More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0905 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0905  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 
550 aa  1088    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.147157 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0452  pentachlorophenol 4-monooxygenase, putative  72.04 
 
 
538 aa  736    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0988  monooxygenase FAD-binding  88.02 
 
 
548 aa  966    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622027  normal  0.120457 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3025  monooxygenase FAD-binding  63.51 
 
 
574 aa  709    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.114894  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2905  FAD-dependent oxidoreductase  72.18 
 
 
548 aa  749    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3014  oxygenase  72.18 
 
 
611 aa  748    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4142  monooxygenase, FAD-binding  88.02 
 
 
546 aa  936    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372966  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1620  pentachlorophenol 4-monooxygenase; PcpB  71.74 
 
 
548 aa  746    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168334  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2368  monooxygenase FAD-binding  84.57 
 
 
549 aa  918    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128155  normal  0.778169 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0962  putative monooxygenase, FAD-binding  64.81 
 
 
574 aa  718    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0576419  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0725  monooxygenase FAD-binding  61.88 
 
 
571 aa  681    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490959  normal  0.227588 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0550  monooxygenase, FAD-binding  87.66 
 
 
548 aa  963    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732263  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0178  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  72.04 
 
 
538 aa  736    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.74497  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0893  monooxygenase, FAD-binding  99.27 
 
 
550 aa  1079    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207082  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0969  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  71.82 
 
 
548 aa  744    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2966  FAD-dependent oxidoreductase  72.18 
 
 
548 aa  749    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2598  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  71.82 
 
 
548 aa  744    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1029  monooxygenase, FAD-binding  87.66 
 
 
548 aa  963    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2512  monooxygenase FAD-binding  34.67 
 
 
544 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3267  monooxygenase FAD-binding  44.02 
 
 
486 aa  287  4e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  43.63 
 
 
493 aa  277  3e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  43.84 
 
 
486 aa  277  4e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  40.97 
 
 
414 aa  253  7e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3750  monooxygenase, FAD-binding  34.97 
 
 
511 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0581872  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  35.33 
 
 
535 aa  241  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0724  monooxygenase, FAD-binding  37.47 
 
 
461 aa  237  5.0000000000000005e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0750  monooxygenase FAD-binding protein  34.59 
 
 
485 aa  233  7.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1515  monooxygenase, FAD-binding  38.52 
 
 
478 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497595  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1544  monooxygenase, FAD-binding protein  38.01 
 
 
478 aa  226  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.585572  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  37.8 
 
 
481 aa  226  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1567  monooxygenase, FAD-binding  38.01 
 
 
478 aa  226  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2227  monooxygenase FAD-binding  34.35 
 
 
552 aa  225  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465072  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  35.85 
 
 
501 aa  222  9.999999999999999e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4133  pentachlorophenol monooxygenase  36.79 
 
 
479 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2585  monooxygenase FAD-binding protein  37.59 
 
 
479 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2162  monooxygenase FAD-binding  37.11 
 
 
477 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351168  decreased coverage  0.00237783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  37.14 
 
 
388 aa  215  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2135  monooxygenase FAD-binding  37.15 
 
 
540 aa  213  7e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.218617  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0161  monooxygenase FAD-binding protein  37.25 
 
 
493 aa  212  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  35.73 
 
 
511 aa  211  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3079  monooxygenase FAD-binding protein  38.77 
 
 
503 aa  210  4e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.0830218 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2324  monooxygenase FAD-binding  31.99 
 
 
547 aa  211  4e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.261518  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  33.63 
 
 
537 aa  210  7e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5043  monooxygenase, FAD-binding  33.46 
 
 
505 aa  209  8e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483306  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6800  monooxygenase FAD-binding  36.82 
 
 
518 aa  209  9e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220979  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1216  hypothetical protein  37.82 
 
 
486 aa  209  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.795806  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1649  hypothetical protein  34.62 
 
 
497 aa  209  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2055  monooxygenase, FAD-binding  36.47 
 
 
486 aa  207  3e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0143  monooxygenase FAD-binding protein  33.04 
 
 
968 aa  207  4e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  33.21 
 
 
537 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  33.21 
 
 
537 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3183  monooxygenase FAD-binding  37.06 
 
 
511 aa  207  6e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2377  hypothetical protein  33.03 
 
 
553 aa  205  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.879652  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  35.85 
 
 
546 aa  203  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2454  regulatory proteins, IclR  30.11 
 
 
575 aa  203  7e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.283629  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1850  hypothetical protein  33.94 
 
 
497 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  33.83 
 
 
529 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2111  monooxygenase, FAD-binding  37.95 
 
 
511 aa  199  7.999999999999999e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.0054618  normal  0.499354 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4799  monooxygenase FAD-binding  34.87 
 
 
477 aa  199  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1940  monooxygenase, FAD-binding  30.68 
 
 
489 aa  197  3e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4669  hypothetical protein  35.55 
 
 
515 aa  196  8.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679977  normal  0.120633 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10582  FAD binding monooxygenase, putative (JCVI)  28.31 
 
 
566 aa  195  2e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.832072  normal  0.150999 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5698  monooxygenase FAD-binding  32.82 
 
 
531 aa  195  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0767168 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2748  monooxygenase FAD-binding protein  38.36 
 
 
489 aa  194  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2691  monooxygenase, FAD-binding  36.34 
 
 
473 aa  194  4e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0090  hypothetical protein  33.7 
 
 
497 aa  194  4e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2661  monooxygenase, FAD-binding protein  36.34 
 
 
473 aa  194  4e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2706  monooxygenase, FAD-binding  36.34 
 
 
473 aa  194  4e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1498  monooxygenase, FAD-binding  35.81 
 
 
477 aa  192  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.106253  normal  0.474209 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4431  monooxygenase FAD-binding protein  34.02 
 
 
474 aa  192  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.412484 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5796  putative monooxygenase  39.71 
 
 
494 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79596  normal  0.121142 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1342  monooxygenase FAD-binding protein  34.56 
 
 
496 aa  192  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0779  monooxygenase, FAD-binding  34.91 
 
 
500 aa  191  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.813515  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  35.7 
 
 
475 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3372  monooxygenase FAD-binding protein  37.4 
 
 
553 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6034  monooxygenase FAD-binding protein  37.28 
 
 
489 aa  190  7e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.829011  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5009  monooxygenase, FAD-binding  37.13 
 
 
506 aa  189  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0599  monooxygenase FAD-binding protein  33.58 
 
 
488 aa  189  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1818  YhjG  28.52 
 
 
483 aa  189  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.214491 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2013  monooxygenase FAD-binding  36.44 
 
 
475 aa  188  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  39.37 
 
 
506 aa  186  8e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  33.58 
 
 
506 aa  185  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4661  FAD-dependent oxidoreductase  33.15 
 
 
559 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.135002 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4529  FAD-dependent oxidoreductase  33.15 
 
 
559 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.609398  normal  0.38599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2328  monooxygenase FAD-binding  35.34 
 
 
480 aa  182  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.238819  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1484  hypothetical protein  31.62 
 
 
499 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115631  normal  0.323666 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3217  monooxygenase FAD-binding protein  33.94 
 
 
488 aa  179  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0996184  hitchhiker  0.0000000987139 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0291  FAD-dependent oxidoreductase  31.54 
 
 
545 aa  178  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339644  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3131  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  27.47 
 
 
483 aa  179  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0334  FAD-dependent oxidoreductase  31.67 
 
 
553 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0817  FAD-dependent oxidoreductase  31.67 
 
 
553 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2566  FAD-dependent oxidoreductase  31.99 
 
 
555 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0786  FAD-dependent oxidoreductase  31.35 
 
 
553 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3543  monooxygenase FAD-binding  31.23 
 
 
489 aa  175  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1860  hypothetical protein  31.26 
 
 
498 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.600833 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4320  monooxygenase FAD-binding  30.29 
 
 
522 aa  173  6.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04210  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  37.5 
 
 
510 aa  172  9e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0715  FAD-dependent oxidoreductase  32.35 
 
 
558 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.520934  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5676  monooxygenase, FAD-binding  34.66 
 
 
515 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0698  FAD-dependent oxidoreductase  32.35 
 
 
555 aa  171  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>