More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5808 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5808  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  100 
 
 
552 aa  1128    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0616  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  44.91 
 
 
580 aa  430  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3440  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  43.83 
 
 
605 aa  412  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.845304  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5443  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase; 3-(3-hydroxy-phenyl)propionate hydroxylase FAD/NAD(P)-binding  50.24 
 
 
547 aa  408  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.728003  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1979  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  41.44 
 
 
555 aa  359  7e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623617  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6487  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  38.93 
 
 
542 aa  346  6e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6722  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  38.93 
 
 
542 aa  346  6e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.792631  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3259  monooxygenase FAD-binding protein  37.52 
 
 
554 aa  345  1e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.257115  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0378  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  38.02 
 
 
554 aa  345  1e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0214512  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00301  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  38.02 
 
 
554 aa  345  2e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00155662  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0411  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.33 
 
 
554 aa  344  2e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0836277  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0371  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.33 
 
 
554 aa  344  2e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00305  hypothetical protein  38.02 
 
 
554 aa  345  2e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00161031  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3278  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.33 
 
 
554 aa  344  2e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0146118  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0422  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.83 
 
 
554 aa  343  5e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0270  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.95 
 
 
618 aa  342  8e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.385681  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4535  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  36.55 
 
 
615 aa  331  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2329  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  36.14 
 
 
622 aa  329  7e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3786  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  38.29 
 
 
573 aa  327  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3859  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  38.29 
 
 
573 aa  327  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3790  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  38.31 
 
 
568 aa  325  2e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829218 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2401  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  41.01 
 
 
569 aa  320  5e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4245  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  38.14 
 
 
569 aa  318  2e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.525028  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1344  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.66 
 
 
561 aa  317  3e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.430096  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4747  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.88 
 
 
574 aa  314  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649883  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3513  monooxygenase FAD-binding  39.17 
 
 
587 aa  294  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6461  monooxygenase FAD-binding  38.9 
 
 
537 aa  288  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0929587  normal  0.112964 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4404  monooxygenase FAD-binding  38.43 
 
 
565 aa  279  9e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984317  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5086  monooxygenase, FAD-binding  38.19 
 
 
570 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5774  monooxygenase, FAD-binding  38.19 
 
 
570 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.750601 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0593  monooxygenase, FAD-binding  34.76 
 
 
520 aa  272  1e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5805  monooxygenase FAD-binding  37.95 
 
 
547 aa  268  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000018754  hitchhiker  0.00132409 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0928  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  36.86 
 
 
509 aa  257  3e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2893  monooxygenase FAD-binding  35.79 
 
 
564 aa  253  5.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0725  monooxygenase FAD-binding protein  36.08 
 
 
509 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.812372  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5585  putative FAD-binding monooxygenase  33.59 
 
 
514 aa  231  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.187805 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1541  monooxygenase FAD-binding  38.19 
 
 
497 aa  224  3e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1569  monooxygenase, FAD-binding  30.51 
 
 
525 aa  223  6e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7425  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  32.23 
 
 
503 aa  221  3e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4304  monooxygenase, FAD-binding  31.4 
 
 
520 aa  219  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4483  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  33.04 
 
 
555 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4906  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  32.39 
 
 
511 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0990  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.16 
 
 
507 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3413  monooxygenase, FAD-binding  36.16 
 
 
503 aa  209  9e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0619698  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0161  monooxygenase, FAD-binding  29.62 
 
 
530 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2814  monooxygenase FAD-binding protein  37.02 
 
 
537 aa  205  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0957884  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4947  monooxygenase FAD-binding protein  36.93 
 
 
481 aa  205  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1268  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  32.95 
 
 
530 aa  204  3e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5524  monooxygenase FAD-binding  34.54 
 
 
518 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000879135 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4834  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  34.52 
 
 
597 aa  167  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447643  decreased coverage  0.00803206 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4203  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  34.83 
 
 
555 aa  166  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18980  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  33.62 
 
 
554 aa  164  6e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.099299  normal  0.679289 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4123  FAD-dependent oxidoreductase  31.01 
 
 
577 aa  157  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000743874  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5043  monooxygenase, FAD-binding  28.81 
 
 
505 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483306  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2389  hypothetical protein  32.32 
 
 
557 aa  155  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  32.74 
 
 
537 aa  154  5.9999999999999996e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0875  FAD-dependent oxidoreductase  28.81 
 
 
581 aa  153  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.474503  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1919  monooxygenase FAD-binding protein  31.78 
 
 
547 aa  151  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.136855  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  34.88 
 
 
511 aa  152  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5321  FAD-dependent oxidoreductase  29.79 
 
 
561 aa  151  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124532  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2727  FAD-dependent oxidoreductase  30.83 
 
 
570 aa  151  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00614764  normal  0.0524365 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  32.51 
 
 
537 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  32.51 
 
 
537 aa  150  6e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  32.51 
 
 
537 aa  150  6e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1650  hypothetical protein  32.87 
 
 
502 aa  150  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2377  hypothetical protein  33.8 
 
 
553 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.879652  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1658  hypothetical protein  33.15 
 
 
502 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6800  monooxygenase FAD-binding  34.29 
 
 
518 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220979  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4529  FAD-dependent oxidoreductase  32.03 
 
 
559 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.609398  normal  0.38599 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4661  FAD-dependent oxidoreductase  32.03 
 
 
559 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.135002 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  36.06 
 
 
506 aa  149  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1867  monooxygenase FAD-binding protein  31.79 
 
 
594 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167984  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1624  hypothetical protein  32.87 
 
 
502 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.459087  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1717  hypothetical protein  32.87 
 
 
502 aa  147  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.587948  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5380  FAD-dependent oxidoreductase  29.51 
 
 
583 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189642  normal  0.0809664 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4588  monooxygenase FAD-binding  28.29 
 
 
555 aa  146  9e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1226  FAD-dependent oxidoreductase  29.46 
 
 
588 aa  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3290  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  34.43 
 
 
523 aa  144  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  32.61 
 
 
529 aa  144  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0623  monooxygenase FAD-binding  30.9 
 
 
533 aa  144  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4192  FAD-dependent oxidoreductase  26.74 
 
 
564 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3000  FAD-dependent oxidoreductase  28.31 
 
 
551 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.296257 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04210  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  34.39 
 
 
510 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  31.03 
 
 
414 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  31.96 
 
 
546 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  33.61 
 
 
501 aa  140  6e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1860  hypothetical protein  29.84 
 
 
498 aa  140  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.600833 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29830  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  31.03 
 
 
543 aa  140  7.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.832343 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  34.12 
 
 
493 aa  139  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  33.24 
 
 
481 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4799  monooxygenase FAD-binding  33.71 
 
 
477 aa  137  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4320  monooxygenase FAD-binding  33.64 
 
 
522 aa  137  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0724  monooxygenase, FAD-binding  30.53 
 
 
461 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3219  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  29.58 
 
 
545 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  33.23 
 
 
486 aa  137  7.000000000000001e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3750  monooxygenase, FAD-binding  30.65 
 
 
511 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0581872  normal  0.69653 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10582  FAD binding monooxygenase, putative (JCVI)  30.73 
 
 
566 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.832072  normal  0.150999 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0848  hypothetical protein  29.36 
 
 
511 aa  135  3e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.970878  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2512  monooxygenase FAD-binding  26.82 
 
 
544 aa  134  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  32.34 
 
 
388 aa  134  6e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>