More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4300 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_3216  FAD-dependent oxidoreductase  64.26 
 
 		 553 aa  681    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2566  FAD-dependent oxidoreductase  64.45 
 
 		 555 aa  682    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0715  FAD-dependent oxidoreductase  63.72 
 
 		 558 aa  674    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.520934  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01747  FAD-dependent oxidoreductase  64.55 
 
 		 563 aa  655    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.178537  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2059  FAD-dependent oxidoreductase  63.91 
 
 		 553 aa  675    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4661  FAD-dependent oxidoreductase  62.7 
 
 		 559 aa  665    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.135002 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7215  FAD-dependent oxidoreductase  61.34 
 
 		 569 aa  698    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4218  FAD-dependent oxidoreductase  65.26 
 
 		 579 aa  729    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3231  FAD-dependent oxidoreductase  64.26 
 
 		 553 aa  681    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3910  FAD-dependent oxidoreductase  65.67 
 
 		 550 aa  681    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0291  FAD-dependent oxidoreductase  68.14 
 
 		 545 aa  759    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339644  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1395  FAD-dependent oxidoreductase  65.38 
 
 		 553 aa  691    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2685  FAD-dependent oxidoreductase  63.91 
 
 		 553 aa  675    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4535  FAD-dependent oxidoreductase  73.14 
 
 		 563 aa  786    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000237964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0428  FAD-dependent oxidoreductase  62 
 
 		 569 aa  703    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00420765  normal  0.845447 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4050  FAD-dependent oxidoreductase  60.42 
 
 		 570 aa  681    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000538899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0339  FAD-dependent oxidoreductase  63.49 
 
 		 584 aa  689    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0334  FAD-dependent oxidoreductase  65.9 
 
 		 553 aa  690    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0698  FAD-dependent oxidoreductase  63.67 
 
 		 555 aa  672    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0853  FAD-dependent oxidoreductase  63.91 
 
 		 553 aa  675    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1924  FAD-dependent oxidoreductase  63.91 
 
 		 553 aa  675    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.421754  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0817  FAD-dependent oxidoreductase  65.9 
 
 		 553 aa  690    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0786  FAD-dependent oxidoreductase  66.08 
 
 		 553 aa  689    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3177  FAD-dependent oxidoreductase  64.44 
 
 		 553 aa  681    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4300  FAD-dependent oxidoreductase  100 
 
 		 578 aa  1162    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0579  FAD-dependent oxidoreductase  68.5 
 
 		 558 aa  725    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4529  FAD-dependent oxidoreductase  62.7 
 
 		 559 aa  665    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.609398  normal  0.38599 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0850  FAD-dependent oxidoreductase  56.47 
 
 		 555 aa  604  1.0000000000000001e-171  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0192309  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1304  FAD-dependent oxidoreductase  55.93 
 
 		 535 aa  603  1.0000000000000001e-171  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1323  FAD-dependent oxidoreductase  56.3 
 
 		 545 aa  594  1e-168  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0903  FAD-dependent oxidoreductase  56.41 
 
 		 540 aa  587  1e-166  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0924  FAD-dependent oxidoreductase  54.8 
 
 		 541 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1015  FAD-dependent oxidoreductase  56.33 
 
 		 540 aa  549  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.18031  normal  0.166528 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5156  FAD-dependent oxidoreductase  55.19 
 
 		 535 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328253  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0888  FAD-dependent oxidoreductase  54.93 
 
 		 535 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0885397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1196  FAD-dependent oxidoreductase  55.43 
 
 		 554 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2624  FAD-dependent oxidoreductase  54.23 
 
 		 535 aa  536  1e-151  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.596702 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0563  FAD-dependent oxidoreductase  52.63 
 
 		 544 aa  529  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3815  FAD-dependent oxidoreductase  51.48 
 
 		 541 aa  512  1e-144  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.433248  normal  0.294357 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1432  FAD-dependent oxidoreductase  50.7 
 
 		 546 aa  491  1e-137  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.886265  normal  0.829223 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0776  FAD-dependent oxidoreductase  50.19 
 
 		 524 aa  480  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.790337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2727  FAD-dependent oxidoreductase  43.35 
 
 		 570 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00614764  normal  0.0524365 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4192  FAD-dependent oxidoreductase  42.78 
 
 		 564 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0875  FAD-dependent oxidoreductase  41.45 
 
 		 581 aa  392  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.474503  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4123  FAD-dependent oxidoreductase  40.44 
 
 		 577 aa  386  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000743874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3422  monooxygenase, FAD-binding  40.92 
 
 		 550 aa  381  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.448007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5105  monooxygenase FAD-binding  41.73 
 
 		 550 aa  375  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5380  FAD-dependent oxidoreductase  38.91 
 
 		 583 aa  361  2e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189642  normal  0.0809664 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1226  FAD-dependent oxidoreductase  38.27 
 
 		 588 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3000  FAD-dependent oxidoreductase  39.04 
 
 		 551 aa  351  2e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.296257 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4008  monooxygenase FAD-binding  37.86 
 
 		 578 aa  342  8e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.245549  normal  0.525361 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3718  monooxygenase, FAD-binding  39.1 
 
 		 585 aa  342  1e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5321  FAD-dependent oxidoreductase  39.67 
 
 		 561 aa  340  5.9999999999999996e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124532  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4781  monooxygenase FAD-binding  37.13 
 
 		 572 aa  335  1e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3526  monooxygenase, FAD-binding  40.99 
 
 		 586 aa  331  2e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.120911 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18980  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  39.02 
 
 		 554 aa  319  7.999999999999999e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.099299  normal  0.679289 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4632  monooxygenase, FAD-binding  37.08 
 
 		 557 aa  300  5e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1919  monooxygenase FAD-binding protein  36.89 
 
 		 547 aa  280  6e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.136855  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1867  monooxygenase FAD-binding protein  36.48 
 
 		 594 aa  274  3e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0653  monooxygenase, FAD-binding  37.63 
 
 		 484 aa  246  8e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0814  monooxygenase FAD-binding  35.38 
 
 		 525 aa  238  2e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3777  monooxygenase FAD-binding protein  33.57 
 
 		 504 aa  229  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.598965  hitchhiker  0.00382559 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  32.34 
 
 		 546 aa  166  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0905  monooxygenase FAD-binding  31.01 
 
 		 550 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.147157 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5043  monooxygenase, FAD-binding  30.45 
 
 		 505 aa  154  5.9999999999999996e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3055  monooxygenase FAD-binding  31.81 
 
 		 408 aa  153  8e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3790  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.02 
 
 		 568 aa  153  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829218 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  32.75 
 
 		 537 aa  152  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3786  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.02 
 
 		 573 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3859  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.02 
 
 		 573 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0623  monooxygenase FAD-binding  28.81 
 
 		 533 aa  151  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0893  monooxygenase, FAD-binding  30.46 
 
 		 550 aa  151  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207082  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2368  monooxygenase FAD-binding  30.14 
 
 		 549 aa  151  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128155  normal  0.778169 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4142  monooxygenase, FAD-binding  29.7 
 
 		 546 aa  150  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1649  hypothetical protein  30.61 
 
 		 497 aa  150  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0550  monooxygenase, FAD-binding  31.01 
 
 		 548 aa  150  9e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732263  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1029  monooxygenase, FAD-binding  31.01 
 
 		 548 aa  150  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6034  monooxygenase FAD-binding protein  30.45 
 
 		 489 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.829011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2311  monooxygenase FAD-binding protein  33.73 
 
 		 408 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  33.07 
 
 		 414 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0988  monooxygenase FAD-binding  31.19 
 
 		 548 aa  147  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622027  normal  0.120457 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1620  pentachlorophenol 4-monooxygenase; PcpB  31.05 
 
 		 548 aa  147  8.000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168334  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0616  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.67 
 
 		 580 aa  145  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  31.92 
 
 		 486 aa  145  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  31.79 
 
 		 493 aa  145  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2290  monooxygenase FAD-binding protein  32.83 
 
 		 407 aa  145  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5698  monooxygenase FAD-binding  28.87 
 
 		 531 aa  144  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0767168 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3014  oxygenase  30.52 
 
 		 611 aa  143  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3025  monooxygenase FAD-binding  29.9 
 
 		 574 aa  143  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.114894  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2905  FAD-dependent oxidoreductase  30.52 
 
 		 548 aa  143  8e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2966  FAD-dependent oxidoreductase  30.52 
 
 		 548 aa  143  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3440  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.98 
 
 		 605 aa  142  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.845304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5009  monooxygenase, FAD-binding  30.45 
 
 		 506 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3267  monooxygenase FAD-binding  31.54 
 
 		 486 aa  141  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3183  monooxygenase FAD-binding  28.98 
 
 		 511 aa  141  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0962  putative monooxygenase, FAD-binding  30.69 
 
 		 574 aa  140  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0576419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3793  monooxygenase, FAD-binding  32.29 
 
 		 524 aa  140  7.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.791839  normal  0.0125936 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2598  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  30.34 
 
 		 548 aa  140  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0969  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  30.34 
 
 		 548 aa  140  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1567  monooxygenase, FAD-binding  32.71 
 
 		 478 aa  140  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>