More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2298 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2298  monooxygenase, FAD-binding  100 
 
 		 580 aa  1167    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0352446  hitchhiker  0.0088842 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0227  monooxygenase FAD-binding  46.4 
 
 		 596 aa  513  1e-144  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4679  monooxygenase, FAD-binding  44.52 
 
 		 592 aa  492  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0600734  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2460  monooxygenase FAD-binding  41.91 
 
 		 595 aa  457  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4564  monooxygenase FAD-binding  41.31 
 
 		 598 aa  437  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.669744 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5534  monooxygenase FAD-binding  40.58 
 
 		 584 aa  420  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.105639  hitchhiker  0.00000473423 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4406  monooxygenase, FAD-binding  40.86 
 
 		 597 aa  420  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.814419  normal  0.677611 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7439  2,4-dichlorophenol hydroxylase  40.75 
 
 		 585 aa  410  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6462  monooxygenase, FAD-binding  40.72 
 
 		 598 aa  409  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1929  monooxygenase, FAD-binding  40.31 
 
 		 619 aa  394  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.132935  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6470  monooxygenase, FAD-binding  39.24 
 
 		 586 aa  388  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.71496  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1463  monooxygenase FAD-binding  37.26 
 
 		 598 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3045  monooxygenase, FAD-binding  39.32 
 
 		 600 aa  355  8.999999999999999e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000523244  unclonable  0.000000929922 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09029  FAD dependent oxidoreductase, putative (JCVI)  36.19 
 
 		 579 aa  352  1e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0899  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase  36.85 
 
 		 586 aa  348  1e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.67308e-16  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05044  conserved hypothetical protein  35.49 
 
 		 619 aa  327  4.0000000000000003e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.163159 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06130  conserved hypothetical protein  37.06 
 
 		 522 aa  270  5e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2986  monooxygenase FAD-binding  33.22 
 
 		 611 aa  258  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29830  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  32.53 
 
 		 543 aa  233  5e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.832343 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0131  2,4-dichlorophenol 6-monooxygenase  32.8 
 
 		 556 aa  232  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0320392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2185  monooxygenase, FAD-binding  30.96 
 
 		 590 aa  231  3e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245304  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3219  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  30.19 
 
 		 545 aa  223  7e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3304  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  30.49 
 
 		 544 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3271  PheA/TfdB family polyketide hydroxylase  30.37 
 
 		 544 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.654558  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4156  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  33.57 
 
 		 541 aa  218  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  0.0299299 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3564  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  30.49 
 
 		 539 aa  217  4e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.89711  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3520  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  30.49 
 
 		 539 aa  217  5e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4181  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  31.6 
 
 		 531 aa  216  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.895625  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3518  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  30.3 
 
 		 539 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.054521  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5592  monooxygenase FAD-binding protein  31.59 
 
 		 524 aa  215  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3504  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  30.14 
 
 		 539 aa  211  3e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3526  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  29.28 
 
 		 539 aa  210  5e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4588  monooxygenase FAD-binding  30.78 
 
 		 555 aa  208  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1744  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  28.97 
 
 		 539 aa  205  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.572505 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3894  monooxygenase FAD-binding  31.93 
 
 		 540 aa  198  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0436183  normal  0.0134982 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3220  monooxygenase FAD-binding  28.9 
 
 		 539 aa  196  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.238017  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0848  hypothetical protein  27.8 
 
 		 511 aa  193  9e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.970878  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6338  monooxygenase FAD-binding  31.34 
 
 		 504 aa  190  5.999999999999999e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1083  monooxygenase FAD-binding  31.03 
 
 		 523 aa  188  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1006  hypothetical protein  31.03 
 
 		 543 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4124  hypothetical protein  31.17 
 
 		 559 aa  180  7e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000171711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4076  hypothetical protein  29.53 
 
 		 578 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165251  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0451  hypothetical protein  31.15 
 
 		 617 aa  164  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3769  hypothetical protein  27.68 
 
 		 564 aa  163  9e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_87314  predicted protein  28.99 
 
 		 606 aa  162  1e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.002805 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3284  hypothetical protein  29.71 
 
 		 554 aa  159  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2333  monooxygenase FAD-binding  29 
 
 		 536 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.307173 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5061  hypothetical protein  28.64 
 
 		 562 aa  153  8.999999999999999e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7059  monooxygenase FAD-binding  33.61 
 
 		 512 aa  153  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.120859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6165  monooxygenase FAD-binding protein  29.36 
 
 		 520 aa  152  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08410  FAD-dependent monooxygenase (Eurofung)  27.73 
 
 		 624 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  30.81 
 
 		 537 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  30.29 
 
 		 537 aa  146  9e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  30.29 
 
 		 537 aa  146  9e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4892  hypothetical protein  26.55 
 
 		 564 aa  141  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0498261  normal  0.117948 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1860  hypothetical protein  32.35 
 
 		 498 aa  136  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.600833 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2389  hypothetical protein  26.55 
 
 		 557 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  29.72 
 
 		 506 aa  133  7.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07415  conserved hypothetical protein  29.61 
 
 		 524 aa  133  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.300913 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2111  monooxygenase, FAD-binding  32.6 
 
 		 511 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.0054618  normal  0.499354 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1511  monooxygenase FAD-binding  31.74 
 
 		 576 aa  130  9.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0685394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2690  monooxygenase FAD-binding protein  26.71 
 
 		 519 aa  129  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0584184 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  32.2 
 
 		 546 aa  126  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2129  monooxygenase FAD-binding protein  27.5 
 
 		 543 aa  125  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.890834  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  30.3 
 
 		 481 aa  123  9e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0541  hypothetical protein  32.02 
 
 		 512 aa  123  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5043  monooxygenase, FAD-binding  31.9 
 
 		 505 aa  120  7.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1656  hypothetical protein  31.61 
 
 		 508 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.652016  normal  0.325297 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9228  hypothetical protein  30.69 
 
 		 504 aa  117  6.9999999999999995e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.187294  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1535  hypothetical protein  28.57 
 
 		 487 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3372  monooxygenase FAD-binding protein  32.08 
 
 		 553 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3183  monooxygenase FAD-binding  30.75 
 
 		 511 aa  115  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0724  monooxygenase, FAD-binding  28.76 
 
 		 461 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5009  monooxygenase, FAD-binding  29.28 
 
 		 506 aa  114  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2377  hypothetical protein  29.4 
 
 		 553 aa  114  6e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.879652  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  29.04 
 
 		 529 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0339  monooxygenase, FAD-binding  28.38 
 
 		 534 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0305956  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  31.13 
 
 		 493 aa  111  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  29.41 
 
 		 511 aa  111  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4320  monooxygenase FAD-binding  26.43 
 
 		 522 aa  110  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1979  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.25 
 
 		 555 aa  110  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623617  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3079  monooxygenase FAD-binding protein  30.52 
 
 		 503 aa  110  9.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.0830218 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1544  monooxygenase, FAD-binding protein  31.66 
 
 		 478 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.585572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1567  monooxygenase, FAD-binding  31.66 
 
 		 478 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2328  monooxygenase FAD-binding  33.47 
 
 		 480 aa  108  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.238819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6800  monooxygenase FAD-binding  28.76 
 
 		 518 aa  108  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220979  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3267  monooxygenase FAD-binding  29.02 
 
 		 486 aa  107  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0725  monooxygenase FAD-binding protein  30.45 
 
 		 509 aa  108  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.812372  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  30.56 
 
 		 486 aa  107  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08592  conserved hypothetical protein  28.14 
 
 		 606 aa  107  8e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1515  monooxygenase, FAD-binding  30.16 
 
 		 478 aa  106  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497595  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0238  hypothetical protein  28.3 
 
 		 480 aa  105  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4404  monooxygenase FAD-binding  29.75 
 
 		 565 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0616  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.57 
 
 		 580 aa  105  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2324  monooxygenase FAD-binding  27.23 
 
 		 547 aa  105  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.261518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0779  monooxygenase, FAD-binding  28.3 
 
 		 500 aa  105  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.813515  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0750  monooxygenase FAD-binding protein  29.03 
 
 		 485 aa  105  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4529  FAD-dependent oxidoreductase  27.45 
 
 		 559 aa  104  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.609398  normal  0.38599 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5808  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.35 
 
 		 552 aa  104  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4661  FAD-dependent oxidoreductase  27.45 
 
 		 559 aa  104  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.135002 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>