More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4008 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4008  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 		 578 aa  1172    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.245549  normal  0.525361 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4192  FAD-dependent oxidoreductase  47.26 
 
 		 564 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2727  FAD-dependent oxidoreductase  46 
 
 		 570 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00614764  normal  0.0524365 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0875  FAD-dependent oxidoreductase  44.46 
 
 		 581 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.474503  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4123  FAD-dependent oxidoreductase  43.83 
 
 		 577 aa  427  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000743874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4781  monooxygenase FAD-binding  45.72 
 
 		 572 aa  415  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1226  FAD-dependent oxidoreductase  43.25 
 
 		 588 aa  413  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3000  FAD-dependent oxidoreductase  43.43 
 
 		 551 aa  410  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.296257 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5380  FAD-dependent oxidoreductase  43.71 
 
 		 583 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189642  normal  0.0809664 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5321  FAD-dependent oxidoreductase  44.16 
 
 		 561 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124532  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0339  FAD-dependent oxidoreductase  39.42 
 
 		 584 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0579  FAD-dependent oxidoreductase  39.58 
 
 		 558 aa  364  3e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1395  FAD-dependent oxidoreductase  40.26 
 
 		 553 aa  363  3e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4050  FAD-dependent oxidoreductase  37.34 
 
 		 570 aa  363  4e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000538899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3526  monooxygenase, FAD-binding  42.78 
 
 		 586 aa  362  9e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.120911 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4632  monooxygenase, FAD-binding  40.49 
 
 		 557 aa  362  1e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0291  FAD-dependent oxidoreductase  39.51 
 
 		 545 aa  361  2e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339644  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1196  FAD-dependent oxidoreductase  41.49 
 
 		 554 aa  359  8e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0850  FAD-dependent oxidoreductase  40.21 
 
 		 555 aa  359  8e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0192309  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0428  FAD-dependent oxidoreductase  38.27 
 
 		 569 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00420765  normal  0.845447 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4218  FAD-dependent oxidoreductase  39.38 
 
 		 579 aa  355  1e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3177  FAD-dependent oxidoreductase  39.2 
 
 		 553 aa  355  2e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3231  FAD-dependent oxidoreductase  39.2 
 
 		 553 aa  353  5e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3216  FAD-dependent oxidoreductase  39.2 
 
 		 553 aa  353  5e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7215  FAD-dependent oxidoreductase  38.11 
 
 		 569 aa  352  7e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1323  FAD-dependent oxidoreductase  38.25 
 
 		 545 aa  352  8e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0715  FAD-dependent oxidoreductase  38.64 
 
 		 558 aa  352  1e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.520934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1304  FAD-dependent oxidoreductase  38.01 
 
 		 535 aa  352  1e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2685  FAD-dependent oxidoreductase  39.02 
 
 		 553 aa  349  7e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2059  FAD-dependent oxidoreductase  39.02 
 
 		 553 aa  349  7e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0853  FAD-dependent oxidoreductase  39.02 
 
 		 553 aa  349  7e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1924  FAD-dependent oxidoreductase  39.02 
 
 		 553 aa  349  7e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.421754  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0334  FAD-dependent oxidoreductase  37.57 
 
 		 553 aa  349  7e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0817  FAD-dependent oxidoreductase  37.57 
 
 		 553 aa  349  7e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0698  FAD-dependent oxidoreductase  38.46 
 
 		 555 aa  348  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0786  FAD-dependent oxidoreductase  38.28 
 
 		 553 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2566  FAD-dependent oxidoreductase  38.64 
 
 		 555 aa  345  2e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0924  FAD-dependent oxidoreductase  38.61 
 
 		 541 aa  342  9e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3910  FAD-dependent oxidoreductase  37.73 
 
 		 550 aa  339  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4535  FAD-dependent oxidoreductase  38.62 
 
 		 563 aa  338  1.9999999999999998e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000237964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0903  FAD-dependent oxidoreductase  39.12 
 
 		 540 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4661  FAD-dependent oxidoreductase  37.75 
 
 		 559 aa  334  2e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.135002 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4529  FAD-dependent oxidoreductase  37.75 
 
 		 559 aa  334  2e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.609398  normal  0.38599 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3815  FAD-dependent oxidoreductase  38.58 
 
 		 541 aa  318  2e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.433248  normal  0.294357 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0776  FAD-dependent oxidoreductase  37.94 
 
 		 524 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.790337  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01747  FAD-dependent oxidoreductase  37.67 
 
 		 563 aa  311  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.178537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4300  FAD-dependent oxidoreductase  37.52 
 
 		 578 aa  310  2.9999999999999997e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2624  FAD-dependent oxidoreductase  39.13 
 
 		 535 aa  311  2.9999999999999997e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.596702 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1015  FAD-dependent oxidoreductase  36.77 
 
 		 540 aa  309  6.999999999999999e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.18031  normal  0.166528 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5156  FAD-dependent oxidoreductase  38.35 
 
 		 535 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328253  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0888  FAD-dependent oxidoreductase  38.27 
 
 		 535 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0885397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0563  FAD-dependent oxidoreductase  36.15 
 
 		 544 aa  297  3e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1432  FAD-dependent oxidoreductase  35.99 
 
 		 546 aa  278  1e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.886265  normal  0.829223 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5105  monooxygenase FAD-binding  39.51 
 
 		 550 aa  279  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3422  monooxygenase, FAD-binding  38.48 
 
 		 550 aa  275  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.448007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3718  monooxygenase, FAD-binding  37.05 
 
 		 585 aa  257  4e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18980  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  36.12 
 
 		 554 aa  236  7e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.099299  normal  0.679289 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1919  monooxygenase FAD-binding protein  36.02 
 
 		 547 aa  232  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.136855  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1867  monooxygenase FAD-binding protein  35.09 
 
 		 594 aa  220  7e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0814  monooxygenase FAD-binding  36.63 
 
 		 525 aa  209  1e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0653  monooxygenase, FAD-binding  33.16 
 
 		 484 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3777  monooxygenase FAD-binding protein  31.56 
 
 		 504 aa  176  9e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.598965  hitchhiker  0.00382559 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0623  monooxygenase FAD-binding  34.05 
 
 		 533 aa  164  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  30.56 
 
 		 501 aa  163  8.000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  29.8 
 
 		 537 aa  154  5.9999999999999996e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3440  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.02 
 
 		 605 aa  150  7e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.845304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2311  monooxygenase FAD-binding protein  33.33 
 
 		 408 aa  147  6e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  31.77 
 
 		 414 aa  147  8.000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1569  monooxygenase, FAD-binding  29.12 
 
 		 525 aa  145  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2227  monooxygenase FAD-binding  34.63 
 
 		 552 aa  144  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465072  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3786  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.93 
 
 		 573 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3790  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.89 
 
 		 568 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829218 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3859  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.93 
 
 		 573 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  30.04 
 
 		 546 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0616  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.67 
 
 		 580 aa  141  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4747  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.54 
 
 		 574 aa  141  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0270  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.82 
 
 		 618 aa  139  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.385681  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2290  monooxygenase FAD-binding protein  32.5 
 
 		 407 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1979  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.13 
 
 		 555 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623617  normal  0.147267 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3259  monooxygenase FAD-binding protein  25.99 
 
 		 554 aa  137  5e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.257115  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3278  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  25.81 
 
 		 554 aa  137  5e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0146118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0371  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  25.81 
 
 		 554 aa  137  5e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0411  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  25.81 
 
 		 554 aa  137  5e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0836277  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00301  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  25.99 
 
 		 554 aa  137  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00155662  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00305  hypothetical protein  25.99 
 
 		 554 aa  137  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00161031  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0378  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  25.81 
 
 		 554 aa  137  8e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0214512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0422  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  25.81 
 
 		 554 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2329  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.06 
 
 		 622 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0962  putative monooxygenase, FAD-binding  28.41 
 
 		 574 aa  135  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0576419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6034  monooxygenase FAD-binding protein  31.48 
 
 		 489 aa  134  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.829011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2324  monooxygenase FAD-binding  28.33 
 
 		 547 aa  134  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.261518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0143  monooxygenase FAD-binding protein  31.79 
 
 		 968 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6487  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.5 
 
 		 542 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6722  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.5 
 
 		 542 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.792631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5043  monooxygenase, FAD-binding  29.51 
 
 		 505 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2401  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.99 
 
 		 569 aa  130  8.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  29.23 
 
 		 537 aa  130  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  29.23 
 
 		 537 aa  130  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  29.34 
 
 		 537 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5698  monooxygenase FAD-binding  27.6 
 
 		 531 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0767168 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>