More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7439 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011881  Achl_4564  monooxygenase FAD-binding  53.44 
 
 
598 aa  650    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.669744 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7439  2,4-dichlorophenol hydroxylase  100 
 
 
585 aa  1212    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6462  monooxygenase, FAD-binding  55.42 
 
 
598 aa  652    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6470  monooxygenase, FAD-binding  52.76 
 
 
586 aa  640    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.71496  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5534  monooxygenase FAD-binding  71.53 
 
 
584 aa  887    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.105639  hitchhiker  0.00000473423 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4406  monooxygenase, FAD-binding  52.23 
 
 
597 aa  635    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.814419  normal  0.677611 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1929  monooxygenase, FAD-binding  51.89 
 
 
619 aa  610  1e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.132935  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3045  monooxygenase, FAD-binding  49.91 
 
 
600 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000523244  unclonable  0.000000929922 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1463  monooxygenase FAD-binding  48.29 
 
 
598 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0227  monooxygenase FAD-binding  46.75 
 
 
596 aa  543  1e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0899  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase  46.83 
 
 
586 aa  523  1e-147  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.67308e-16  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4679  monooxygenase, FAD-binding  43.32 
 
 
592 aa  491  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0600734  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2460  monooxygenase FAD-binding  43.1 
 
 
595 aa  476  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09029  FAD dependent oxidoreductase, putative (JCVI)  41.78 
 
 
579 aa  434  1e-120  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05044  conserved hypothetical protein  39.68 
 
 
619 aa  419  1e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.163159 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2298  monooxygenase, FAD-binding  40.65 
 
 
580 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0352446  hitchhiker  0.0088842 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06130  conserved hypothetical protein  41.1 
 
 
522 aa  338  9.999999999999999e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442853  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2986  monooxygenase FAD-binding  34.72 
 
 
611 aa  300  4e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2185  monooxygenase, FAD-binding  31.76 
 
 
590 aa  264  4e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245304  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3271  PheA/TfdB family polyketide hydroxylase  31.42 
 
 
544 aa  238  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.654558  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5592  monooxygenase FAD-binding protein  32.14 
 
 
524 aa  238  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3526  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  30.61 
 
 
539 aa  238  3e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3504  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  31.12 
 
 
539 aa  236  9e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3518  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  30.1 
 
 
539 aa  232  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.054521  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4588  monooxygenase FAD-binding  31.97 
 
 
555 aa  231  3e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29830  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  31.71 
 
 
543 aa  227  5.0000000000000005e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.832343 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3219  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  30.63 
 
 
545 aa  226  7e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1744  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  30.44 
 
 
539 aa  225  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.572505 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3520  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  30.28 
 
 
539 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3304  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  30.24 
 
 
544 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3564  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  30.24 
 
 
539 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.89711  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4181  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  30.54 
 
 
531 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.895625  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4156  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  31.76 
 
 
541 aa  208  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  0.0299299 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0131  2,4-dichlorophenol 6-monooxygenase  29.38 
 
 
556 aa  206  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0320392  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3220  monooxygenase FAD-binding  28.38 
 
 
539 aa  205  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.238017  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3894  monooxygenase FAD-binding  30.47 
 
 
540 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0436183  normal  0.0134982 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6338  monooxygenase FAD-binding  28.62 
 
 
504 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1083  monooxygenase FAD-binding  29.36 
 
 
523 aa  190  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213511  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0451  hypothetical protein  31.69 
 
 
617 aa  187  4e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3284  hypothetical protein  29.95 
 
 
554 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1006  hypothetical protein  28.92 
 
 
543 aa  176  9e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07415  conserved hypothetical protein  31.91 
 
 
524 aa  176  9.999999999999999e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.300913 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3769  hypothetical protein  29.02 
 
 
564 aa  175  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0848  hypothetical protein  26.82 
 
 
511 aa  172  2e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.970878  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4124  hypothetical protein  28.57 
 
 
559 aa  171  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000171711  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4892  hypothetical protein  27.46 
 
 
564 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0498261  normal  0.117948 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2333  monooxygenase FAD-binding  29.08 
 
 
536 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.307173 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7059  monooxygenase FAD-binding  28.4 
 
 
512 aa  157  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.120859  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_87314  predicted protein  28.05 
 
 
606 aa  154  4e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.002805 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6165  monooxygenase FAD-binding protein  27.98 
 
 
520 aa  152  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2389  hypothetical protein  28.4 
 
 
557 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5061  hypothetical protein  27.66 
 
 
562 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4076  hypothetical protein  25.68 
 
 
578 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165251  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2690  monooxygenase FAD-binding protein  26.88 
 
 
519 aa  134  6e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0584184 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2324  monooxygenase FAD-binding  25.29 
 
 
547 aa  120  7.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.261518  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  27.75 
 
 
546 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1860  hypothetical protein  29.1 
 
 
498 aa  118  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.600833 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  30.13 
 
 
529 aa  117  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08410  FAD-dependent monooxygenase (Eurofung)  25.34 
 
 
624 aa  117  6.9999999999999995e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  27.76 
 
 
537 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0143  monooxygenase FAD-binding protein  29.77 
 
 
968 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  27.76 
 
 
537 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  27.94 
 
 
481 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  27.76 
 
 
537 aa  115  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1544  monooxygenase, FAD-binding protein  28.61 
 
 
478 aa  115  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.585572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1567  monooxygenase, FAD-binding  28.61 
 
 
478 aa  115  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1515  monooxygenase, FAD-binding  28.16 
 
 
478 aa  114  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497595  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2377  hypothetical protein  28.53 
 
 
553 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.879652  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  28.23 
 
 
537 aa  112  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0339  monooxygenase, FAD-binding  27.41 
 
 
534 aa  110  6e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0305956  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2162  monooxygenase FAD-binding  29.14 
 
 
477 aa  110  7.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351168  decreased coverage  0.00237783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  27.05 
 
 
388 aa  110  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10582  FAD binding monooxygenase, putative (JCVI)  27.49 
 
 
566 aa  110  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.832072  normal  0.150999 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2227  monooxygenase FAD-binding  26.36 
 
 
552 aa  109  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465072  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0962  putative monooxygenase, FAD-binding  28.68 
 
 
574 aa  108  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0576419  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0161  monooxygenase FAD-binding protein  31.43 
 
 
493 aa  108  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2055  monooxygenase, FAD-binding  29.44 
 
 
486 aa  108  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  28.87 
 
 
511 aa  107  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1535  hypothetical protein  27.39 
 
 
487 aa  107  5e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07251  conserved hypothetical protein  25.72 
 
 
581 aa  107  6e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.261689  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1511  monooxygenase FAD-binding  27.07 
 
 
576 aa  107  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0685394  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6800  monooxygenase FAD-binding  29.14 
 
 
518 aa  107  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220979  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3079  monooxygenase FAD-binding protein  28.53 
 
 
503 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.0830218 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  28.18 
 
 
414 aa  105  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0161  monooxygenase, FAD-binding  26.04 
 
 
530 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4404  monooxygenase FAD-binding  25.25 
 
 
565 aa  104  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984317  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5086  monooxygenase, FAD-binding  24.85 
 
 
570 aa  103  8e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5774  monooxygenase, FAD-binding  24.85 
 
 
570 aa  103  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.750601 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4535  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  26.49 
 
 
615 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  26.6 
 
 
506 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6230  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase  29.65 
 
 
499 aa  102  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.994902  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3793  monooxygenase, FAD-binding  27.76 
 
 
524 aa  102  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.791839  normal  0.0125936 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4304  monooxygenase, FAD-binding  26.92 
 
 
520 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3750  monooxygenase, FAD-binding  27.88 
 
 
511 aa  102  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0581872  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2512  monooxygenase FAD-binding  24.13 
 
 
544 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3183  monooxygenase FAD-binding  27.56 
 
 
511 aa  101  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  27.34 
 
 
506 aa  101  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  27.98 
 
 
486 aa  101  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0238  hypothetical protein  27.32 
 
 
480 aa  100  6e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2013  monooxygenase FAD-binding  27.05 
 
 
475 aa  100  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>