More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3750 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3750  monooxygenase, FAD-binding  100 
 
 		 511 aa  1050    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0581872  normal  0.69653 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10582  FAD binding monooxygenase, putative (JCVI)  50.99 
 
 		 566 aa  533  1e-150  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.832072  normal  0.150999 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  48.81 
 
 		 511 aa  444  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6800  monooxygenase FAD-binding  48.41 
 
 		 518 aa  434  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220979  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  42.35 
 
 		 414 aa  297  2e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0550  monooxygenase, FAD-binding  37.07 
 
 		 548 aa  260  4e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732263  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1029  monooxygenase, FAD-binding  37.07 
 
 		 548 aa  260  4e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0988  monooxygenase FAD-binding  36.88 
 
 		 548 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622027  normal  0.120457 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  38.25 
 
 		 535 aa  248  1e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0962  putative monooxygenase, FAD-binding  34.62 
 
 		 574 aa  246  6e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0576419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2966  FAD-dependent oxidoreductase  36.24 
 
 		 548 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2905  FAD-dependent oxidoreductase  36.24 
 
 		 548 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1620  pentachlorophenol 4-monooxygenase; PcpB  36.59 
 
 		 548 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168334  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0969  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  36.05 
 
 		 548 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2598  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  36.05 
 
 		 548 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3014  oxygenase  36.05 
 
 		 611 aa  243  6e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3025  monooxygenase FAD-binding  34.38 
 
 		 574 aa  243  7e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.114894  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0452  pentachlorophenol 4-monooxygenase, putative  36.21 
 
 		 538 aa  242  9e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0178  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  36.21 
 
 		 538 aa  242  9e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.74497  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2512  monooxygenase FAD-binding  35.06 
 
 		 544 aa  239  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3267  monooxygenase FAD-binding  38.27 
 
 		 486 aa  239  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  38.61 
 
 		 486 aa  236  7e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  37.47 
 
 		 493 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4142  monooxygenase, FAD-binding  35.5 
 
 		 546 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2368  monooxygenase FAD-binding  35.19 
 
 		 549 aa  233  5e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128155  normal  0.778169 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0725  monooxygenase FAD-binding  36.79 
 
 		 571 aa  233  6e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490959  normal  0.227588 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0724  monooxygenase, FAD-binding  35.64 
 
 		 461 aa  233  7.000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0905  monooxygenase FAD-binding  34.97 
 
 		 550 aa  231  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.147157 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0893  monooxygenase, FAD-binding  34.78 
 
 		 550 aa  226  7e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207082  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5676  monooxygenase, FAD-binding  35.69 
 
 		 515 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5297  monooxygenase, FAD-binding protein  35.69 
 
 		 515 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.85745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5386  monooxygenase, FAD-binding  35.69 
 
 		 515 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.416517 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  41.48 
 
 		 388 aa  223  4.9999999999999996e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04210  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  35.64 
 
 		 510 aa  222  9.999999999999999e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3183  monooxygenase FAD-binding  36.61 
 
 		 511 aa  220  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5698  monooxygenase FAD-binding  33.14 
 
 		 531 aa  220  5e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0767168 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2135  monooxygenase FAD-binding  37.38 
 
 		 540 aa  219  1e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.218617  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  31.76 
 
 		 529 aa  206  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  32.81 
 
 		 481 aa  203  6e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  35.65 
 
 		 537 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  35.65 
 
 		 537 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  35.65 
 
 		 537 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1544  monooxygenase, FAD-binding protein  37.7 
 
 		 478 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.585572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1567  monooxygenase, FAD-binding  37.7 
 
 		 478 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2377  hypothetical protein  30.11 
 
 		 553 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.879652  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1515  monooxygenase, FAD-binding  37.67 
 
 		 478 aa  196  7e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0143  monooxygenase FAD-binding protein  33.26 
 
 		 968 aa  193  6e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2227  monooxygenase FAD-binding  35.6 
 
 		 552 aa  192  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465072  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4799  monooxygenase FAD-binding  34.31 
 
 		 477 aa  192  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  32.84 
 
 		 506 aa  191  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2324  monooxygenase FAD-binding  35.79 
 
 		 547 aa  188  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.261518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5009  monooxygenase, FAD-binding  34.74 
 
 		 506 aa  187  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2454  regulatory proteins, IclR  33.18 
 
 		 575 aa  187  4e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.283629  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3372  monooxygenase FAD-binding protein  37.57 
 
 		 553 aa  187  5e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1624  hypothetical protein  31.13 
 
 		 502 aa  187  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.459087  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1717  hypothetical protein  31.13 
 
 		 502 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.587948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1650  hypothetical protein  31.58 
 
 		 502 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1658  hypothetical protein  31.2 
 
 		 502 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  36.86 
 
 		 501 aa  183  6e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2111  monooxygenase, FAD-binding  36.71 
 
 		 511 aa  182  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.0054618  normal  0.499354 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1860  hypothetical protein  31.55 
 
 		 498 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.600833 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0541  hypothetical protein  30.96 
 
 		 512 aa  181  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2585  monooxygenase FAD-binding protein  36.24 
 
 		 479 aa  181  4e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2975  monooxygenase FAD-binding protein  36.07 
 
 		 506 aa  180  4.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0868842  hitchhiker  0.000653809 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5043  monooxygenase, FAD-binding  33.02 
 
 		 505 aa  179  9e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  34.19 
 
 		 546 aa  178  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0779  monooxygenase, FAD-binding  32.1 
 
 		 500 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.813515  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3079  monooxygenase FAD-binding protein  31.91 
 
 		 503 aa  174  3.9999999999999995e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.0830218 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1733  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-related FAD-dependent oxidoreductase  38.35 
 
 		 490 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.932836 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  31 
 
 		 475 aa  173  7.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2328  monooxygenase FAD-binding  36.36 
 
 		 480 aa  171  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.238819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5651  monooxygenase FAD-binding  31.48 
 
 		 547 aa  169  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2013  monooxygenase FAD-binding  33.08 
 
 		 475 aa  167  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6034  monooxygenase FAD-binding protein  35.54 
 
 		 489 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.829011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4431  monooxygenase FAD-binding protein  31.31 
 
 		 474 aa  166  5.9999999999999996e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.412484 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4133  pentachlorophenol monooxygenase  29.76 
 
 		 479 aa  165  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0161  monooxygenase FAD-binding protein  34.84 
 
 		 493 aa  164  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4669  hypothetical protein  31.36 
 
 		 515 aa  164  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679977  normal  0.120633 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0750  monooxygenase FAD-binding protein  37.87 
 
 		 485 aa  164  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9228  hypothetical protein  29.59 
 
 		 504 aa  163  7e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.187294  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1656  hypothetical protein  34.79 
 
 		 508 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.652016  normal  0.325297 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2196  monooxygenase, FAD-binding  32.81 
 
 		 503 aa  162  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2907  hypothetical protein  31.08 
 
 		 477 aa  162  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0238  hypothetical protein  33.99 
 
 		 480 aa  161  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1498  monooxygenase, FAD-binding  30.23 
 
 		 477 aa  161  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.106253  normal  0.474209 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2691  monooxygenase, FAD-binding  29.59 
 
 		 473 aa  160  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1649  hypothetical protein  32 
 
 		 497 aa  160  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2661  monooxygenase, FAD-binding protein  29.59 
 
 		 473 aa  160  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2706  monooxygenase, FAD-binding  29.59 
 
 		 473 aa  160  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3485  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase and related FAD-dependent oxidoreductases-like  29.86 
 
 		 557 aa  160  7e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.108496 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1342  monooxygenase FAD-binding protein  36.02 
 
 		 496 aa  159  9e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0238  hypothetical protein  33.43 
 
 		 480 aa  158  2e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2055  monooxygenase, FAD-binding  34.99 
 
 		 486 aa  158  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08592  conserved hypothetical protein  29.21 
 
 		 606 aa  157  4e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1535  hypothetical protein  31.16 
 
 		 487 aa  157  4e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5796  putative monooxygenase  34.96 
 
 		 494 aa  156  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79596  normal  0.121142 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1511  monooxygenase FAD-binding  30.84 
 
 		 576 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0685394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1940  monooxygenase, FAD-binding  30.9 
 
 		 489 aa  153  7e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2162  monooxygenase FAD-binding  32 
 
 		 477 aa  153  7e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351168  decreased coverage  0.00237783 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6872  phenol 2-monooxygenase  32.04 
 
 		 634 aa  153  8.999999999999999e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>