More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0473 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6383  phenol 2-monooxygenase  60.13 
 
 
631 aa  746    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.432328  normal  0.925531 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8211  phenol 2-monooxygenase  65.69 
 
 
648 aa  762    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6872  phenol 2-monooxygenase  59.75 
 
 
634 aa  783    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3129  phenol 2-monooxygenase  55.59 
 
 
637 aa  733    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0606767  normal  0.39597 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3235  phenol 2-monooxygenase  59.38 
 
 
634 aa  761    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5688  phenol 2-monooxygenase  65.47 
 
 
640 aa  860    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.574447 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0473  phenol 2-monooxygenase  100 
 
 
693 aa  1402    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3488  phenol 2-monooxygenase  62.17 
 
 
635 aa  780    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.131796 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0822  phenol 2-monooxygenase  59.07 
 
 
634 aa  758    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3519  phenol 2-monooxygenase  50.15 
 
 
638 aa  626  1e-178  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.777145  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3607  phenol 2-monooxygenase  52.01 
 
 
632 aa  622  1e-177  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20120  phenol 2-monooxygenase  45.95 
 
 
637 aa  539  9.999999999999999e-153  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.346431  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07418  phenol 2-monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13660)  38.09 
 
 
694 aa  434  1e-120  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0355292 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10084  phenol 2-monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11480)  42.03 
 
 
590 aa  434  1e-120  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.578884 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57166  phenol 2-monooxygenase  31.73 
 
 
724 aa  336  1e-90  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.368445  normal  0.635098 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08592  conserved hypothetical protein  32.32 
 
 
606 aa  288  2e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10952  FAD monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15520)  29.89 
 
 
636 aa  277  6e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0288257 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08756  phenol monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03030)  30.69 
 
 
693 aa  273  5.000000000000001e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03536  FAD monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00140)  30.41 
 
 
643 aa  271  4e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10814  conserved hypothetical protein  29.6 
 
 
560 aa  216  8e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00328838  normal  0.122281 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11187  conserved hypothetical protein  29.13 
 
 
629 aa  179  2e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0238  hypothetical protein  29.23 
 
 
480 aa  167  4e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6800  monooxygenase FAD-binding  34.55 
 
 
518 aa  167  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220979  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2907  hypothetical protein  28.38 
 
 
477 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0238  hypothetical protein  29 
 
 
480 aa  164  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  32.89 
 
 
535 aa  164  7e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  34.55 
 
 
511 aa  162  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1535  hypothetical protein  26.03 
 
 
487 aa  152  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0550  monooxygenase, FAD-binding  31.85 
 
 
548 aa  147  9e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732263  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1029  monooxygenase, FAD-binding  31.85 
 
 
548 aa  147  9e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02075  conserved hypothetical protein  29.5 
 
 
593 aa  145  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.855357  normal  0.760867 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10582  FAD binding monooxygenase, putative (JCVI)  28.83 
 
 
566 aa  145  3e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.832072  normal  0.150999 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2227  monooxygenase FAD-binding  32.57 
 
 
552 aa  143  9e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465072  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0143  monooxygenase FAD-binding protein  32.16 
 
 
968 aa  143  9e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2324  monooxygenase FAD-binding  30.49 
 
 
547 aa  140  8.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.261518  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4142  monooxygenase, FAD-binding  31.5 
 
 
546 aa  140  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372966  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  32.05 
 
 
414 aa  139  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0988  monooxygenase FAD-binding  30.55 
 
 
548 aa  137  8e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622027  normal  0.120457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  32.49 
 
 
546 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2135  monooxygenase FAD-binding  31.33 
 
 
540 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.218617  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3750  monooxygenase, FAD-binding  27.72 
 
 
511 aa  135  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0581872  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2748  monooxygenase FAD-binding protein  29.5 
 
 
489 aa  133  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0962  putative monooxygenase, FAD-binding  29.52 
 
 
574 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0576419  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2691  monooxygenase, FAD-binding  29.16 
 
 
473 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2661  monooxygenase, FAD-binding protein  29.16 
 
 
473 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4799  monooxygenase FAD-binding  31.6 
 
 
477 aa  132  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2706  monooxygenase, FAD-binding  29.16 
 
 
473 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133137 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08370  conserved hypothetical protein  27.91 
 
 
675 aa  131  5.0000000000000004e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.137779 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  29.62 
 
 
388 aa  130  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  28.57 
 
 
537 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0905  monooxygenase FAD-binding  30.38 
 
 
550 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.147157 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3025  monooxygenase FAD-binding  29.4 
 
 
574 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.114894  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  28.57 
 
 
537 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  28.57 
 
 
537 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0724  monooxygenase, FAD-binding  30.67 
 
 
461 aa  128  3e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2377  hypothetical protein  28.81 
 
 
553 aa  127  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.879652  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  27.38 
 
 
475 aa  125  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  32.73 
 
 
493 aa  126  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0893  monooxygenase, FAD-binding  30.11 
 
 
550 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207082  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1860  hypothetical protein  30.97 
 
 
498 aa  125  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.600833 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  28.35 
 
 
529 aa  124  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3217  monooxygenase FAD-binding protein  31.23 
 
 
488 aa  124  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0996184  hitchhiker  0.0000000987139 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5676  monooxygenase, FAD-binding  31.51 
 
 
515 aa  125  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5386  monooxygenase, FAD-binding  31.51 
 
 
515 aa  125  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.416517 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5297  monooxygenase, FAD-binding protein  31.51 
 
 
515 aa  125  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.85745  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5043  monooxygenase, FAD-binding  29.13 
 
 
505 aa  124  7e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483306  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4669  hypothetical protein  28.96 
 
 
515 aa  123  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679977  normal  0.120633 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2368  monooxygenase FAD-binding  29.22 
 
 
549 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128155  normal  0.778169 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2454  regulatory proteins, IclR  26.59 
 
 
575 aa  122  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.283629  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  32.27 
 
 
486 aa  122  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3267  monooxygenase FAD-binding  32.36 
 
 
486 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4431  monooxygenase FAD-binding protein  28.03 
 
 
474 aa  120  7e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.412484 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1620  pentachlorophenol 4-monooxygenase; PcpB  30.87 
 
 
548 aa  120  9e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168334  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2512  monooxygenase FAD-binding  27.42 
 
 
544 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  31.28 
 
 
481 aa  120  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2162  monooxygenase FAD-binding  31.85 
 
 
477 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351168  decreased coverage  0.00237783 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2905  FAD-dependent oxidoreductase  31.4 
 
 
548 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2966  FAD-dependent oxidoreductase  31.4 
 
 
548 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0725  monooxygenase FAD-binding  28.2 
 
 
571 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490959  normal  0.227588 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1650  hypothetical protein  29.13 
 
 
502 aa  118  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3014  oxygenase  31.4 
 
 
611 aa  118  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0969  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  31.13 
 
 
548 aa  117  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0161  monooxygenase FAD-binding protein  30.83 
 
 
493 aa  117  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2055  monooxygenase, FAD-binding  32.27 
 
 
486 aa  117  6e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2598  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  31.13 
 
 
548 aa  117  6e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1624  hypothetical protein  29.13 
 
 
502 aa  117  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.459087  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1717  hypothetical protein  29.13 
 
 
502 aa  117  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.587948  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1498  monooxygenase, FAD-binding  27.91 
 
 
477 aa  117  8.999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.106253  normal  0.474209 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4133  pentachlorophenol monooxygenase  29.15 
 
 
479 aa  116  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0452  pentachlorophenol 4-monooxygenase, putative  30.87 
 
 
538 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0178  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  30.87 
 
 
538 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.74497  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3372  monooxygenase FAD-binding protein  29.11 
 
 
553 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2401  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.1 
 
 
569 aa  114  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5698  monooxygenase FAD-binding  28.39 
 
 
531 aa  114  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0767168 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1658  hypothetical protein  28.61 
 
 
502 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6034  monooxygenase FAD-binding protein  37.21 
 
 
489 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.829011  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0541  hypothetical protein  27.63 
 
 
512 aa  112  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  29.9 
 
 
506 aa  112  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08410  FAD-dependent monooxygenase (Eurofung)  28.19 
 
 
624 aa  111  4.0000000000000004e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2585  monooxygenase FAD-binding protein  30.95 
 
 
479 aa  111  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>