More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3129 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008687  Pden_3488  phenol 2-monooxygenase  56.63 
 
 
635 aa  714    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.131796 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5688  phenol 2-monooxygenase  58.81 
 
 
640 aa  773    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.574447 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8211  phenol 2-monooxygenase  57.55 
 
 
648 aa  681    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0822  phenol 2-monooxygenase  51.09 
 
 
634 aa  655    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6872  phenol 2-monooxygenase  49.69 
 
 
634 aa  644    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6383  phenol 2-monooxygenase  52.27 
 
 
631 aa  665    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.432328  normal  0.925531 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0473  phenol 2-monooxygenase  55.59 
 
 
693 aa  733    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3235  phenol 2-monooxygenase  50.93 
 
 
634 aa  652    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3129  phenol 2-monooxygenase  100 
 
 
637 aa  1332    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0606767  normal  0.39597 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3519  phenol 2-monooxygenase  44.88 
 
 
638 aa  549  1e-155  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.777145  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3607  phenol 2-monooxygenase  45.37 
 
 
632 aa  546  1e-154  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20120  phenol 2-monooxygenase  42.59 
 
 
637 aa  507  9.999999999999999e-143  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.346431  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07418  phenol 2-monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13660)  36.73 
 
 
694 aa  416  9.999999999999999e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0355292 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10084  phenol 2-monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11480)  37.28 
 
 
590 aa  401  9.999999999999999e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.578884 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57166  phenol 2-monooxygenase  29.36 
 
 
724 aa  321  3e-86  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.368445  normal  0.635098 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08592  conserved hypothetical protein  31.59 
 
 
606 aa  292  1e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08756  phenol monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03030)  31.25 
 
 
693 aa  283  7.000000000000001e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03536  FAD monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00140)  28.9 
 
 
643 aa  258  3e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10952  FAD monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15520)  28.82 
 
 
636 aa  243  7e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0288257 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10814  conserved hypothetical protein  27.95 
 
 
560 aa  211  2e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00328838  normal  0.122281 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11187  conserved hypothetical protein  25.77 
 
 
629 aa  184  5.0000000000000004e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02075  conserved hypothetical protein  29.79 
 
 
593 aa  170  9e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.855357  normal  0.760867 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2907  hypothetical protein  30.18 
 
 
477 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0238  hypothetical protein  28.4 
 
 
480 aa  152  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  33.33 
 
 
535 aa  151  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0238  hypothetical protein  27.93 
 
 
480 aa  150  7e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1535  hypothetical protein  28.91 
 
 
487 aa  148  4.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10582  FAD binding monooxygenase, putative (JCVI)  28.21 
 
 
566 aa  144  7e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.832072  normal  0.150999 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  29.74 
 
 
414 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3750  monooxygenase, FAD-binding  28.11 
 
 
511 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0581872  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  28.53 
 
 
529 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2227  monooxygenase FAD-binding  29.56 
 
 
552 aa  130  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465072  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2377  hypothetical protein  28.72 
 
 
553 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.879652  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5386  monooxygenase, FAD-binding  28.53 
 
 
515 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.416517 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5297  monooxygenase, FAD-binding protein  28.53 
 
 
515 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.85745  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5676  monooxygenase, FAD-binding  28.53 
 
 
515 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5043  monooxygenase, FAD-binding  26.72 
 
 
505 aa  128  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483306  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6800  monooxygenase FAD-binding  29.13 
 
 
518 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220979  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  28.32 
 
 
506 aa  125  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2135  monooxygenase FAD-binding  32.34 
 
 
540 aa  125  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.218617  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  29.79 
 
 
511 aa  125  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2512  monooxygenase FAD-binding  26.02 
 
 
544 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  28.61 
 
 
546 aa  119  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08370  conserved hypothetical protein  26.2 
 
 
675 aa  118  3.9999999999999997e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.137779 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2162  monooxygenase FAD-binding  26.48 
 
 
477 aa  118  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351168  decreased coverage  0.00237783 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1860  hypothetical protein  27.97 
 
 
498 aa  117  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.600833 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0143  monooxygenase FAD-binding protein  28.28 
 
 
968 aa  117  8.999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0724  monooxygenase, FAD-binding  28.46 
 
 
461 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3014  oxygenase  28.21 
 
 
611 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2905  FAD-dependent oxidoreductase  28.21 
 
 
548 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2966  FAD-dependent oxidoreductase  28.21 
 
 
548 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1624  hypothetical protein  27.61 
 
 
502 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.459087  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0725  monooxygenase FAD-binding  25.07 
 
 
571 aa  115  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490959  normal  0.227588 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1650  hypothetical protein  27.88 
 
 
502 aa  115  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1656  hypothetical protein  29.6 
 
 
508 aa  114  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.652016  normal  0.325297 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2389  hypothetical protein  26.52 
 
 
557 aa  114  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0452  pentachlorophenol 4-monooxygenase, putative  27.9 
 
 
538 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2598  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  27.9 
 
 
548 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2324  monooxygenase FAD-binding  26.55 
 
 
547 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.261518  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0969  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  27.9 
 
 
548 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0178  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  27.9 
 
 
538 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.74497  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  26.44 
 
 
388 aa  113  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1717  hypothetical protein  27.61 
 
 
502 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.587948  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0962  putative monooxygenase, FAD-binding  24.34 
 
 
574 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0576419  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0541  hypothetical protein  25.7 
 
 
512 aa  110  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2055  monooxygenase, FAD-binding  26.95 
 
 
486 aa  110  8.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6034  monooxygenase FAD-binding protein  28 
 
 
489 aa  109  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.829011  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5061  hypothetical protein  26.5 
 
 
562 aa  109  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4799  monooxygenase FAD-binding  27 
 
 
477 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1620  pentachlorophenol 4-monooxygenase; PcpB  27.09 
 
 
548 aa  108  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168334  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0550  monooxygenase, FAD-binding  26.06 
 
 
548 aa  108  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732263  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1029  monooxygenase, FAD-binding  26.06 
 
 
548 aa  108  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1226  FAD-dependent oxidoreductase  26.41 
 
 
588 aa  107  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0161  monooxygenase FAD-binding protein  25.46 
 
 
493 aa  107  8e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5698  monooxygenase FAD-binding  26.7 
 
 
531 aa  107  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0767168 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2401  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.09 
 
 
569 aa  107  9e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1649  hypothetical protein  28.57 
 
 
497 aa  106  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1850  hypothetical protein  29.2 
 
 
497 aa  106  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4142  monooxygenase, FAD-binding  26.58 
 
 
546 aa  106  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372966  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1484  hypothetical protein  29.44 
 
 
499 aa  106  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115631  normal  0.323666 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4156  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  28.35 
 
 
541 aa  106  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  0.0299299 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  26.15 
 
 
481 aa  106  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1342  monooxygenase FAD-binding protein  28.34 
 
 
496 aa  106  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3025  monooxygenase FAD-binding  24.87 
 
 
574 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.114894  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3217  monooxygenase FAD-binding protein  27.45 
 
 
488 aa  104  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0996184  hitchhiker  0.0000000987139 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9228  hypothetical protein  31.22 
 
 
504 aa  104  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.187294  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1658  hypothetical protein  34.62 
 
 
502 aa  104  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3372  monooxygenase FAD-binding protein  26.88 
 
 
553 aa  104  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4669  hypothetical protein  26.38 
 
 
515 aa  103  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679977  normal  0.120633 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  26.63 
 
 
486 aa  103  9e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4133  pentachlorophenol monooxygenase  28.5 
 
 
479 aa  103  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3769  hypothetical protein  25.32 
 
 
564 aa  103  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0404  monooxygenase FAD-binding protein  25.87 
 
 
496 aa  103  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4431  monooxygenase FAD-binding protein  26 
 
 
474 aa  102  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.412484 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3267  monooxygenase FAD-binding  26.58 
 
 
486 aa  102  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0090  hypothetical protein  27.62 
 
 
497 aa  102  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0988  monooxygenase FAD-binding  26.15 
 
 
548 aa  101  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622027  normal  0.120457 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2111  monooxygenase, FAD-binding  27.93 
 
 
511 aa  101  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.0054618  normal  0.499354 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2454  regulatory proteins, IclR  24.46 
 
 
575 aa  100  9e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.283629  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0905  monooxygenase FAD-binding  25.82 
 
 
550 aa  99.8  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.147157 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>