More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4245 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3786  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  81.61 
 
 
573 aa  939    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3790  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  81.43 
 
 
568 aa  938    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829218 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4747  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  67.46 
 
 
574 aa  728    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649883  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3859  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  81.61 
 
 
573 aa  939    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4245  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  100 
 
 
569 aa  1155    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.525028  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2401  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  83.13 
 
 
569 aa  959    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1344  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  53.9 
 
 
561 aa  566  1e-160  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.430096  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1979  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  50 
 
 
555 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623617  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0378  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  47.45 
 
 
554 aa  512  1e-144  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0214512  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3278  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  47.64 
 
 
554 aa  514  1e-144  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0146118  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0411  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  47.64 
 
 
554 aa  514  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0836277  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0371  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  47.64 
 
 
554 aa  514  1e-144  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00301  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  47.26 
 
 
554 aa  509  1e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00155662  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3259  monooxygenase FAD-binding protein  47.26 
 
 
554 aa  509  1e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.257115  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00305  hypothetical protein  47.26 
 
 
554 aa  509  1e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00161031  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0422  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  47.07 
 
 
554 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0270  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  46.68 
 
 
618 aa  498  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.385681  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2329  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  45.9 
 
 
622 aa  491  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2893  monooxygenase FAD-binding  47.58 
 
 
564 aa  486  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4535  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  44.74 
 
 
615 aa  481  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6487  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  41.14 
 
 
542 aa  382  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6722  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  41.14 
 
 
542 aa  382  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.792631  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3440  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  36.93 
 
 
605 aa  329  1.0000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.845304  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5808  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  38.01 
 
 
552 aa  323  6e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0616  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  35.09 
 
 
580 aa  310  4e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5443  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase; 3-(3-hydroxy-phenyl)propionate hydroxylase FAD/NAD(P)-binding  39.22 
 
 
547 aa  308  1.0000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.728003  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3513  monooxygenase FAD-binding  33.77 
 
 
587 aa  263  6e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0593  monooxygenase, FAD-binding  34.62 
 
 
520 aa  258  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6461  monooxygenase FAD-binding  34.86 
 
 
537 aa  240  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0929587  normal  0.112964 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0928  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  39.87 
 
 
509 aa  237  4e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4404  monooxygenase FAD-binding  36.28 
 
 
565 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984317  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5086  monooxygenase, FAD-binding  36.51 
 
 
570 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5774  monooxygenase, FAD-binding  36.51 
 
 
570 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.750601 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0990  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  33.4 
 
 
507 aa  229  7e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1541  monooxygenase FAD-binding  38.36 
 
 
497 aa  224  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0161  monooxygenase, FAD-binding  32.16 
 
 
530 aa  225  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5805  monooxygenase FAD-binding  34.16 
 
 
547 aa  224  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000018754  hitchhiker  0.00132409 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4304  monooxygenase, FAD-binding  31.65 
 
 
520 aa  223  9e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1569  monooxygenase, FAD-binding  31.45 
 
 
525 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0725  monooxygenase FAD-binding protein  37.47 
 
 
509 aa  216  9e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.812372  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7425  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.89 
 
 
503 aa  214  3.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5585  putative FAD-binding monooxygenase  30.54 
 
 
514 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.187805 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4947  monooxygenase FAD-binding protein  31.87 
 
 
481 aa  197  5.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4483  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.43 
 
 
555 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4203  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.27 
 
 
555 aa  191  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3413  monooxygenase, FAD-binding  36.46 
 
 
503 aa  190  8e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0619698  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4834  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  32.24 
 
 
597 aa  187  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447643  decreased coverage  0.00803206 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4906  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  33.41 
 
 
511 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2814  monooxygenase FAD-binding protein  32.14 
 
 
537 aa  173  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0957884  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1268  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.93 
 
 
530 aa  172  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5524  monooxygenase FAD-binding  30.76 
 
 
518 aa  170  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000879135 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2727  FAD-dependent oxidoreductase  27.98 
 
 
570 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00614764  normal  0.0524365 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3290  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.2 
 
 
523 aa  163  6e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5380  FAD-dependent oxidoreductase  28.28 
 
 
583 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189642  normal  0.0809664 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3000  FAD-dependent oxidoreductase  31.38 
 
 
551 aa  155  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.296257 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  33.33 
 
 
475 aa  150  6e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3485  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase and related FAD-dependent oxidoreductases-like  33.43 
 
 
557 aa  150  8e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.108496 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5321  FAD-dependent oxidoreductase  28.04 
 
 
561 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124532  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5105  monooxygenase FAD-binding  27.95 
 
 
550 aa  149  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3217  monooxygenase FAD-binding protein  34.04 
 
 
488 aa  147  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0996184  hitchhiker  0.0000000987139 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5796  putative monooxygenase  33.88 
 
 
494 aa  146  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79596  normal  0.121142 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1226  FAD-dependent oxidoreductase  26.49 
 
 
588 aa  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4320  monooxygenase FAD-binding  34.23 
 
 
522 aa  145  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  35.06 
 
 
506 aa  145  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4123  FAD-dependent oxidoreductase  26.14 
 
 
577 aa  144  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000743874  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5009  monooxygenase, FAD-binding  34.41 
 
 
506 aa  144  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0715  FAD-dependent oxidoreductase  30.71 
 
 
558 aa  143  7e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.520934  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0698  FAD-dependent oxidoreductase  30.43 
 
 
555 aa  143  9e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3910  FAD-dependent oxidoreductase  30.05 
 
 
550 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2691  monooxygenase, FAD-binding  32.11 
 
 
473 aa  141  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  33.14 
 
 
481 aa  141  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2661  monooxygenase, FAD-binding protein  32.11 
 
 
473 aa  141  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2706  monooxygenase, FAD-binding  32.11 
 
 
473 aa  141  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4669  hypothetical protein  30.42 
 
 
515 aa  140  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679977  normal  0.120633 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2566  FAD-dependent oxidoreductase  30.16 
 
 
555 aa  140  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3815  FAD-dependent oxidoreductase  27.62 
 
 
541 aa  139  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.433248  normal  0.294357 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4192  FAD-dependent oxidoreductase  28.72 
 
 
564 aa  138  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1850  hypothetical protein  30.34 
 
 
497 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1395  FAD-dependent oxidoreductase  30.5 
 
 
553 aa  137  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0541  hypothetical protein  32.98 
 
 
512 aa  137  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0786  FAD-dependent oxidoreductase  29.89 
 
 
553 aa  137  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0334  FAD-dependent oxidoreductase  29.89 
 
 
553 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0875  FAD-dependent oxidoreductase  28.27 
 
 
581 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.474503  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0817  FAD-dependent oxidoreductase  29.89 
 
 
553 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0779  monooxygenase, FAD-binding  32.35 
 
 
500 aa  136  8e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.813515  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6034  monooxygenase FAD-binding protein  32.23 
 
 
489 aa  136  9e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.829011  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1940  monooxygenase, FAD-binding  29.05 
 
 
489 aa  136  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  31.3 
 
 
529 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3216  FAD-dependent oxidoreductase  30.5 
 
 
553 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3231  FAD-dependent oxidoreductase  30.5 
 
 
553 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0428  FAD-dependent oxidoreductase  29.79 
 
 
569 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00420765  normal  0.845447 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3177  FAD-dependent oxidoreductase  30.5 
 
 
553 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4661  FAD-dependent oxidoreductase  31.17 
 
 
559 aa  135  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.135002 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4529  FAD-dependent oxidoreductase  31.17 
 
 
559 aa  135  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.609398  normal  0.38599 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3183  monooxygenase FAD-binding  32.8 
 
 
511 aa  135  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  33.14 
 
 
537 aa  134  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3526  monooxygenase, FAD-binding  27.6 
 
 
586 aa  134  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.120911 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1304  FAD-dependent oxidoreductase  29.45 
 
 
535 aa  134  6e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26478  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  28.02 
 
 
535 aa  133  6.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2389  hypothetical protein  30.42 
 
 
557 aa  133  7.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>