
 		 555 aa  366  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0192309  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0339  FAD-dependent oxidoreductase  39.6 
 
 		 584 aa  356  5.999999999999999e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0715  FAD-dependent oxidoreductase  40.07 
 
 		 558 aa  354  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.520934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0698  FAD-dependent oxidoreductase  39.31 
 
 		 555 aa  353  5.9999999999999994e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0334  FAD-dependent oxidoreductase  39.42 
 
 		 553 aa  349  9e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0817  FAD-dependent oxidoreductase  39.42 
 
 		 553 aa  349  9e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4535  FAD-dependent oxidoreductase  39.32 
 
 		 563 aa  348  1e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000237964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0786  FAD-dependent oxidoreductase  39.24 
 
 		 553 aa  348  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3177  FAD-dependent oxidoreductase  38.16 
 
 		 553 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4661  FAD-dependent oxidoreductase  38.68 
 
 		 559 aa  343  5.999999999999999e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.135002 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4529  FAD-dependent oxidoreductase  38.68 
 
 		 559 aa  343  5.999999999999999e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.609398  normal  0.38599 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3231  FAD-dependent oxidoreductase  37.99 
 
 		 553 aa  342  8e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3216  FAD-dependent oxidoreductase  37.99 
 
 		 553 aa  342  8e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0924  FAD-dependent oxidoreductase  37 
 
 		 541 aa  342  1e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0903  FAD-dependent oxidoreductase  36.74 
 
 		 540 aa  340  5.9999999999999996e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2566  FAD-dependent oxidoreductase  38.26 
 
 		 555 aa  340  5.9999999999999996e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01747  FAD-dependent oxidoreductase  40.49 
 
 		 563 aa  339  7e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.178537  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2059  FAD-dependent oxidoreductase  37.81 
 
 		 553 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2685  FAD-dependent oxidoreductase  37.81 
 
 		 553 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0853  FAD-dependent oxidoreductase  37.81 
 
 		 553 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3910  FAD-dependent oxidoreductase  37.36 
 
 		 550 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1924  FAD-dependent oxidoreductase  37.81 
 
 		 553 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.421754  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1323  FAD-dependent oxidoreductase  35.32 
 
 		 545 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1395  FAD-dependent oxidoreductase  36.62 
 
 		 553 aa  333  4e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4300  FAD-dependent oxidoreductase  39.09 
 
 		 578 aa  331  2e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1196  FAD-dependent oxidoreductase  38.32 
 
 		 554 aa  323  5e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0563  FAD-dependent oxidoreductase  36.83 
 
 		 544 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5156  FAD-dependent oxidoreductase  36.26 
 
 		 535 aa  317  4e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328253  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1015  FAD-dependent oxidoreductase  36.3 
 
 		 540 aa  316  8e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.18031  normal  0.166528 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0888  FAD-dependent oxidoreductase  36.46 
 
 		 535 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0885397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2624  FAD-dependent oxidoreductase  37.18 
 
 		 535 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.596702 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0776  FAD-dependent oxidoreductase  40.33 
 
 		 524 aa  307  4.0000000000000004e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.790337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3815  FAD-dependent oxidoreductase  36.94 
 
 		 541 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.433248  normal  0.294357 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1432  FAD-dependent oxidoreductase  35.91 
 
 		 546 aa  296  9e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.886265  normal  0.829223 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3718  monooxygenase, FAD-binding  34.28 
 
 		 585 aa  278  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5105  monooxygenase FAD-binding  39.23 
 
 		 550 aa  276  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3422  monooxygenase, FAD-binding  33.8 
 
 		 550 aa  269  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.448007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1919  monooxygenase FAD-binding protein  33.76 
 
 		 547 aa  246  6.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.136855  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1867  monooxygenase FAD-binding protein  34.94 
 
 		 594 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18980  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  36.81 
 
 		 554 aa  239  9e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.099299  normal  0.679289 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0814  monooxygenase FAD-binding  37.06 
 
 		 525 aa  212  1e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3777  monooxygenase FAD-binding protein  30.4 
 
 		 504 aa  196  9e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.598965  hitchhiker  0.00382559 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0653  monooxygenase, FAD-binding  32.86 
 
 		 484 aa  193  6e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0616  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.76 
 
 		 580 aa  174  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3440  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.2 
 
 		 605 aa  172  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.845304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  29.26 
 
 		 546 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  32.87 
 
 		 537 aa  155  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4245  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.11 
 
 		 569 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.525028  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00301  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  26.67 
 
 		 554 aa  152  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00155662  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3259  monooxygenase FAD-binding protein  26.67 
 
 		 554 aa  152  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.257115  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2311  monooxygenase FAD-binding protein  30.92 
 
 		 408 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3278  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  26.48 
 
 		 554 aa  152  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0146118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00305  hypothetical protein  26.67 
 
 		 554 aa  152  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00161031  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0422  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  26.48 
 
 		 554 aa  153  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0411  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  26.48 
 
 		 554 aa  152  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0836277  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0371  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  26.48 
 
 		 554 aa  152  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0378  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  26.48 
 
 		 554 aa  151  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0214512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3786  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.99 
 
 		 573 aa  150  7e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3859  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.99 
 
 		 573 aa  150  7e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2290  monooxygenase FAD-binding protein  30.67 
 
 		 407 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3790  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.99 
 
 		 568 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829218 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  29.38 
 
 		 414 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2401  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.17 
 
 		 569 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1979  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.8 
 
 		 555 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623617  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  29.36 
 
 		 529 aa  148  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0623  monooxygenase FAD-binding  31.91 
 
 		 533 aa  147  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2377  hypothetical protein  28.67 
 
 		 553 aa  147  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.879652  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4747  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.77 
 
 		 574 aa  146  9e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5808  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.51 
 
 		 552 aa  146  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  28.18 
 
 		 511 aa  144  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  27.4 
 
 		 537 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  27.22 
 
 		 537 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  27.22 
 
 		 537 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6487  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.87 
 
 		 542 aa  139  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6722  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.87 
 
 		 542 aa  139  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.792631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6034  monooxygenase FAD-binding protein  29.97 
 
 		 489 aa  136  9e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.829011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3513  monooxygenase FAD-binding  30.2 
 
 		 587 aa  135  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  31.53 
 
 		 501 aa  134  5e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  29.81 
 
 		 535 aa  134  6e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0270  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.2 
 
 		 618 aa  133  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.385681  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1344  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  26.69 
 
 		 561 aa  133  9e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.430096  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>