More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5688 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3488  phenol 2-monooxygenase  62.62 
 
 		 635 aa  780    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.131796 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6872  phenol 2-monooxygenase  58.63 
 
 		 634 aa  741    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5688  phenol 2-monooxygenase  100 
 
 		 640 aa  1303    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.574447 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8211  phenol 2-monooxygenase  65.19 
 
 		 648 aa  758    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3129  phenol 2-monooxygenase  58.81 
 
 		 637 aa  773    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0606767  normal  0.39597 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0822  phenol 2-monooxygenase  58.48 
 
 		 634 aa  737    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3235  phenol 2-monooxygenase  58.48 
 
 		 634 aa  740    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6383  phenol 2-monooxygenase  60.19 
 
 		 631 aa  733    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.432328  normal  0.925531 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0473  phenol 2-monooxygenase  65.47 
 
 		 693 aa  860    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3607  phenol 2-monooxygenase  52.19 
 
 		 632 aa  631  1e-179  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3519  phenol 2-monooxygenase  50.62 
 
 		 638 aa  612  9.999999999999999e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.777145  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20120  phenol 2-monooxygenase  46.3 
 
 		 637 aa  535  1e-150  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.346431  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07418  phenol 2-monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13660)  36.4 
 
 		 694 aa  395  1e-108  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0355292 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10084  phenol 2-monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11480)  37.04 
 
 		 590 aa  390  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.578884 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57166  phenol 2-monooxygenase  29.69 
 
 		 724 aa  307  4.0000000000000004e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.368445  normal  0.635098 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08756  phenol monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03030)  31.76 
 
 		 693 aa  286  9e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08592  conserved hypothetical protein  32.23 
 
 		 606 aa  284  3.0000000000000004e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10952  FAD monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15520)  30.83 
 
 		 636 aa  269  8.999999999999999e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0288257 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03536  FAD monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00140)  29.29 
 
 		 643 aa  251  2e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10814  conserved hypothetical protein  29.11 
 
 		 560 aa  222  1.9999999999999999e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00328838  normal  0.122281 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11187  conserved hypothetical protein  29.98 
 
 		 629 aa  180  7e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0238  hypothetical protein  28.24 
 
 		 480 aa  164  6e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0238  hypothetical protein  28.74 
 
 		 480 aa  161  4e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1535  hypothetical protein  30.1 
 
 		 487 aa  157  6e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10582  FAD binding monooxygenase, putative (JCVI)  27.83 
 
 		 566 aa  153  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.832072  normal  0.150999 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  32.62 
 
 		 535 aa  152  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2907  hypothetical protein  27.42 
 
 		 477 aa  147  5e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02075  conserved hypothetical protein  26.59 
 
 		 593 aa  144  6e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.855357  normal  0.760867 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08370  conserved hypothetical protein  24.83 
 
 		 675 aa  142  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.137779 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2227  monooxygenase FAD-binding  30.31 
 
 		 552 aa  142  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465072  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6800  monooxygenase FAD-binding  31.03 
 
 		 518 aa  140  7.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220979  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0143  monooxygenase FAD-binding protein  32.32 
 
 		 968 aa  138  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  32.3 
 
 		 511 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3750  monooxygenase, FAD-binding  30.29 
 
 		 511 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0581872  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  32.1 
 
 		 414 aa  134  6e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5676  monooxygenase, FAD-binding  30.39 
 
 		 515 aa  131  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5386  monooxygenase, FAD-binding  30.39 
 
 		 515 aa  131  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.416517 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5297  monooxygenase, FAD-binding protein  30.39 
 
 		 515 aa  131  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.85745  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2135  monooxygenase FAD-binding  30.73 
 
 		 540 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.218617  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  28.94 
 
 		 529 aa  130  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2324  monooxygenase FAD-binding  29.06 
 
 		 547 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.261518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4799  monooxygenase FAD-binding  31.84 
 
 		 477 aa  128  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0724  monooxygenase, FAD-binding  31.05 
 
 		 461 aa  127  9e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1860  hypothetical protein  30.73 
 
 		 498 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.600833 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0541  hypothetical protein  27.15 
 
 		 512 aa  122  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2377  hypothetical protein  29.58 
 
 		 553 aa  122  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.879652  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6034  monooxygenase FAD-binding protein  29.46 
 
 		 489 aa  121  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.829011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5043  monooxygenase, FAD-binding  28.57 
 
 		 505 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  31.55 
 
 		 546 aa  120  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  29.62 
 
 		 537 aa  120  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1656  hypothetical protein  30.26 
 
 		 508 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.652016  normal  0.325297 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  29.62 
 
 		 537 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  29.62 
 
 		 537 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  28.13 
 
 		 493 aa  118  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1650  hypothetical protein  25.99 
 
 		 502 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5808  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.49 
 
 		 552 aa  118  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3786  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.93 
 
 		 573 aa  117  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3859  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.93 
 
 		 573 aa  117  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3790  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.97 
 
 		 568 aa  117  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4669  hypothetical protein  29.29 
 
 		 515 aa  117  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679977  normal  0.120633 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3267  monooxygenase FAD-binding  27.97 
 
 		 486 aa  117  8.999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3217  monooxygenase FAD-binding protein  30.56 
 
 		 488 aa  116  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0996184  hitchhiker  0.0000000987139 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  27.79 
 
 		 486 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4431  monooxygenase FAD-binding protein  25.93 
 
 		 474 aa  116  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.412484 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1624  hypothetical protein  25.74 
 
 		 502 aa  116  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.459087  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2512  monooxygenase FAD-binding  26.32 
 
 		 544 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  27.81 
 
 		 506 aa  115  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2055  monooxygenase, FAD-binding  29.22 
 
 		 486 aa  115  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1658  hypothetical protein  25.74 
 
 		 502 aa  115  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4679  monooxygenase, FAD-binding  28.46 
 
 		 592 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0600734  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2454  regulatory proteins, IclR  27.38 
 
 		 575 aa  114  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.283629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1717  hypothetical protein  25.74 
 
 		 502 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.587948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2162  monooxygenase FAD-binding  29.44 
 
 		 477 aa  114  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351168  decreased coverage  0.00237783 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1940  monooxygenase, FAD-binding  27.23 
 
 		 489 aa  114  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3372  monooxygenase FAD-binding protein  26.57 
 
 		 553 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1006  hypothetical protein  27.08 
 
 		 543 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  27.01 
 
 		 481 aa  112  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5698  monooxygenase FAD-binding  26.03 
 
 		 531 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0767168 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  27.27 
 
 		 475 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0725  monooxygenase FAD-binding  26.39 
 
 		 571 aa  111  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490959  normal  0.227588 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  26.68 
 
 		 388 aa  110  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0161  monooxygenase FAD-binding protein  30.61 
 
 		 493 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1484  hypothetical protein  29.53 
 
 		 499 aa  109  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115631  normal  0.323666 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2401  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.79 
 
 		 569 aa  110  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1850  hypothetical protein  29.67 
 
 		 497 aa  109  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4156  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  29.67 
 
 		 541 aa  108  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  0.0299299 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0550  monooxygenase, FAD-binding  27.03 
 
 		 548 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732263  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4406  monooxygenase, FAD-binding  27.88 
 
 		 597 aa  108  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.814419  normal  0.677611 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1029  monooxygenase, FAD-binding  27.03 
 
 		 548 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4564  monooxygenase FAD-binding  27.69 
 
 		 598 aa  107  6e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.669744 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1649  hypothetical protein  28.91 
 
 		 497 aa  107  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0962  putative monooxygenase, FAD-binding  27.27 
 
 		 574 aa  107  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0576419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0905  monooxygenase FAD-binding  27.69 
 
 		 550 aa  107  8e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.147157 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2748  monooxygenase FAD-binding protein  27.86 
 
 		 489 aa  107  9e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3769  hypothetical protein  28.93 
 
 		 564 aa  107  9e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5061  hypothetical protein  29.38 
 
 		 562 aa  107  9e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5380  FAD-dependent oxidoreductase  25.71 
 
 		 583 aa  106  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189642  normal  0.0809664 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29830  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  25.56 
 
 		 543 aa  106  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.832343 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0404  monooxygenase FAD-binding protein  28.42 
 
 		 496 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4142  monooxygenase, FAD-binding  28.19 
 
 		 546 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372966  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>