More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_D6470 on replicon NC_007337
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_1463  monooxygenase FAD-binding  54.58 
 
 
598 aa  668    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6462  monooxygenase, FAD-binding  62.31 
 
 
598 aa  722    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6470  monooxygenase, FAD-binding  100 
 
 
586 aa  1213    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.71496  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4564  monooxygenase FAD-binding  53.82 
 
 
598 aa  651    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.669744 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3045  monooxygenase, FAD-binding  55.52 
 
 
600 aa  654    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000523244  unclonable  0.000000929922 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5534  monooxygenase FAD-binding  55.27 
 
 
584 aa  684    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.105639  hitchhiker  0.00000473423 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4406  monooxygenase, FAD-binding  51.74 
 
 
597 aa  625  1e-178  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.814419  normal  0.677611 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7439  2,4-dichlorophenol hydroxylase  51.81 
 
 
585 aa  627  1e-178  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1929  monooxygenase, FAD-binding  52.49 
 
 
619 aa  603  1.0000000000000001e-171  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.132935  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0227  monooxygenase FAD-binding  47.67 
 
 
596 aa  555  1e-156  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4679  monooxygenase, FAD-binding  46.47 
 
 
592 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0600734  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2460  monooxygenase FAD-binding  46.45 
 
 
595 aa  520  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0899  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase  44.29 
 
 
586 aa  514  1e-144  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.67308e-16  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09029  FAD dependent oxidoreductase, putative (JCVI)  41.03 
 
 
579 aa  448  1.0000000000000001e-124  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05044  conserved hypothetical protein  40.94 
 
 
619 aa  432  1e-119  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.163159 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2298  monooxygenase, FAD-binding  39.08 
 
 
580 aa  369  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0352446  hitchhiker  0.0088842 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06130  conserved hypothetical protein  43.66 
 
 
522 aa  354  2.9999999999999997e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442853  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2986  monooxygenase FAD-binding  36.67 
 
 
611 aa  316  6e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2185  monooxygenase, FAD-binding  33.39 
 
 
590 aa  266  5.999999999999999e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245304  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3504  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  30.39 
 
 
539 aa  248  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3518  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  29.86 
 
 
539 aa  248  3e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.054521  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3526  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  29.47 
 
 
539 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1744  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  30.61 
 
 
539 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.572505 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3271  PheA/TfdB family polyketide hydroxylase  29.74 
 
 
544 aa  242  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.654558  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4588  monooxygenase FAD-binding  31.49 
 
 
555 aa  242  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3220  monooxygenase FAD-binding  29.14 
 
 
539 aa  236  7e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.238017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3219  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  28.74 
 
 
545 aa  236  9e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5592  monooxygenase FAD-binding protein  31.33 
 
 
524 aa  229  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3304  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  28.23 
 
 
544 aa  228  3e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3520  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  28.74 
 
 
539 aa  228  3e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3564  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  28.23 
 
 
539 aa  227  5.0000000000000005e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.89711  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4156  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  32.08 
 
 
541 aa  226  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  0.0299299 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29830  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  31.97 
 
 
543 aa  224  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.832343 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0131  2,4-dichlorophenol 6-monooxygenase  32.27 
 
 
556 aa  219  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0320392  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3894  monooxygenase FAD-binding  32.16 
 
 
540 aa  212  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0436183  normal  0.0134982 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1083  monooxygenase FAD-binding  32.22 
 
 
523 aa  206  9e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213511  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4181  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  30.02 
 
 
531 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.895625  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3284  hypothetical protein  31.5 
 
 
554 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0848  hypothetical protein  26.83 
 
 
511 aa  190  5.999999999999999e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.970878  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1006  hypothetical protein  29.48 
 
 
543 aa  189  9e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4892  hypothetical protein  29.38 
 
 
564 aa  187  5e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0498261  normal  0.117948 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6338  monooxygenase FAD-binding  27.41 
 
 
504 aa  177  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3769  hypothetical protein  28.28 
 
 
564 aa  171  3e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07415  conserved hypothetical protein  28.81 
 
 
524 aa  169  2e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.300913 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0451  hypothetical protein  29.26 
 
 
617 aa  163  7e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4124  hypothetical protein  27.98 
 
 
559 aa  160  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000171711  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6165  monooxygenase FAD-binding protein  27.65 
 
 
520 aa  159  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2690  monooxygenase FAD-binding protein  27.24 
 
 
519 aa  157  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0584184 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_87314  predicted protein  30.11 
 
 
606 aa  155  2e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.002805 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7059  monooxygenase FAD-binding  28.2 
 
 
512 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.120859  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4076  hypothetical protein  28.92 
 
 
578 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165251  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2389  hypothetical protein  27.87 
 
 
557 aa  145  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08410  FAD-dependent monooxygenase (Eurofung)  27.67 
 
 
624 aa  144  5e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2333  monooxygenase FAD-binding  27.5 
 
 
536 aa  143  8e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.307173 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5061  hypothetical protein  27.5 
 
 
562 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  29.24 
 
 
537 aa  135  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  29.24 
 
 
537 aa  135  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  29.24 
 
 
537 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0143  monooxygenase FAD-binding protein  31.4 
 
 
968 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  30.96 
 
 
481 aa  132  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2129  monooxygenase FAD-binding protein  27.37 
 
 
543 aa  130  9.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.890834  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2512  monooxygenase FAD-binding  25.25 
 
 
544 aa  124  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  27.7 
 
 
546 aa  123  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3079  monooxygenase FAD-binding protein  30.21 
 
 
503 aa  121  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.0830218 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  28.68 
 
 
511 aa  122  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4133  pentachlorophenol monooxygenase  30.32 
 
 
479 aa  120  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  31.99 
 
 
501 aa  119  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0339  monooxygenase, FAD-binding  28.64 
 
 
534 aa  119  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0305956  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2227  monooxygenase FAD-binding  29.16 
 
 
552 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465072  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6800  monooxygenase FAD-binding  27.94 
 
 
518 aa  116  8.999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220979  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  29.77 
 
 
388 aa  116  8.999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1650  hypothetical protein  25.95 
 
 
502 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1624  hypothetical protein  25.95 
 
 
502 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.459087  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2328  monooxygenase FAD-binding  28.8 
 
 
480 aa  114  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.238819  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1717  hypothetical protein  25.95 
 
 
502 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.587948  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5043  monooxygenase, FAD-binding  29.16 
 
 
505 aa  114  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483306  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2377  hypothetical protein  29.62 
 
 
553 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.879652  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  27.4 
 
 
506 aa  113  9e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1544  monooxygenase, FAD-binding protein  28.01 
 
 
478 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.585572  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  29.65 
 
 
535 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1567  monooxygenase, FAD-binding  28.01 
 
 
478 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1515  monooxygenase, FAD-binding  28.53 
 
 
478 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497595  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1860  hypothetical protein  30.32 
 
 
498 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.600833 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0725  monooxygenase FAD-binding protein  30.1 
 
 
509 aa  112  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.812372  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1658  hypothetical protein  25.41 
 
 
502 aa  111  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10582  FAD binding monooxygenase, putative (JCVI)  28.01 
 
 
566 aa  110  6e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.832072  normal  0.150999 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2748  monooxygenase FAD-binding protein  30.12 
 
 
489 aa  110  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2013  monooxygenase FAD-binding  29.28 
 
 
475 aa  110  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  28.88 
 
 
529 aa  110  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4529  FAD-dependent oxidoreductase  26.4 
 
 
559 aa  110  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.609398  normal  0.38599 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4661  FAD-dependent oxidoreductase  26.4 
 
 
559 aa  110  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.135002 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1656  hypothetical protein  28.68 
 
 
508 aa  108  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.652016  normal  0.325297 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1511  monooxygenase FAD-binding  26.5 
 
 
576 aa  108  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0685394  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0750  monooxygenase FAD-binding protein  29.89 
 
 
485 aa  107  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  29.59 
 
 
475 aa  107  7e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6230  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase  29.29 
 
 
499 aa  104  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.994902  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  27.88 
 
 
414 aa  105  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  28 
 
 
537 aa  105  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.228643 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03536  FAD monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00140)  24.94 
 
 
643 aa  104  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4404  monooxygenase FAD-binding  26.13 
 
 
565 aa  104  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984317  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>