More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2907 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006369  lpl0238  hypothetical protein  64.41 
 
 		 480 aa  646    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2907  hypothetical protein  100 
 
 		 477 aa  992    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0238  hypothetical protein  63.14 
 
 		 480 aa  634  1e-180  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1535  hypothetical protein  59.96 
 
 		 487 aa  587  1e-166  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08592  conserved hypothetical protein  29.33 
 
 		 606 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10952  FAD monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15520)  28.88 
 
 		 636 aa  181  2e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0288257 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6872  phenol 2-monooxygenase  31.2 
 
 		 634 aa  168  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0473  phenol 2-monooxygenase  28.38 
 
 		 693 aa  167  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  28.22 
 
 		 475 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  30.97 
 
 		 388 aa  164  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6383  phenol 2-monooxygenase  28.73 
 
 		 631 aa  163  6e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.432328  normal  0.925531 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0822  phenol 2-monooxygenase  29.87 
 
 		 634 aa  163  6e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3235  phenol 2-monooxygenase  29.33 
 
 		 634 aa  162  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3750  monooxygenase, FAD-binding  31.08 
 
 		 511 aa  162  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0581872  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3488  phenol 2-monooxygenase  26.92 
 
 		 635 aa  162  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.131796 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3607  phenol 2-monooxygenase  28.22 
 
 		 632 aa  162  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  29.98 
 
 		 481 aa  160  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3217  monooxygenase FAD-binding protein  29.08 
 
 		 488 aa  159  9e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0996184  hitchhiker  0.0000000987139 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4431  monooxygenase FAD-binding protein  29.18 
 
 		 474 aa  158  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.412484 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2748  monooxygenase FAD-binding protein  29.08 
 
 		 489 aa  159  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3519  phenol 2-monooxygenase  27.43 
 
 		 638 aa  157  4e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.777145  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10084  phenol 2-monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11480)  26 
 
 		 590 aa  155  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.578884 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  27.22 
 
 		 529 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3129  phenol 2-monooxygenase  30.18 
 
 		 637 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0606767  normal  0.39597 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08370  conserved hypothetical protein  29.34 
 
 		 675 aa  154  2.9999999999999998e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.137779 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2512  monooxygenase FAD-binding  27.9 
 
 		 544 aa  154  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08756  phenol monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03030)  26.59 
 
 		 693 aa  154  5e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8211  phenol 2-monooxygenase  28.57 
 
 		 648 aa  153  8e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20120  phenol 2-monooxygenase  26.97 
 
 		 637 aa  152  2e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.346431  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4669  hypothetical protein  31.04 
 
 		 515 aa  150  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679977  normal  0.120633 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03536  FAD monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00140)  23.52 
 
 		 643 aa  150  5e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2377  hypothetical protein  26.52 
 
 		 553 aa  150  6e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.879652  normal  0.249541 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10582  FAD binding monooxygenase, putative (JCVI)  29.71 
 
 		 566 aa  150  7e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.832072  normal  0.150999 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0750  monooxygenase FAD-binding protein  29.31 
 
 		 485 aa  149  7e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1498  monooxygenase, FAD-binding  28.33 
 
 		 477 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.106253  normal  0.474209 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6034  monooxygenase FAD-binding protein  29.4 
 
 		 489 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.829011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  27.44 
 
 		 537 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  27.44 
 
 		 537 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  27.09 
 
 		 537 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11187  conserved hypothetical protein  27.56 
 
 		 629 aa  148  3e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4133  pentachlorophenol monooxygenase  29.57 
 
 		 479 aa  147  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5688  phenol 2-monooxygenase  27.42 
 
 		 640 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.574447 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02075  conserved hypothetical protein  29.18 
 
 		 593 aa  147  5e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.855357  normal  0.760867 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2013  monooxygenase FAD-binding  28.87 
 
 		 475 aa  146  6e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10814  conserved hypothetical protein  26.68 
 
 		 560 aa  145  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00328838  normal  0.122281 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  30.23 
 
 		 535 aa  145  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5009  monooxygenase, FAD-binding  25.9 
 
 		 506 aa  144  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5796  putative monooxygenase  28.54 
 
 		 494 aa  143  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79596  normal  0.121142 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4320  monooxygenase FAD-binding  27.46 
 
 		 522 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2661  monooxygenase, FAD-binding protein  25.98 
 
 		 473 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2691  monooxygenase, FAD-binding  25.98 
 
 		 473 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2706  monooxygenase, FAD-binding  25.98 
 
 		 473 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  24.69 
 
 		 501 aa  140  6e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0724  monooxygenase, FAD-binding  29.94 
 
 		 461 aa  139  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1484  hypothetical protein  27.16 
 
 		 499 aa  139  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115631  normal  0.323666 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  26 
 
 		 506 aa  139  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1342  monooxygenase FAD-binding protein  26.9 
 
 		 496 aa  137  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5676  monooxygenase, FAD-binding  27.85 
 
 		 515 aa  137  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5297  monooxygenase, FAD-binding protein  27.85 
 
 		 515 aa  137  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.85745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5386  monooxygenase, FAD-binding  27.85 
 
 		 515 aa  137  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.416517 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  27.12 
 
 		 414 aa  136  9e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5698  monooxygenase FAD-binding  25.98 
 
 		 531 aa  136  9e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0767168 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1940  monooxygenase, FAD-binding  27.65 
 
 		 489 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1860  hypothetical protein  26.82 
 
 		 498 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.600833 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2324  monooxygenase FAD-binding  26.84 
 
 		 547 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.261518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2135  monooxygenase FAD-binding  28.57 
 
 		 540 aa  134  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.218617  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  26.94 
 
 		 506 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1850  hypothetical protein  26.88 
 
 		 497 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0779  monooxygenase, FAD-binding  25.05 
 
 		 500 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.813515  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  29.48 
 
 		 511 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3131  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  26.43 
 
 		 483 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3025  monooxygenase FAD-binding  27.67 
 
 		 574 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.114894  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0599  monooxygenase FAD-binding protein  25.4 
 
 		 488 aa  131  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5043  monooxygenase, FAD-binding  27.77 
 
 		 505 aa  131  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0090  hypothetical protein  26.73 
 
 		 497 aa  130  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1649  hypothetical protein  25.98 
 
 		 497 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0962  putative monooxygenase, FAD-binding  27.47 
 
 		 574 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0576419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3183  monooxygenase FAD-binding  25.5 
 
 		 511 aa  130  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2454  regulatory proteins, IclR  29.92 
 
 		 575 aa  129  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.283629  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07418  phenol 2-monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13660)  27.49 
 
 		 694 aa  128  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0355292 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3014  oxygenase  27.54 
 
 		 611 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2227  monooxygenase FAD-binding  26.53 
 
 		 552 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465072  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2162  monooxygenase FAD-binding  26.75 
 
 		 477 aa  127  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351168  decreased coverage  0.00237783 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2966  FAD-dependent oxidoreductase  27.54 
 
 		 548 aa  128  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2905  FAD-dependent oxidoreductase  27.54 
 
 		 548 aa  128  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2055  monooxygenase, FAD-binding  28.16 
 
 		 486 aa  127  6e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0452  pentachlorophenol 4-monooxygenase, putative  27.25 
 
 		 538 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2368  monooxygenase FAD-binding  28.45 
 
 		 549 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128155  normal  0.778169 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0178  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  27.25 
 
 		 538 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.74497  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4799  monooxygenase FAD-binding  26.96 
 
 		 477 aa  126  8.000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  29.63 
 
 		 493 aa  126  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0161  monooxygenase FAD-binding protein  26.39 
 
 		 493 aa  125  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2598  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  27.25 
 
 		 548 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0969  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  27.25 
 
 		 548 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6800  monooxygenase FAD-binding  28.86 
 
 		 518 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220979  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1818  YhjG  26.12 
 
 		 483 aa  124  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.214491 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0550  monooxygenase, FAD-binding  24.28 
 
 		 548 aa  124  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732263  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1029  monooxygenase, FAD-binding  24.28 
 
 		 548 aa  124  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0725  monooxygenase FAD-binding  26.84 
 
 		 571 aa  123  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490959  normal  0.227588 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0143  monooxygenase FAD-binding protein  27.27 
 
 		 968 aa  123  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>