More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2389 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2389  hypothetical protein  100 
 
 		 557 aa  1129    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4892  hypothetical protein  57.46 
 
 		 564 aa  613  9.999999999999999e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0498261  normal  0.117948 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5061  hypothetical protein  58.55 
 
 		 562 aa  596  1e-169  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4124  hypothetical protein  40.48 
 
 		 559 aa  372  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000171711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4076  hypothetical protein  34.93 
 
 		 578 aa  270  4e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165251  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3769  hypothetical protein  33.57 
 
 		 564 aa  270  5.9999999999999995e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3284  hypothetical protein  33.95 
 
 		 554 aa  261  2e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1006  hypothetical protein  34.84 
 
 		 543 aa  253  8.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2333  monooxygenase FAD-binding  34 
 
 		 536 aa  232  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.307173 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08410  FAD-dependent monooxygenase (Eurofung)  30.82 
 
 		 624 aa  230  6e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0451  hypothetical protein  35.24 
 
 		 617 aa  223  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0227  monooxygenase FAD-binding  30.45 
 
 		 596 aa  196  9e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3219  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  29.49 
 
 		 545 aa  192  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3526  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  29.87 
 
 		 539 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4564  monooxygenase FAD-binding  28.08 
 
 		 598 aa  189  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.669744 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3518  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  29.96 
 
 		 539 aa  184  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.054521  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3220  monooxygenase FAD-binding  29.17 
 
 		 539 aa  182  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.238017  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29830  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  30.48 
 
 		 543 aa  181  4e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.832343 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3564  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  28.88 
 
 		 539 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.89711  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3304  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  28.88 
 
 		 544 aa  179  8e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4679  monooxygenase, FAD-binding  27.9 
 
 		 592 aa  179  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0600734  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3271  PheA/TfdB family polyketide hydroxylase  29.04 
 
 		 544 aa  179  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.654558  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3520  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  28.88 
 
 		 539 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3504  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  28.52 
 
 		 539 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1744  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  28.11 
 
 		 539 aa  172  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.572505 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4406  monooxygenase, FAD-binding  28.57 
 
 		 597 aa  171  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.814419  normal  0.677611 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5592  monooxygenase FAD-binding protein  30.7 
 
 		 524 aa  170  6e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0848  hypothetical protein  28.65 
 
 		 511 aa  170  6e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.970878  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07251  conserved hypothetical protein  29.24 
 
 		 581 aa  169  8e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.261689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2460  monooxygenase FAD-binding  29.01 
 
 		 595 aa  169  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4156  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  30.89 
 
 		 541 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  0.0299299 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0339  monooxygenase, FAD-binding  30.43 
 
 		 534 aa  167  4e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0305956  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6338  monooxygenase FAD-binding  31.73 
 
 		 504 aa  166  8e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3793  monooxygenase, FAD-binding  30.65 
 
 		 524 aa  164  4.0000000000000004e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.791839  normal  0.0125936 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3045  monooxygenase, FAD-binding  29.08 
 
 		 600 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000523244  unclonable  0.000000929922 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5534  monooxygenase FAD-binding  28.09 
 
 		 584 aa  163  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.105639  hitchhiker  0.00000473423 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1463  monooxygenase FAD-binding  28.57 
 
 		 598 aa  162  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1929  monooxygenase, FAD-binding  26.24 
 
 		 619 aa  158  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.132935  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10582  FAD binding monooxygenase, putative (JCVI)  33.7 
 
 		 566 aa  157  5.0000000000000005e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.832072  normal  0.150999 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2986  monooxygenase FAD-binding  28.84 
 
 		 611 aa  156  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5808  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  32.32 
 
 		 552 aa  155  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_87314  predicted protein  34.55 
 
 		 606 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.002805 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6462  monooxygenase, FAD-binding  28.31 
 
 		 598 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2129  monooxygenase FAD-binding protein  29.11 
 
 		 543 aa  154  5.9999999999999996e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.890834  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1083  monooxygenase FAD-binding  28.13 
 
 		 523 aa  150  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2185  monooxygenase, FAD-binding  26.68 
 
 		 590 aa  147  5e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6470  monooxygenase, FAD-binding  27.87 
 
 		 586 aa  145  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.71496  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  32.56 
 
 		 511 aa  144  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.572405 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05044  conserved hypothetical protein  27.97 
 
 		 619 aa  144  4e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.163159 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7059  monooxygenase FAD-binding  29.82 
 
 		 512 aa  143  7e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.120859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  31.72 
 
 		 506 aa  142  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1649  hypothetical protein  30.27 
 
 		 497 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4320  monooxygenase FAD-binding  31.35 
 
 		 522 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4181  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  28.24 
 
 		 531 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.895625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  32.67 
 
 		 481 aa  141  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0131  2,4-dichlorophenol 6-monooxygenase  31.25 
 
 		 556 aa  140  4.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0320392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3786  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.34 
 
 		 573 aa  140  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3790  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.34 
 
 		 568 aa  140  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829218 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3859  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.34 
 
 		 573 aa  140  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09029  FAD dependent oxidoreductase, putative (JCVI)  25.52 
 
 		 579 aa  139  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3894  monooxygenase FAD-binding  29.14 
 
 		 540 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0436183  normal  0.0134982 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  30.31 
 
 		 537 aa  138  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1860  hypothetical protein  33.07 
 
 		 498 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.600833 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7439  2,4-dichlorophenol hydroxylase  28.4 
 
 		 585 aa  138  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0899  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 586 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.67308e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1624  hypothetical protein  31.96 
 
 		 502 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.459087  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0623  monooxygenase FAD-binding  27.23 
 
 		 533 aa  137  6.0000000000000005e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0724  monooxygenase, FAD-binding  32.13 
 
 		 461 aa  137  7.000000000000001e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2401  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.54 
 
 		 569 aa  136  8e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1717  hypothetical protein  31.96 
 
 		 502 aa  136  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.587948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1650  hypothetical protein  31.96 
 
 		 502 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1658  hypothetical protein  31.7 
 
 		 502 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8778  putative monooxygenase  31.27 
 
 		 492 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4799  monooxygenase FAD-binding  31.72 
 
 		 477 aa  134  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  32.24 
 
 		 546 aa  134  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0541  hypothetical protein  30.41 
 
 		 512 aa  133  6.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6487  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.46 
 
 		 542 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6722  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.46 
 
 		 542 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.792631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  30.65 
 
 		 535 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5009  monooxygenase, FAD-binding  29.41 
 
 		 506 aa  130  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1656  hypothetical protein  32.47 
 
 		 508 aa  130  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.652016  normal  0.325297 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0270  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31 
 
 		 618 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.385681  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3217  monooxygenase FAD-binding protein  29.97 
 
 		 488 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0996184  hitchhiker  0.0000000987139 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2135  monooxygenase FAD-binding  32.78 
 
 		 540 aa  128  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.218617  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4245  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.22 
 
 		 569 aa  128  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.525028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5380  FAD-dependent oxidoreductase  27.78 
 
 		 583 aa  128  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189642  normal  0.0809664 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6800  monooxygenase FAD-binding  30.71 
 
 		 518 aa  127  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220979  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  31.32 
 
 		 501 aa  127  7e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1484  hypothetical protein  31.98 
 
 		 499 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115631  normal  0.323666 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0090  hypothetical protein  32.98 
 
 		 497 aa  127  8.000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1850  hypothetical protein  30.08 
 
 		 497 aa  126  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6034  monooxygenase FAD-binding protein  32.01 
 
 		 489 aa  126  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.829011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2196  monooxygenase, FAD-binding  29.68 
 
 		 503 aa  126  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4535  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.75 
 
 		 615 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5043  monooxygenase, FAD-binding  31.99 
 
 		 505 aa  126  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483306  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  29.11 
 
 		 529 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2690  monooxygenase FAD-binding protein  27.09 
 
 		 519 aa  125  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0584184 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3485  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase and related FAD-dependent oxidoreductases-like  29.46 
 
 		 557 aa  125  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.108496 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4588  monooxygenase FAD-binding  30.89 
 
 		 555 aa  125  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2748  monooxygenase FAD-binding protein  30.51 
 
 		 489 aa  125  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>