More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_0550 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009074  BURPS668_2905  FAD-dependent oxidoreductase  73.33 
 
 		 548 aa  757    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2966  FAD-dependent oxidoreductase  73.33 
 
 		 548 aa  757    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0725  monooxygenase FAD-binding  63.93 
 
 		 571 aa  694    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490959  normal  0.227588 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0452  pentachlorophenol 4-monooxygenase, putative  72.68 
 
 		 538 aa  746    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0178  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  72.68 
 
 		 538 aa  746    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.74497  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0905  monooxygenase FAD-binding  87.66 
 
 		 550 aa  939    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.147157 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3014  oxygenase  73.33 
 
 		 611 aa  755    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4142  monooxygenase, FAD-binding  90.88 
 
 		 546 aa  968    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1620  pentachlorophenol 4-monooxygenase; PcpB  73.01 
 
 		 548 aa  754    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168334  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2598  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  72.96 
 
 		 548 aa  753    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0962  putative monooxygenase, FAD-binding  64.99 
 
 		 574 aa  722    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0576419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2368  monooxygenase FAD-binding  83.46 
 
 		 549 aa  902    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128155  normal  0.778169 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0969  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  72.96 
 
 		 548 aa  753    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3025  monooxygenase FAD-binding  63.93 
 
 		 574 aa  720    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.114894  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0988  monooxygenase FAD-binding  98.18 
 
 		 548 aa  1070    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622027  normal  0.120457 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0550  monooxygenase, FAD-binding  100 
 
 		 548 aa  1085    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732263  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0893  monooxygenase, FAD-binding  87.48 
 
 		 550 aa  936    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207082  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1029  monooxygenase, FAD-binding  100 
 
 		 548 aa  1085    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2512  monooxygenase FAD-binding  33.83 
 
 		 544 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3267  monooxygenase FAD-binding  43.4 
 
 		 486 aa  276  9e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  43.03 
 
 		 493 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  43.03 
 
 		 486 aa  267  4e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3750  monooxygenase, FAD-binding  37.07 
 
 		 511 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0581872  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  40.61 
 
 		 414 aa  252  1e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  34.71 
 
 		 535 aa  239  6.999999999999999e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0724  monooxygenase, FAD-binding  37.06 
 
 		 461 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1544  monooxygenase, FAD-binding protein  38.17 
 
 		 478 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.585572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1567  monooxygenase, FAD-binding  38.17 
 
 		 478 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1515  monooxygenase, FAD-binding  38 
 
 		 478 aa  225  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  36.3 
 
 		 481 aa  224  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0750  monooxygenase FAD-binding protein  34.09 
 
 		 485 aa  224  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0161  monooxygenase FAD-binding protein  37.81 
 
 		 493 aa  224  4e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2227  monooxygenase FAD-binding  35.54 
 
 		 552 aa  223  7e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465072  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2135  monooxygenase FAD-binding  38.48 
 
 		 540 aa  222  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.218617  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  36.69 
 
 		 511 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3079  monooxygenase FAD-binding protein  37.95 
 
 		 503 aa  220  6e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.0830218 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4133  pentachlorophenol monooxygenase  36.76 
 
 		 479 aa  219  7e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6800  monooxygenase FAD-binding  37.5 
 
 		 518 aa  219  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220979  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  37.03 
 
 		 388 aa  217  4e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5043  monooxygenase, FAD-binding  34.96 
 
 		 505 aa  217  5e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  35.42 
 
 		 501 aa  215  9.999999999999999e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2162  monooxygenase FAD-binding  37.25 
 
 		 477 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351168  decreased coverage  0.00237783 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2055  monooxygenase, FAD-binding  36.78 
 
 		 486 aa  213  5.999999999999999e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1649  hypothetical protein  35.3 
 
 		 497 aa  212  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2585  monooxygenase FAD-binding protein  36.27 
 
 		 479 aa  211  3e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2377  hypothetical protein  34.24 
 
 		 553 aa  209  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.879652  normal  0.249541 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10582  FAD binding monooxygenase, putative (JCVI)  30.39 
 
 		 566 aa  208  2e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.832072  normal  0.150999 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2324  monooxygenase FAD-binding  31.87 
 
 		 547 aa  208  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.261518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  35.76 
 
 		 537 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4799  monooxygenase FAD-binding  35.73 
 
 		 477 aa  205  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  33.39 
 
 		 537 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  33.39 
 
 		 537 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2111  monooxygenase, FAD-binding  38.12 
 
 		 511 aa  203  6e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.0054618  normal  0.499354 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0143  monooxygenase FAD-binding protein  34.03 
 
 		 968 aa  203  8e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  32.53 
 
 		 529 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2454  regulatory proteins, IclR  29.37 
 
 		 575 aa  201  3e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.283629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4669  hypothetical protein  35.68 
 
 		 515 aa  199  7.999999999999999e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679977  normal  0.120633 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1216  hypothetical protein  35.54 
 
 		 486 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.795806  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3183  monooxygenase FAD-binding  36.03 
 
 		 511 aa  199  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1940  monooxygenase, FAD-binding  31.64 
 
 		 489 aa  199  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1850  hypothetical protein  34.18 
 
 		 497 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2748  monooxygenase FAD-binding protein  38.74 
 
 		 489 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  35.9 
 
 		 546 aa  196  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2661  monooxygenase, FAD-binding protein  36.34 
 
 		 473 aa  194  4e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2691  monooxygenase, FAD-binding  36.34 
 
 		 473 aa  194  4e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2706  monooxygenase, FAD-binding  36.34 
 
 		 473 aa  194  4e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5698  monooxygenase FAD-binding  29.96 
 
 		 531 aa  193  6e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0767168 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0090  hypothetical protein  33.21 
 
 		 497 aa  192  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5796  putative monooxygenase  40.06 
 
 		 494 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79596  normal  0.121142 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1342  monooxygenase FAD-binding protein  35.45 
 
 		 496 aa  192  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0599  monooxygenase FAD-binding protein  33.9 
 
 		 488 aa  191  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1498  monooxygenase, FAD-binding  35.37 
 
 		 477 aa  190  4e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.106253  normal  0.474209 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2013  monooxygenase FAD-binding  38.66 
 
 		 475 aa  189  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  34.86 
 
 		 475 aa  189  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0779  monooxygenase, FAD-binding  35.13 
 
 		 500 aa  189  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.813515  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4431  monooxygenase FAD-binding protein  33.93 
 
 		 474 aa  187  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.412484 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1818  YhjG  28.3 
 
 		 483 aa  187  6e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.214491 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  34.1 
 
 		 506 aa  187  6e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3372  monooxygenase FAD-binding protein  37.78 
 
 		 553 aa  186  8e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5009  monooxygenase, FAD-binding  36.14 
 
 		 506 aa  184  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  38.57 
 
 		 506 aa  183  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2328  monooxygenase FAD-binding  35.54 
 
 		 480 aa  182  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.238819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1484  hypothetical protein  32.35 
 
 		 499 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115631  normal  0.323666 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3217  monooxygenase FAD-binding protein  33.92 
 
 		 488 aa  180  8e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0996184  hitchhiker  0.0000000987139 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6034  monooxygenase FAD-binding protein  35.9 
 
 		 489 aa  179  9e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.829011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5651  monooxygenase FAD-binding  32.37 
 
 		 547 aa  179  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0715  FAD-dependent oxidoreductase  30.48 
 
 		 558 aa  177  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.520934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1860  hypothetical protein  32.44 
 
 		 498 aa  177  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.600833 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0334  FAD-dependent oxidoreductase  30.48 
 
 		 553 aa  176  8e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0817  FAD-dependent oxidoreductase  30.48 
 
 		 553 aa  176  8e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0786  FAD-dependent oxidoreductase  30.2 
 
 		 553 aa  176  9e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0698  FAD-dependent oxidoreductase  30.48 
 
 		 555 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3131  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  27.49 
 
 		 483 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3543  monooxygenase FAD-binding  32.84 
 
 		 489 aa  175  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0404  monooxygenase FAD-binding protein  31.63 
 
 		 496 aa  173  6.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2566  FAD-dependent oxidoreductase  30.35 
 
 		 555 aa  172  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0291  FAD-dependent oxidoreductase  30.9 
 
 		 545 aa  171  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339644  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4320  monooxygenase FAD-binding  34.73 
 
 		 522 aa  170  6e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4661  FAD-dependent oxidoreductase  31.9 
 
 		 559 aa  170  7e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.135002 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4529  FAD-dependent oxidoreductase  31.9 
 
 		 559 aa  170  7e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.609398  normal  0.38599 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>