More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4124 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4124  hypothetical protein  100 
 
 		 559 aa  1108    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000171711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4892  hypothetical protein  40.84 
 
 		 564 aa  413  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0498261  normal  0.117948 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2389  hypothetical protein  40.48 
 
 		 557 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5061  hypothetical protein  39.64 
 
 		 562 aa  365  2e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4076  hypothetical protein  36.89 
 
 		 578 aa  306  6e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165251  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1006  hypothetical protein  37.48 
 
 		 543 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3769  hypothetical protein  36.33 
 
 		 564 aa  287  2.9999999999999996e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3284  hypothetical protein  34.19 
 
 		 554 aa  273  6e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2333  monooxygenase FAD-binding  35.15 
 
 		 536 aa  259  6e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.307173 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0451  hypothetical protein  35 
 
 		 617 aa  252  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07251  conserved hypothetical protein  33.51 
 
 		 581 aa  214  4.9999999999999996e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.261689  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08410  FAD-dependent monooxygenase (Eurofung)  30.52 
 
 		 624 aa  209  1e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4564  monooxygenase FAD-binding  31.9 
 
 		 598 aa  208  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.669744 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29830  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  32.79 
 
 		 543 aa  204  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.832343 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0339  monooxygenase, FAD-binding  32.22 
 
 		 534 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0305956  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5534  monooxygenase FAD-binding  29.38 
 
 		 584 aa  192  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.105639  hitchhiker  0.00000473423 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1929  monooxygenase, FAD-binding  29.62 
 
 		 619 aa  187  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.132935  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4406  monooxygenase, FAD-binding  29.79 
 
 		 597 aa  186  7e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.814419  normal  0.677611 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1463  monooxygenase FAD-binding  29.12 
 
 		 598 aa  186  9e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3518  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  28.02 
 
 		 539 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.054521  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3526  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  28.1 
 
 		 539 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0227  monooxygenase FAD-binding  29.9 
 
 		 596 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3894  monooxygenase FAD-binding  31.53 
 
 		 540 aa  178  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0436183  normal  0.0134982 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3271  PheA/TfdB family polyketide hydroxylase  27.4 
 
 		 544 aa  178  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.654558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3219  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  27.23 
 
 		 545 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3504  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  26.84 
 
 		 539 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3520  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  27.92 
 
 		 539 aa  173  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05044  conserved hypothetical protein  27.79 
 
 		 619 aa  172  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.163159 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3793  monooxygenase, FAD-binding  29.51 
 
 		 524 aa  170  8e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.791839  normal  0.0125936 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4679  monooxygenase, FAD-binding  28.25 
 
 		 592 aa  169  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0600734  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1744  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  27.13 
 
 		 539 aa  169  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.572505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4156  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  30.23 
 
 		 541 aa  167  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  0.0299299 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3304  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  27.75 
 
 		 544 aa  166  9e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3564  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  27.75 
 
 		 539 aa  166  9e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.89711  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2460  monooxygenase FAD-binding  29.98 
 
 		 595 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_87314  predicted protein  32.6 
 
 		 606 aa  164  5.0000000000000005e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.002805 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2298  monooxygenase, FAD-binding  31.17 
 
 		 580 aa  162  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0352446  hitchhiker  0.0088842 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3220  monooxygenase FAD-binding  26.55 
 
 		 539 aa  162  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.238017  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3045  monooxygenase, FAD-binding  30 
 
 		 600 aa  161  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000523244  unclonable  0.000000929922 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6470  monooxygenase, FAD-binding  27.98 
 
 		 586 aa  160  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.71496  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7439  2,4-dichlorophenol hydroxylase  28.57 
 
 		 585 aa  159  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09029  FAD dependent oxidoreductase, putative (JCVI)  27.17 
 
 		 579 aa  155  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6462  monooxygenase, FAD-binding  28.17 
 
 		 598 aa  155  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6338  monooxygenase FAD-binding  31.46 
 
 		 504 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4588  monooxygenase FAD-binding  29.47 
 
 		 555 aa  152  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0848  hypothetical protein  26.82 
 
 		 511 aa  150  4e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.970878  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4181  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  31.29 
 
 		 531 aa  150  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.895625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0899  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase  26.09 
 
 		 586 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.67308e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2986  monooxygenase FAD-binding  29.86 
 
 		 611 aa  149  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5592  monooxygenase FAD-binding protein  28.49 
 
 		 524 aa  146  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2185  monooxygenase, FAD-binding  29.83 
 
 		 590 aa  145  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1083  monooxygenase FAD-binding  28.02 
 
 		 523 aa  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3183  monooxygenase FAD-binding  31.35 
 
 		 511 aa  143  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7059  monooxygenase FAD-binding  29.24 
 
 		 512 aa  143  8e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.120859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0131  2,4-dichlorophenol 6-monooxygenase  29.38 
 
 		 556 aa  142  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0320392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  28.25 
 
 		 537 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  28.08 
 
 		 537 aa  139  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  28.08 
 
 		 537 aa  139  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06130  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 		 522 aa  137  5e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4320  monooxygenase FAD-binding  29.71 
 
 		 522 aa  133  7.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3526  monooxygenase, FAD-binding  30.42 
 
 		 586 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.120911 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1323  FAD-dependent oxidoreductase  26.14 
 
 		 545 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1304  FAD-dependent oxidoreductase  25.4 
 
 		 535 aa  130  5.0000000000000004e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  30.62 
 
 		 414 aa  125  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0623  monooxygenase FAD-binding  29.03 
 
 		 533 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0161  monooxygenase FAD-binding protein  30.41 
 
 		 493 aa  126  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  32.51 
 
 		 535 aa  126  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6034  monooxygenase FAD-binding protein  30.98 
 
 		 489 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.829011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  28.07 
 
 		 537 aa  124  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5043  monooxygenase, FAD-binding  31.41 
 
 		 505 aa  124  6e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3217  monooxygenase FAD-binding protein  29.76 
 
 		 488 aa  123  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0996184  hitchhiker  0.0000000987139 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6165  monooxygenase FAD-binding protein  29.29 
 
 		 520 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1940  monooxygenase, FAD-binding  29.4 
 
 		 489 aa  122  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  34.22 
 
 		 546 aa  121  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  30.73 
 
 		 493 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0579  FAD-dependent oxidoreductase  26.33 
 
 		 558 aa  119  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5698  monooxygenase FAD-binding  30.79 
 
 		 531 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0767168 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0903  FAD-dependent oxidoreductase  26.16 
 
 		 540 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5321  FAD-dependent oxidoreductase  29.04 
 
 		 561 aa  118  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124532  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  31.73 
 
 		 486 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3267  monooxygenase FAD-binding  29.09 
 
 		 486 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2691  monooxygenase, FAD-binding  28 
 
 		 473 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2661  monooxygenase, FAD-binding protein  28 
 
 		 473 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2706  monooxygenase, FAD-binding  28 
 
 		 473 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3750  monooxygenase, FAD-binding  28.57 
 
 		 511 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0581872  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6800  monooxygenase FAD-binding  30.85 
 
 		 518 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220979  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  31.71 
 
 		 481 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1216  hypothetical protein  27.64 
 
 		 486 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.795806  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2690  monooxygenase FAD-binding protein  26.99 
 
 		 519 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0584184 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5009  monooxygenase, FAD-binding  27.34 
 
 		 506 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1226  FAD-dependent oxidoreductase  28.11 
 
 		 588 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  29.58 
 
 		 511 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3345  monooxygenase FAD-binding  31.03 
 
 		 505 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.527889 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0779  monooxygenase, FAD-binding  29.82 
 
 		 500 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.813515  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2748  monooxygenase FAD-binding protein  31.9 
 
 		 489 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5808  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.38 
 
 		 552 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3000  FAD-dependent oxidoreductase  26.9 
 
 		 551 aa  114  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.296257 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1850  hypothetical protein  27.54 
 
 		 497 aa  114  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5651  monooxygenase FAD-binding  30.5 
 
 		 547 aa  114  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0750  monooxygenase FAD-binding protein  30.49 
 
 		 485 aa  113  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>