More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3488 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3235  phenol 2-monooxygenase  58.49 
 
 		 634 aa  704    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5688  phenol 2-monooxygenase  62.62 
 
 		 640 aa  780    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.574447 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6872  phenol 2-monooxygenase  57.3 
 
 		 634 aa  706    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3129  phenol 2-monooxygenase  56.63 
 
 		 637 aa  714    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0606767  normal  0.39597 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6383  phenol 2-monooxygenase  62.13 
 
 		 631 aa  742    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.432328  normal  0.925531 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3488  phenol 2-monooxygenase  100 
 
 		 635 aa  1288    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.131796 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8211  phenol 2-monooxygenase  62.88 
 
 		 648 aa  689    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0473  phenol 2-monooxygenase  62.17 
 
 		 693 aa  781    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0822  phenol 2-monooxygenase  58.96 
 
 		 634 aa  712    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3519  phenol 2-monooxygenase  51.41 
 
 		 638 aa  624  1e-177  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.777145  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3607  phenol 2-monooxygenase  51.34 
 
 		 632 aa  617  1e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20120  phenol 2-monooxygenase  47.44 
 
 		 637 aa  531  1e-149  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.346431  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07418  phenol 2-monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13660)  37.02 
 
 		 694 aa  411  1e-113  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0355292 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10084  phenol 2-monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11480)  38.62 
 
 		 590 aa  400  9.999999999999999e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.578884 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57166  phenol 2-monooxygenase  32.75 
 
 		 724 aa  350  3e-95  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.368445  normal  0.635098 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08592  conserved hypothetical protein  32.65 
 
 		 606 aa  296  9e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08756  phenol monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03030)  32.18 
 
 		 693 aa  293  6e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10952  FAD monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15520)  31.35 
 
 		 636 aa  278  3e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0288257 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03536  FAD monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00140)  30.15 
 
 		 643 aa  273  7e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10814  conserved hypothetical protein  30.02 
 
 		 560 aa  221  3e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00328838  normal  0.122281 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11187  conserved hypothetical protein  28.27 
 
 		 629 aa  177  4e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1535  hypothetical protein  28.94 
 
 		 487 aa  164  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0238  hypothetical protein  27.76 
 
 		 480 aa  162  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2907  hypothetical protein  26.92 
 
 		 477 aa  162  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0238  hypothetical protein  27.29 
 
 		 480 aa  161  3e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  35.71 
 
 		 511 aa  160  6e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  32.08 
 
 		 535 aa  152  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  33.59 
 
 		 414 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6800  monooxygenase FAD-binding  32.72 
 
 		 518 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220979  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10582  FAD binding monooxygenase, putative (JCVI)  28.76 
 
 		 566 aa  148  4.0000000000000006e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.832072  normal  0.150999 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4799  monooxygenase FAD-binding  32.92 
 
 		 477 aa  145  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02075  conserved hypothetical protein  27.23 
 
 		 593 aa  142  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.855357  normal  0.760867 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3750  monooxygenase, FAD-binding  30.53 
 
 		 511 aa  141  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0581872  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2227  monooxygenase FAD-binding  32.31 
 
 		 552 aa  140  6e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465072  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0724  monooxygenase, FAD-binding  31.55 
 
 		 461 aa  140  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2135  monooxygenase FAD-binding  30.81 
 
 		 540 aa  139  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.218617  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5676  monooxygenase, FAD-binding  31.31 
 
 		 515 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5297  monooxygenase, FAD-binding protein  31.31 
 
 		 515 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.85745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5386  monooxygenase, FAD-binding  31.31 
 
 		 515 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.416517 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  33.25 
 
 		 546 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2377  hypothetical protein  30.55 
 
 		 553 aa  134  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.879652  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0143  monooxygenase FAD-binding protein  30.59 
 
 		 968 aa  134  5e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04210  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  31.38 
 
 		 510 aa  133  7.999999999999999e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  28.94 
 
 		 529 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2966  FAD-dependent oxidoreductase  30.81 
 
 		 548 aa  132  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2905  FAD-dependent oxidoreductase  30.81 
 
 		 548 aa  132  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2512  monooxygenase FAD-binding  25.98 
 
 		 544 aa  132  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3014  oxygenase  30.81 
 
 		 611 aa  131  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5043  monooxygenase, FAD-binding  28.42 
 
 		 505 aa  131  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0962  putative monooxygenase, FAD-binding  28.1 
 
 		 574 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0576419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  28.9 
 
 		 475 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  29.76 
 
 		 481 aa  129  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2598  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  30.54 
 
 		 548 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0969  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  30.54 
 
 		 548 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2324  monooxygenase FAD-binding  30.1 
 
 		 547 aa  128  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.261518  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0452  pentachlorophenol 4-monooxygenase, putative  30.27 
 
 		 538 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0178  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  30.27 
 
 		 538 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.74497  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1860  hypothetical protein  31.05 
 
 		 498 aa  127  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.600833 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0541  hypothetical protein  28.78 
 
 		 512 aa  126  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1620  pentachlorophenol 4-monooxygenase; PcpB  29.46 
 
 		 548 aa  125  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168334  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1940  monooxygenase, FAD-binding  29.46 
 
 		 489 aa  124  7e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6034  monooxygenase FAD-binding protein  31.12 
 
 		 489 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.829011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  32.56 
 
 		 506 aa  122  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3217  monooxygenase FAD-binding protein  30.99 
 
 		 488 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0996184  hitchhiker  0.0000000987139 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08370  conserved hypothetical protein  26.4 
 
 		 675 aa  121  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.137779 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  30.08 
 
 		 493 aa  122  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5698  monooxygenase FAD-binding  29.65 
 
 		 531 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0767168 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  29 
 
 		 486 aa  120  7e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1650  hypothetical protein  27.56 
 
 		 502 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  28.2 
 
 		 537 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4142  monooxygenase, FAD-binding  29.32 
 
 		 546 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372966  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2748  monooxygenase FAD-binding protein  29.07 
 
 		 489 aa  120  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0725  monooxygenase FAD-binding  26.67 
 
 		 571 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490959  normal  0.227588 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0161  monooxygenase FAD-binding protein  30.7 
 
 		 493 aa  120  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  28.2 
 
 		 537 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4133  pentachlorophenol monooxygenase  30.15 
 
 		 479 aa  119  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3859  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.02 
 
 		 573 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  28.2 
 
 		 537 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3786  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.02 
 
 		 573 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  28.11 
 
 		 501 aa  119  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3025  monooxygenase FAD-binding  26.92 
 
 		 574 aa  118  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.114894  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3267  monooxygenase FAD-binding  28.8 
 
 		 486 aa  118  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1498  monooxygenase, FAD-binding  28.37 
 
 		 477 aa  118  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.106253  normal  0.474209 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1624  hypothetical protein  27.56 
 
 		 502 aa  118  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.459087  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4679  monooxygenase, FAD-binding  29.47 
 
 		 592 aa  118  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0600734  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1717  hypothetical protein  27.56 
 
 		 502 aa  118  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.587948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1658  hypothetical protein  27.75 
 
 		 502 aa  117  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0750  monooxygenase FAD-binding protein  29.31 
 
 		 485 aa  117  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2691  monooxygenase, FAD-binding  27.07 
 
 		 473 aa  117  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2706  monooxygenase, FAD-binding  27.07 
 
 		 473 aa  117  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2661  monooxygenase, FAD-binding protein  27.07 
 
 		 473 aa  117  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0905  monooxygenase FAD-binding  29.41 
 
 		 550 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.147157 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0227  monooxygenase FAD-binding  30.79 
 
 		 596 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  27.37 
 
 		 388 aa  116  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0550  monooxygenase, FAD-binding  28.92 
 
 		 548 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732263  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1029  monooxygenase, FAD-binding  28.92 
 
 		 548 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1850  hypothetical protein  31.22 
 
 		 497 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6230  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase  28.95 
 
 		 499 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.994902  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5796  putative monooxygenase  31.52 
 
 		 494 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79596  normal  0.121142 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3790  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.02 
 
 		 568 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829218 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>