More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_6487 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008062  Bcen_6487  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  100 
 
 
542 aa  1107    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6722  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  100 
 
 
542 aa  1107    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.792631  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00301  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  42.36 
 
 
554 aa  431  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00155662  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3259  monooxygenase FAD-binding protein  42.17 
 
 
554 aa  429  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.257115  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0378  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  42.36 
 
 
554 aa  431  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0214512  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0411  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  41.99 
 
 
554 aa  429  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0836277  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3278  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  41.99 
 
 
554 aa  430  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0146118  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0371  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  41.99 
 
 
554 aa  429  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00305  hypothetical protein  42.36 
 
 
554 aa  431  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00161031  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1979  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  44.19 
 
 
555 aa  428  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623617  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0422  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  41.99 
 
 
554 aa  426  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4535  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  41.64 
 
 
615 aa  410  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2329  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  41.26 
 
 
622 aa  409  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4747  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  42.29 
 
 
574 aa  396  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649883  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3786  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  41.76 
 
 
573 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3859  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  41.76 
 
 
573 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0270  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  39.24 
 
 
618 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.385681  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3790  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  41.57 
 
 
568 aa  395  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829218 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2401  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  41.88 
 
 
569 aa  393  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1344  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  38.83 
 
 
561 aa  381  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.430096  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4245  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  40.42 
 
 
569 aa  380  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.525028  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5808  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  38.93 
 
 
552 aa  347  4e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2893  monooxygenase FAD-binding  35.81 
 
 
564 aa  327  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0616  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  36.9 
 
 
580 aa  325  1e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3440  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.27 
 
 
605 aa  322  9.000000000000001e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.845304  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3513  monooxygenase FAD-binding  33.27 
 
 
587 aa  293  5e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5443  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase; 3-(3-hydroxy-phenyl)propionate hydroxylase FAD/NAD(P)-binding  37.06 
 
 
547 aa  293  6e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.728003  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5805  monooxygenase FAD-binding  36.75 
 
 
547 aa  278  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000018754  hitchhiker  0.00132409 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0593  monooxygenase, FAD-binding  33.27 
 
 
520 aa  266  7e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0928  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  35.96 
 
 
509 aa  257  3e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5086  monooxygenase, FAD-binding  36.76 
 
 
570 aa  253  7e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5774  monooxygenase, FAD-binding  36.76 
 
 
570 aa  253  7e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.750601 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4404  monooxygenase FAD-binding  36.76 
 
 
565 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984317  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6461  monooxygenase FAD-binding  34.5 
 
 
537 aa  246  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0929587  normal  0.112964 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5585  putative FAD-binding monooxygenase  33.46 
 
 
514 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.187805 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7425  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  33.99 
 
 
503 aa  235  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3413  monooxygenase, FAD-binding  36.44 
 
 
503 aa  235  2.0000000000000002e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0619698  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1569  monooxygenase, FAD-binding  32.82 
 
 
525 aa  227  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4304  monooxygenase, FAD-binding  32.49 
 
 
520 aa  227  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0725  monooxygenase FAD-binding protein  35.47 
 
 
509 aa  224  4e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.812372  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0990  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  32.95 
 
 
507 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0161  monooxygenase, FAD-binding  29.47 
 
 
530 aa  217  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4947  monooxygenase FAD-binding protein  33.13 
 
 
481 aa  208  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1541  monooxygenase FAD-binding  30.61 
 
 
497 aa  205  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4906  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.53 
 
 
511 aa  203  6e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2814  monooxygenase FAD-binding protein  31.45 
 
 
537 aa  197  4.0000000000000005e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0957884  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1268  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.93 
 
 
530 aa  181  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4483  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.56 
 
 
555 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5524  monooxygenase FAD-binding  27.82 
 
 
518 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000879135 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4834  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.52 
 
 
597 aa  159  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447643  decreased coverage  0.00803206 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4529  FAD-dependent oxidoreductase  30.51 
 
 
559 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.609398  normal  0.38599 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4661  FAD-dependent oxidoreductase  30.51 
 
 
559 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.135002 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4050  FAD-dependent oxidoreductase  28.65 
 
 
570 aa  145  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000538899  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3290  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.14 
 
 
523 aa  142  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  29.02 
 
 
506 aa  142  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4123  FAD-dependent oxidoreductase  26.41 
 
 
577 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000743874  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0875  FAD-dependent oxidoreductase  26.35 
 
 
581 aa  140  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.474503  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5380  FAD-dependent oxidoreductase  27.87 
 
 
583 aa  139  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189642  normal  0.0809664 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4192  FAD-dependent oxidoreductase  28.68 
 
 
564 aa  138  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4203  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.81 
 
 
555 aa  137  5e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0623  monooxygenase FAD-binding  31.62 
 
 
533 aa  137  7.000000000000001e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1226  FAD-dependent oxidoreductase  27.74 
 
 
588 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  33.53 
 
 
537 aa  135  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3894  monooxygenase FAD-binding  29.32 
 
 
540 aa  134  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0436183  normal  0.0134982 
 
 
-
 
NC_003296  RS01747  FAD-dependent oxidoreductase  29.38 
 
 
563 aa  133  7.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.178537  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4008  monooxygenase FAD-binding  29.5 
 
 
578 aa  133  7.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.245549  normal  0.525361 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10582  FAD binding monooxygenase, putative (JCVI)  27.63 
 
 
566 aa  133  9e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.832072  normal  0.150999 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0428  FAD-dependent oxidoreductase  27.52 
 
 
569 aa  133  9e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00420765  normal  0.845447 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2389  hypothetical protein  31.46 
 
 
557 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0776  FAD-dependent oxidoreductase  29.05 
 
 
524 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.790337  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5321  FAD-dependent oxidoreductase  27.9 
 
 
561 aa  131  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124532  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3910  FAD-dependent oxidoreductase  30.56 
 
 
550 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0579  FAD-dependent oxidoreductase  26.94 
 
 
558 aa  130  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7215  FAD-dependent oxidoreductase  30.63 
 
 
569 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2566  FAD-dependent oxidoreductase  27.92 
 
 
555 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2727  FAD-dependent oxidoreductase  27.75 
 
 
570 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00614764  normal  0.0524365 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  31.23 
 
 
475 aa  128  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4218  FAD-dependent oxidoreductase  27.24 
 
 
579 aa  128  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0339  FAD-dependent oxidoreductase  30.29 
 
 
584 aa  128  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0227  monooxygenase FAD-binding  30.49 
 
 
596 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1196  FAD-dependent oxidoreductase  29.24 
 
 
554 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0924  FAD-dependent oxidoreductase  25.47 
 
 
541 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5796  putative monooxygenase  33.33 
 
 
494 aa  127  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79596  normal  0.121142 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0334  FAD-dependent oxidoreductase  30.29 
 
 
553 aa  127  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0786  FAD-dependent oxidoreductase  29.84 
 
 
553 aa  127  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0817  FAD-dependent oxidoreductase  30.29 
 
 
553 aa  127  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0850  FAD-dependent oxidoreductase  27.33 
 
 
555 aa  127  7e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0192309  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4535  FAD-dependent oxidoreductase  29.27 
 
 
563 aa  125  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000237964  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  31.37 
 
 
501 aa  125  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5043  monooxygenase, FAD-binding  28.77 
 
 
505 aa  124  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483306  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  30.77 
 
 
511 aa  124  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3718  monooxygenase, FAD-binding  27.78 
 
 
585 aa  124  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0724  monooxygenase, FAD-binding  29.35 
 
 
461 aa  124  6e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3750  monooxygenase, FAD-binding  28.88 
 
 
511 aa  124  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0581872  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1395  FAD-dependent oxidoreductase  30.21 
 
 
553 aa  124  6e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0291  FAD-dependent oxidoreductase  29.13 
 
 
545 aa  123  8e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339644  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4781  monooxygenase FAD-binding  26.78 
 
 
572 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4799  monooxygenase FAD-binding  28.3 
 
 
477 aa  122  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0848  hypothetical protein  27.97 
 
 
511 aa  122  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.970878  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0814  monooxygenase FAD-binding  30.79 
 
 
525 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>