More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3045 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007337  Reut_D6470  monooxygenase, FAD-binding  55.6 
 
 		 586 aa  655    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.71496  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1463  monooxygenase FAD-binding  67.47 
 
 		 598 aa  828    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3045  monooxygenase, FAD-binding  100 
 
 		 600 aa  1228    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000523244  unclonable  0.000000929922 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6462  monooxygenase, FAD-binding  52.87 
 
 		 598 aa  608  9.999999999999999e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5534  monooxygenase FAD-binding  50.68 
 
 		 584 aa  579  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.105639  hitchhiker  0.00000473423 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4564  monooxygenase FAD-binding  50.09 
 
 		 598 aa  578  1e-164  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.669744 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7439  2,4-dichlorophenol hydroxylase  49.91 
 
 		 585 aa  557  1e-157  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4406  monooxygenase, FAD-binding  49.31 
 
 		 597 aa  553  1e-156  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.814419  normal  0.677611 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1929  monooxygenase, FAD-binding  48.19 
 
 		 619 aa  521  1e-146  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.132935  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0899  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase  43.8 
 
 		 586 aa  462  1e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.67308e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4679  monooxygenase, FAD-binding  42.44 
 
 		 592 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0600734  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0227  monooxygenase FAD-binding  41.82 
 
 		 596 aa  444  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2460  monooxygenase FAD-binding  41.8 
 
 		 595 aa  436  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09029  FAD dependent oxidoreductase, putative (JCVI)  37.54 
 
 		 579 aa  382  1e-105  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05044  conserved hypothetical protein  38.77 
 
 		 619 aa  373  1e-102  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.163159 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2298  monooxygenase, FAD-binding  39.36 
 
 		 580 aa  335  1e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0352446  hitchhiker  0.0088842 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06130  conserved hypothetical protein  39.79 
 
 		 522 aa  304  3.0000000000000004e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2986  monooxygenase FAD-binding  34.54 
 
 		 611 aa  280  6e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4588  monooxygenase FAD-binding  33.56 
 
 		 555 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2185  monooxygenase, FAD-binding  30.72 
 
 		 590 aa  233  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245304  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3219  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  29.67 
 
 		 545 aa  232  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29830  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  32.21 
 
 		 543 aa  230  7e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.832343 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3518  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  29.08 
 
 		 539 aa  229  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.054521  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3504  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  30.07 
 
 		 539 aa  228  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1744  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  29.9 
 
 		 539 aa  224  3e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.572505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4156  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  33.04 
 
 		 541 aa  224  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  0.0299299 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3526  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  29.04 
 
 		 539 aa  224  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3220  monooxygenase FAD-binding  29.38 
 
 		 539 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.238017  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3304  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  28.69 
 
 		 544 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3564  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  28.69 
 
 		 539 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.89711  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3271  PheA/TfdB family polyketide hydroxylase  28.64 
 
 		 544 aa  220  5e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.654558  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3520  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  28.47 
 
 		 539 aa  220  6e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5592  monooxygenase FAD-binding protein  30.99 
 
 		 524 aa  215  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4181  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  30.99 
 
 		 531 aa  207  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.895625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1006  hypothetical protein  31.68 
 
 		 543 aa  200  6e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0131  2,4-dichlorophenol 6-monooxygenase  31.6 
 
 		 556 aa  198  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0320392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6338  monooxygenase FAD-binding  30.74 
 
 		 504 aa  191  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0848  hypothetical protein  28.75 
 
 		 511 aa  191  2.9999999999999997e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.970878  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1083  monooxygenase FAD-binding  29.93 
 
 		 523 aa  190  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4892  hypothetical protein  29.15 
 
 		 564 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0498261  normal  0.117948 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3894  monooxygenase FAD-binding  29.93 
 
 		 540 aa  185  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0436183  normal  0.0134982 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3284  hypothetical protein  29.35 
 
 		 554 aa  166  8e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2389  hypothetical protein  29.08 
 
 		 557 aa  164  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4124  hypothetical protein  30.03 
 
 		 559 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000171711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3769  hypothetical protein  29.82 
 
 		 564 aa  162  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6165  monooxygenase FAD-binding protein  29.3 
 
 		 520 aa  159  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7059  monooxygenase FAD-binding  29.33 
 
 		 512 aa  158  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.120859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4076  hypothetical protein  29.24 
 
 		 578 aa  154  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165251  normal  0.567075 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08410  FAD-dependent monooxygenase (Eurofung)  27.81 
 
 		 624 aa  152  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07415  conserved hypothetical protein  30.88 
 
 		 524 aa  150  6e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.300913 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2333  monooxygenase FAD-binding  28.28 
 
 		 536 aa  150  7e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.307173 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  33.51 
 
 		 546 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_87314  predicted protein  25.48 
 
 		 606 aa  144  7e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.002805 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0451  hypothetical protein  30.15 
 
 		 617 aa  140  7.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  30.87 
 
 		 511 aa  139  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5061  hypothetical protein  28.89 
 
 		 562 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2690  monooxygenase FAD-binding protein  29.74 
 
 		 519 aa  137  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0584184 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  31.65 
 
 		 475 aa  137  8e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  32.01 
 
 		 481 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0161  monooxygenase FAD-binding protein  32.42 
 
 		 493 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2013  monooxygenase FAD-binding  30.81 
 
 		 475 aa  134  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  29.92 
 
 		 537 aa  134  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  29.92 
 
 		 537 aa  134  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2748  monooxygenase FAD-binding protein  32.8 
 
 		 489 aa  133  7.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  30.1 
 
 		 537 aa  131  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0962  putative monooxygenase, FAD-binding  28.8 
 
 		 574 aa  131  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0576419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0143  monooxygenase FAD-binding protein  30.55 
 
 		 968 aa  130  7.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  28.92 
 
 		 388 aa  130  7.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1544  monooxygenase, FAD-binding protein  29.87 
 
 		 478 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.585572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1567  monooxygenase, FAD-binding  29.87 
 
 		 478 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4133  pentachlorophenol monooxygenase  31.27 
 
 		 479 aa  129  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2512  monooxygenase FAD-binding  27.21 
 
 		 544 aa  128  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2328  monooxygenase FAD-binding  28.76 
 
 		 480 aa  128  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.238819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0339  monooxygenase, FAD-binding  28.57 
 
 		 534 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0305956  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2129  monooxygenase FAD-binding protein  28.95 
 
 		 543 aa  127  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.890834  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1515  monooxygenase, FAD-binding  29.76 
 
 		 478 aa  126  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2227  monooxygenase FAD-binding  29.02 
 
 		 552 aa  125  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465072  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  29.74 
 
 		 506 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3025  monooxygenase FAD-binding  28.01 
 
 		 574 aa  124  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.114894  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  31.59 
 
 		 506 aa  124  7e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10582  FAD binding monooxygenase, putative (JCVI)  29.55 
 
 		 566 aa  122  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.832072  normal  0.150999 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3750  monooxygenase, FAD-binding  30.83 
 
 		 511 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0581872  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6800  monooxygenase FAD-binding  28.04 
 
 		 518 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220979  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1860  hypothetical protein  30.27 
 
 		 498 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.600833 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4529  FAD-dependent oxidoreductase  29.33 
 
 		 559 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.609398  normal  0.38599 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4661  FAD-dependent oxidoreductase  29.33 
 
 		 559 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.135002 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1498  monooxygenase, FAD-binding  29.95 
 
 		 477 aa  121  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.106253  normal  0.474209 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5805  monooxygenase FAD-binding  30.15 
 
 		 547 aa  122  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000018754  hitchhiker  0.00132409 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3217  monooxygenase FAD-binding protein  30.32 
 
 		 488 aa  121  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0996184  hitchhiker  0.0000000987139 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2377  hypothetical protein  29.79 
 
 		 553 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.879652  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  29.81 
 
 		 529 aa  120  7e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0725  monooxygenase FAD-binding protein  30.59 
 
 		 509 aa  117  6.9999999999999995e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.812372  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4669  hypothetical protein  28.38 
 
 		 515 aa  117  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679977  normal  0.120633 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0750  monooxygenase FAD-binding protein  28.42 
 
 		 485 aa  117  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1624  hypothetical protein  29.63 
 
 		 502 aa  117  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.459087  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5086  monooxygenase, FAD-binding  29.3 
 
 		 570 aa  117  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5774  monooxygenase, FAD-binding  29.3 
 
 		 570 aa  117  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.750601 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1717  hypothetical protein  29.63 
 
 		 502 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.587948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2111  monooxygenase, FAD-binding  31.15 
 
 		 511 aa  116  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.0054618  normal  0.499354 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  30.79 
 
 		 535 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>