More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1535 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1535  hypothetical protein  100 
 
 
487 aa  1011    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0238  hypothetical protein  68.21 
 
 
480 aa  691    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0238  hypothetical protein  67.16 
 
 
480 aa  684    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2907  hypothetical protein  59.96 
 
 
477 aa  594  1e-168  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08592  conserved hypothetical protein  30.14 
 
 
606 aa  190  4e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2748  monooxygenase FAD-binding protein  30.04 
 
 
489 aa  181  4e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08756  phenol monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03030)  29.32 
 
 
693 aa  168  2e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3488  phenol 2-monooxygenase  27.24 
 
 
635 aa  167  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.131796 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1342  monooxygenase FAD-binding protein  28.98 
 
 
496 aa  167  4e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  26.2 
 
 
475 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2013  monooxygenase FAD-binding  28.72 
 
 
475 aa  164  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6872  phenol 2-monooxygenase  30.29 
 
 
634 aa  164  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4133  pentachlorophenol monooxygenase  28.83 
 
 
479 aa  164  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.636421 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10084  phenol 2-monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11480)  27.9 
 
 
590 aa  163  5.0000000000000005e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.578884 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4431  monooxygenase FAD-binding protein  32.13 
 
 
474 aa  164  5.0000000000000005e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.412484 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10952  FAD monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15520)  27.91 
 
 
636 aa  162  1e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0288257 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02075  conserved hypothetical protein  28.89 
 
 
593 aa  160  4e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.855357  normal  0.760867 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1850  hypothetical protein  30.45 
 
 
497 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.790198 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10814  conserved hypothetical protein  29.43 
 
 
560 aa  160  5e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00328838  normal  0.122281 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5043  monooxygenase, FAD-binding  29.75 
 
 
505 aa  160  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483306  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03536  FAD monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00140)  26.85 
 
 
643 aa  159  8e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  29.47 
 
 
481 aa  159  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4669  hypothetical protein  29 
 
 
515 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679977  normal  0.120633 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3750  monooxygenase, FAD-binding  31.16 
 
 
511 aa  157  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0581872  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5688  phenol 2-monooxygenase  30.18 
 
 
640 aa  157  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.574447 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1498  monooxygenase, FAD-binding  26.92 
 
 
477 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.106253  normal  0.474209 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0822  phenol 2-monooxygenase  29.74 
 
 
634 aa  155  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1940  monooxygenase, FAD-binding  28.99 
 
 
489 aa  155  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  31.83 
 
 
388 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6383  phenol 2-monooxygenase  30.13 
 
 
631 aa  155  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.432328  normal  0.925531 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0473  phenol 2-monooxygenase  25.23 
 
 
693 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2512  monooxygenase FAD-binding  28.79 
 
 
544 aa  154  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08370  conserved hypothetical protein  29.91 
 
 
675 aa  153  5e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.137779 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3235  phenol 2-monooxygenase  29.21 
 
 
634 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0599  monooxygenase FAD-binding protein  29.04 
 
 
488 aa  151  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2966  FAD-dependent oxidoreductase  27.8 
 
 
548 aa  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2905  FAD-dependent oxidoreductase  27.8 
 
 
548 aa  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  27.97 
 
 
506 aa  151  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3014  oxygenase  27.8 
 
 
611 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1515  monooxygenase, FAD-binding  29.8 
 
 
478 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497595  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1649  hypothetical protein  28.63 
 
 
497 aa  150  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0750  monooxygenase FAD-binding protein  29.81 
 
 
485 aa  149  8e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1620  pentachlorophenol 4-monooxygenase; PcpB  27.91 
 
 
548 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168334  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3217  monooxygenase FAD-binding protein  28.64 
 
 
488 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0996184  hitchhiker  0.0000000987139 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2691  monooxygenase, FAD-binding  26.57 
 
 
473 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2661  monooxygenase, FAD-binding protein  26.57 
 
 
473 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2706  monooxygenase, FAD-binding  26.57 
 
 
473 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2598  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  27.59 
 
 
548 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3129  phenol 2-monooxygenase  28.91 
 
 
637 aa  148  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0606767  normal  0.39597 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0969  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  27.59 
 
 
548 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0452  pentachlorophenol 4-monooxygenase, putative  27.59 
 
 
538 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0178  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  27.59 
 
 
538 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.74497  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1544  monooxygenase, FAD-binding protein  29.86 
 
 
478 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.585572  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  30.41 
 
 
535 aa  147  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1567  monooxygenase, FAD-binding  29.86 
 
 
478 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1717  hypothetical protein  26.91 
 
 
502 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.587948  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1650  hypothetical protein  26.91 
 
 
502 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1624  hypothetical protein  26.91 
 
 
502 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.459087  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1484  hypothetical protein  27.71 
 
 
499 aa  147  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115631  normal  0.323666 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1860  hypothetical protein  26.93 
 
 
498 aa  147  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.600833 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1658  hypothetical protein  26.83 
 
 
502 aa  147  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11187  conserved hypothetical protein  27.57 
 
 
629 aa  145  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2585  monooxygenase FAD-binding protein  28.98 
 
 
479 aa  145  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  26.58 
 
 
537 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3131  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  25.52 
 
 
483 aa  145  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2368  monooxygenase FAD-binding  28.6 
 
 
549 aa  144  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128155  normal  0.778169 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  26.42 
 
 
537 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  26.42 
 
 
537 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5796  putative monooxygenase  27.2 
 
 
494 aa  144  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79596  normal  0.121142 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  26.26 
 
 
506 aa  143  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  30.35 
 
 
414 aa  143  7e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0090  hypothetical protein  28.54 
 
 
497 aa  143  7e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8211  phenol 2-monooxygenase  27.46 
 
 
648 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2162  monooxygenase FAD-binding  28.86 
 
 
477 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351168  decreased coverage  0.00237783 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  30.73 
 
 
493 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2055  monooxygenase, FAD-binding  29.88 
 
 
486 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3607  phenol 2-monooxygenase  27.85 
 
 
632 aa  141  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0161  monooxygenase FAD-binding protein  28.43 
 
 
493 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20120  phenol 2-monooxygenase  26.03 
 
 
637 aa  140  4.999999999999999e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.346431  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  31.62 
 
 
486 aa  140  7.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0962  putative monooxygenase, FAD-binding  28.69 
 
 
574 aa  139  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0576419  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0550  monooxygenase, FAD-binding  26.39 
 
 
548 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732263  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1029  monooxygenase, FAD-binding  26.39 
 
 
548 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0404  monooxygenase FAD-binding protein  28.94 
 
 
496 aa  138  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0988  monooxygenase FAD-binding  26.47 
 
 
548 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622027  normal  0.120457 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2135  monooxygenase FAD-binding  31.1 
 
 
540 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.218617  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1818  YhjG  25.1 
 
 
483 aa  137  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.214491 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0725  monooxygenase FAD-binding  29.69 
 
 
571 aa  137  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490959  normal  0.227588 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07418  phenol 2-monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13660)  33.33 
 
 
694 aa  135  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0355292 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3519  phenol 2-monooxygenase  26.7 
 
 
638 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.777145  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1216  hypothetical protein  28.4 
 
 
486 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.795806  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2328  monooxygenase FAD-binding  28.04 
 
 
480 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.238819  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3543  monooxygenase FAD-binding  29.42 
 
 
489 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3025  monooxygenase FAD-binding  28.18 
 
 
574 aa  134  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.114894  normal  0.0108713 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10582  FAD binding monooxygenase, putative (JCVI)  28.81 
 
 
566 aa  134  3e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.832072  normal  0.150999 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  27.27 
 
 
529 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4142  monooxygenase, FAD-binding  26.39 
 
 
546 aa  134  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372966  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2227  monooxygenase FAD-binding  29.11 
 
 
552 aa  134  5e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465072  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5698  monooxygenase FAD-binding  28.54 
 
 
531 aa  133  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0767168 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1656  hypothetical protein  27.24 
 
 
508 aa  133  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.652016  normal  0.325297 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>