More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3055 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3055  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 
408 aa  845    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1039  monooxygenase FAD-binding  42.32 
 
 
402 aa  288  1e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.460547  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6603  monooxygenase FAD-binding protein  37.47 
 
 
400 aa  240  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145948  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3774  monooxygenase, FAD-binding  34.84 
 
 
397 aa  236  4e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.343223  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2566  FAD-dependent oxidoreductase  31.52 
 
 
555 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0786  FAD-dependent oxidoreductase  31.99 
 
 
553 aa  170  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3177  FAD-dependent oxidoreductase  31.5 
 
 
553 aa  169  6e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3910  FAD-dependent oxidoreductase  31.41 
 
 
550 aa  169  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0334  FAD-dependent oxidoreductase  31.99 
 
 
553 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0817  FAD-dependent oxidoreductase  31.99 
 
 
553 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3216  FAD-dependent oxidoreductase  31.5 
 
 
553 aa  169  7e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3231  FAD-dependent oxidoreductase  31.5 
 
 
553 aa  169  7e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0715  FAD-dependent oxidoreductase  31.99 
 
 
558 aa  169  8e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.520934  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1395  FAD-dependent oxidoreductase  31.5 
 
 
553 aa  169  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0698  FAD-dependent oxidoreductase  31.7 
 
 
555 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2685  FAD-dependent oxidoreductase  31.21 
 
 
553 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2059  FAD-dependent oxidoreductase  31.21 
 
 
553 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0853  FAD-dependent oxidoreductase  31.21 
 
 
553 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1924  FAD-dependent oxidoreductase  31.21 
 
 
553 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.421754  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0291  FAD-dependent oxidoreductase  30.9 
 
 
545 aa  165  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339644  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  30.22 
 
 
535 aa  160  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  30.99 
 
 
537 aa  160  6e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0776  FAD-dependent oxidoreductase  30.65 
 
 
524 aa  158  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.790337  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6034  monooxygenase FAD-binding protein  30.54 
 
 
489 aa  156  7e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.829011  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0924  FAD-dependent oxidoreductase  30.46 
 
 
541 aa  156  8e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4747  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.58 
 
 
574 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649883  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1304  FAD-dependent oxidoreductase  29.63 
 
 
535 aa  155  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26478  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1323  FAD-dependent oxidoreductase  28.69 
 
 
545 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3786  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.27 
 
 
573 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3859  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.27 
 
 
573 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4661  FAD-dependent oxidoreductase  31.12 
 
 
559 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.135002 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  32.4 
 
 
388 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4529  FAD-dependent oxidoreductase  31.12 
 
 
559 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.609398  normal  0.38599 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2401  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.36 
 
 
569 aa  154  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4218  FAD-dependent oxidoreductase  30.23 
 
 
579 aa  153  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3790  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.44 
 
 
568 aa  152  7e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829218 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0903  FAD-dependent oxidoreductase  30.84 
 
 
540 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7215  FAD-dependent oxidoreductase  28.73 
 
 
569 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4320  monooxygenase FAD-binding  31.22 
 
 
522 aa  151  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0339  FAD-dependent oxidoreductase  30.68 
 
 
584 aa  151  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0579  FAD-dependent oxidoreductase  30.68 
 
 
558 aa  150  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0428  FAD-dependent oxidoreductase  27.78 
 
 
569 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00420765  normal  0.845447 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0616  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.42 
 
 
580 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4300  FAD-dependent oxidoreductase  30.09 
 
 
578 aa  147  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5808  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.91 
 
 
552 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4535  FAD-dependent oxidoreductase  30.03 
 
 
563 aa  146  5e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000237964  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5297  monooxygenase, FAD-binding protein  33.52 
 
 
515 aa  146  6e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.85745  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5676  monooxygenase, FAD-binding  33.52 
 
 
515 aa  146  6e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5386  monooxygenase, FAD-binding  33.52 
 
 
515 aa  146  6e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.416517 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2727  FAD-dependent oxidoreductase  28.86 
 
 
570 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00614764  normal  0.0524365 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0724  monooxygenase, FAD-binding  29.38 
 
 
461 aa  146  8.000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18980  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  29.82 
 
 
554 aa  146  8.000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.099299  normal  0.679289 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5321  FAD-dependent oxidoreductase  31.29 
 
 
561 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124532  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4050  FAD-dependent oxidoreductase  28.05 
 
 
570 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000538899  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0850  FAD-dependent oxidoreductase  29.91 
 
 
555 aa  145  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0192309  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04210  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  31.25 
 
 
510 aa  144  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01747  FAD-dependent oxidoreductase  27.68 
 
 
563 aa  144  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.178537  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4123  FAD-dependent oxidoreductase  29.13 
 
 
577 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000743874  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  31.43 
 
 
511 aa  143  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0623  monooxygenase FAD-binding  28.49 
 
 
533 aa  143  6e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1196  FAD-dependent oxidoreductase  32.02 
 
 
554 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3183  monooxygenase FAD-binding  32.25 
 
 
511 aa  141  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2135  monooxygenase FAD-binding  28.85 
 
 
540 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.218617  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  31.84 
 
 
546 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4245  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.26 
 
 
569 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.525028  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1867  monooxygenase FAD-binding protein  30.03 
 
 
594 aa  140  6e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167984  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4781  monooxygenase FAD-binding  30.81 
 
 
572 aa  139  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0875  FAD-dependent oxidoreductase  28.93 
 
 
581 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.474503  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1344  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.14 
 
 
561 aa  138  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.430096  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0090  hypothetical protein  31.38 
 
 
497 aa  138  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3485  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase and related FAD-dependent oxidoreductases-like  30.9 
 
 
557 aa  138  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.108496 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  30.68 
 
 
481 aa  138  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6800  monooxygenase FAD-binding  30.47 
 
 
518 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220979  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3000  FAD-dependent oxidoreductase  29.77 
 
 
551 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.296257 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1515  monooxygenase, FAD-binding  33.43 
 
 
478 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497595  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1432  FAD-dependent oxidoreductase  29.78 
 
 
546 aa  137  5e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.886265  normal  0.829223 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0270  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.48 
 
 
618 aa  136  7.000000000000001e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.385681  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5156  FAD-dependent oxidoreductase  28.78 
 
 
535 aa  136  8e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328253  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1919  monooxygenase FAD-binding protein  28.85 
 
 
547 aa  135  9e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.136855  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5009  monooxygenase, FAD-binding  30.08 
 
 
506 aa  136  9e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3750  monooxygenase, FAD-binding  32.16 
 
 
511 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0581872  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3815  FAD-dependent oxidoreductase  28.82 
 
 
541 aa  135  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.433248  normal  0.294357 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5380  FAD-dependent oxidoreductase  30.51 
 
 
583 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189642  normal  0.0809664 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1733  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-related FAD-dependent oxidoreductase  31.92 
 
 
490 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.932836 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00305  hypothetical protein  29.74 
 
 
554 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00161031  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  27.79 
 
 
537 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00301  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.74 
 
 
554 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00155662  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0371  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.74 
 
 
554 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3278  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.74 
 
 
554 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0146118  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5698  monooxygenase FAD-binding  29.46 
 
 
531 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0767168 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0411  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.74 
 
 
554 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0836277  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2691  monooxygenase, FAD-binding  31.2 
 
 
473 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0422  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.74 
 
 
554 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2329  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.3 
 
 
622 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2661  monooxygenase, FAD-binding protein  31.2 
 
 
473 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2706  monooxygenase, FAD-binding  31.2 
 
 
473 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5043  monooxygenase, FAD-binding  29.01 
 
 
505 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483306  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0378  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.74 
 
 
554 aa  134  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0214512  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1226  FAD-dependent oxidoreductase  30.28 
 
 
588 aa  134  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1979  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.25 
 
 
555 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623617  normal  0.147267 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>