More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5061 on replicon NC_009508
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009508  Swit_4892  hypothetical protein  59.45 
 
 		 564 aa  642    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0498261  normal  0.117948 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5061  hypothetical protein  100 
 
 		 562 aa  1142    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2389  hypothetical protein  58.55 
 
 		 557 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4124  hypothetical protein  39.64 
 
 		 559 aa  374  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000171711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3769  hypothetical protein  36.06 
 
 		 564 aa  301  2e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4076  hypothetical protein  34.42 
 
 		 578 aa  292  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165251  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3284  hypothetical protein  33.03 
 
 		 554 aa  253  6e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1006  hypothetical protein  34.01 
 
 		 543 aa  252  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2333  monooxygenase FAD-binding  33.81 
 
 		 536 aa  236  7e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.307173 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0451  hypothetical protein  33.81 
 
 		 617 aa  230  5e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4564  monooxygenase FAD-binding  30.86 
 
 		 598 aa  199  7.999999999999999e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.669744 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08410  FAD-dependent monooxygenase (Eurofung)  28.39 
 
 		 624 aa  196  7e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0227  monooxygenase FAD-binding  30.15 
 
 		 596 aa  189  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0339  monooxygenase, FAD-binding  31.47 
 
 		 534 aa  189  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0305956  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29830  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  31.4 
 
 		 543 aa  187  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.832343 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1929  monooxygenase, FAD-binding  28.89 
 
 		 619 aa  184  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.132935  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4156  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  33.45 
 
 		 541 aa  177  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  0.0299299 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4406  monooxygenase, FAD-binding  27.8 
 
 		 597 aa  176  8e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.814419  normal  0.677611 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07251  conserved hypothetical protein  30.64 
 
 		 581 aa  173  6.999999999999999e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.261689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3504  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  28.07 
 
 		 539 aa  172  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3219  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  27.4 
 
 		 545 aa  172  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4679  monooxygenase, FAD-binding  27.9 
 
 		 592 aa  170  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0600734  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3518  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  26.95 
 
 		 539 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.054521  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5534  monooxygenase FAD-binding  27.36 
 
 		 584 aa  167  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.105639  hitchhiker  0.00000473423 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3271  PheA/TfdB family polyketide hydroxylase  26.42 
 
 		 544 aa  166  9e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.654558  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1744  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  27.37 
 
 		 539 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.572505 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3526  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  26.24 
 
 		 539 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0848  hypothetical protein  27.45 
 
 		 511 aa  164  5.0000000000000005e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.970878  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3520  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  27.37 
 
 		 539 aa  163  7e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3304  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  27.37 
 
 		 544 aa  162  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3564  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  27.37 
 
 		 539 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.89711  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6338  monooxygenase FAD-binding  30.49 
 
 		 504 aa  160  8e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2460  monooxygenase FAD-binding  26.57 
 
 		 595 aa  160  8e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3220  monooxygenase FAD-binding  26.81 
 
 		 539 aa  156  8e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.238017  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1463  monooxygenase FAD-binding  27.23 
 
 		 598 aa  156  9e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05044  conserved hypothetical protein  27.24 
 
 		 619 aa  152  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.163159 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6470  monooxygenase, FAD-binding  27.38 
 
 		 586 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.71496  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7439  2,4-dichlorophenol hydroxylase  27.66 
 
 		 585 aa  152  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3045  monooxygenase, FAD-binding  28.89 
 
 		 600 aa  151  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000523244  unclonable  0.000000929922 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3793  monooxygenase, FAD-binding  30.07 
 
 		 524 aa  151  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.791839  normal  0.0125936 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0899  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase  28.01 
 
 		 586 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.67308e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_87314  predicted protein  26.36 
 
 		 606 aa  146  9e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.002805 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6165  monooxygenase FAD-binding protein  30.33 
 
 		 520 aa  146  9e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5592  monooxygenase FAD-binding protein  29.67 
 
 		 524 aa  144  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2298  monooxygenase, FAD-binding  27.97 
 
 		 580 aa  144  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0352446  hitchhiker  0.0088842 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2185  monooxygenase, FAD-binding  26.89 
 
 		 590 aa  144  6e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0131  2,4-dichlorophenol 6-monooxygenase  31.08 
 
 		 556 aa  138  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0320392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3894  monooxygenase FAD-binding  30.09 
 
 		 540 aa  137  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0436183  normal  0.0134982 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5808  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.79 
 
 		 552 aa  137  7.000000000000001e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2986  monooxygenase FAD-binding  28.5 
 
 		 611 aa  136  9e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09029  FAD dependent oxidoreductase, putative (JCVI)  25.81 
 
 		 579 aa  134  3e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7059  monooxygenase FAD-binding  30.05 
 
 		 512 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.120859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1083  monooxygenase FAD-binding  30.48 
 
 		 523 aa  133  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6462  monooxygenase, FAD-binding  26.58 
 
 		 598 aa  133  9e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  30.51 
 
 		 537 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3790  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.52 
 
 		 568 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829218 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  30.49 
 
 		 537 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3786  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.52 
 
 		 573 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3859  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.52 
 
 		 573 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  30.49 
 
 		 537 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2401  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.8 
 
 		 569 aa  130  8.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1717  hypothetical protein  30.35 
 
 		 502 aa  130  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.587948  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  28.61 
 
 		 529 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1658  hypothetical protein  30.08 
 
 		 502 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1650  hypothetical protein  30.08 
 
 		 502 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1860  hypothetical protein  33.77 
 
 		 498 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.600833 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  28.75 
 
 		 511 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4181  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  27.83 
 
 		 531 aa  128  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.895625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1624  hypothetical protein  30.35 
 
 		 502 aa  128  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.459087  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2377  hypothetical protein  29.24 
 
 		 553 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.879652  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  34.39 
 
 		 481 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4588  monooxygenase FAD-binding  27.71 
 
 		 555 aa  126  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10582  FAD binding monooxygenase, putative (JCVI)  29.64 
 
 		 566 aa  125  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.832072  normal  0.150999 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4320  monooxygenase FAD-binding  29.02 
 
 		 522 aa  125  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3488  phenol 2-monooxygenase  29.79 
 
 		 635 aa  125  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.131796 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4245  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.45 
 
 		 569 aa  124  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.525028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6800  monooxygenase FAD-binding  30.77 
 
 		 518 aa  123  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220979  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  30.77 
 
 		 535 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  31.43 
 
 		 506 aa  122  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  31.25 
 
 		 537 aa  121  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6034  monooxygenase FAD-binding protein  30.75 
 
 		 489 aa  121  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.829011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0541  hypothetical protein  27.64 
 
 		 512 aa  119  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4799  monooxygenase FAD-binding  28.29 
 
 		 477 aa  118  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4747  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.91 
 
 		 574 aa  118  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  30.34 
 
 		 486 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3183  monooxygenase FAD-binding  29.03 
 
 		 511 aa  117  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1656  hypothetical protein  31.58 
 
 		 508 aa  117  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.652016  normal  0.325297 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9228  hypothetical protein  29.84 
 
 		 504 aa  117  6.9999999999999995e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.187294  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3526  monooxygenase, FAD-binding  28.55 
 
 		 586 aa  117  7.999999999999999e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.120911 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1344  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  26.56 
 
 		 561 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.430096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5043  monooxygenase, FAD-binding  29.2 
 
 		 505 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3129  phenol 2-monooxygenase  26.5 
 
 		 637 aa  116  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0606767  normal  0.39597 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  30.08 
 
 		 493 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3372  monooxygenase FAD-binding protein  33.87 
 
 		 553 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2454  regulatory proteins, IclR  26.49 
 
 		 575 aa  115  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.283629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5009  monooxygenase, FAD-binding  27.48 
 
 		 506 aa  114  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0378  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.87 
 
 		 554 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0214512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5321  FAD-dependent oxidoreductase  27.65 
 
 		 561 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124532  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2135  monooxygenase FAD-binding  31.15 
 
 		 540 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.218617  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2690  monooxygenase FAD-binding protein  27.54 
 
 		 519 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0584184 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>